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公开(公告)号:CN115975904B
公开(公告)日:2025-02-28
申请号:CN202211622537.2
申请日:2022-12-16
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04 , C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种适用于拟南芥叶片组织同时提取细胞核和外泌体及测序的方法,包括配置试剂、样品处理、细胞核悬液制备、外泌体纯化。本发明所述方法填补了植物界这一技术空白,促进了植物外泌体的研究及单细胞核测序技术在植物组织中的应用,是植物研究领域一大技术突破。
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公开(公告)号:CN114015752B
公开(公告)日:2023-08-22
申请号:CN202111248805.4
申请日:2021-10-26
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种小鼠视网膜组织单细胞测序细胞核悬液的制备方法,所述方法包括:配置细胞核裂解液、细胞核洗涤缓冲液、碘克沙醇‑蔗糖溶液1、碘克沙醇‑蔗糖溶液2,并置于冰上预冷;将小鼠视网膜冰冻组织取出至置于冰上的培养皿中,用预冷的PBS洗涤后,转移至离心管中;离心管埋于冰中,加入细胞核裂解液,使用电动匀浆破碎组织并孵育;使用细胞筛进行过滤至新的离心管中,离心弃上清;使用碘克沙醇‑蔗糖溶液进行密度梯度离心;向细胞核沉淀中加入细胞核洗涤缓冲液,离心弃上清;用细胞核洗涤缓冲液重悬沉淀,吸取单细胞核进行镜检细胞核浓度、细胞核碎片比例及细胞核结团比例。本发明还公开了上述制备方法在单细胞转录组测序中的应用。
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公开(公告)号:CN113604539B
公开(公告)日:2023-07-14
申请号:CN202110901060.0
申请日:2021-08-06
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞测序的低温解离试剂盒,所述试剂盒包括酶解液、酶解缓冲液1、酶解缓冲液2。本发明还公开了所述试剂盒在单细胞测序中的应用。本发明提供的适用于单细胞测序的低温解离试剂盒将有力的促进低温解离的开展和广泛应用,进一步提升单细胞测序数据质量。本发明提供的试剂盒成分可以直接使用,操作人员不需要再进行解离液的配置;提升效率的同时,使操作步骤实现“标准化”,更有利于避免因为人为配置带来的操作误差,提升数据质量。
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公开(公告)号:CN113717922B
公开(公告)日:2022-10-25
申请号:CN202111067441.X
申请日:2021-09-13
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种转录抑制剂,所述转录抑制剂包含茴香霉素、雷公藤内酯和BMH‑21。本发明还公开了一种含转录抑制剂的酶解液,其包含酶解液和所述的转录抑制剂。本发明还公开了一种含转录抑制剂的试剂盒,所述试剂盒包括含转录抑制剂的酶解液、含转录抑制剂的W5缓冲液和含转录抑制剂的WI缓冲液。本发明还公开了所述转录抑制剂/含转录抑制剂的酶解液/试剂盒在酶解拟南芥细胞中的应用。本发明公开的试剂盒在解离过程中抑制人为或外界因素所导致的转录变化,使植物样本在解离过程中转录模式不会发生变化,结果更加准确可靠,保证测序结果真实稳定。
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公开(公告)号:CN113717922A
公开(公告)日:2021-11-30
申请号:CN202111067441.X
申请日:2021-09-13
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种转录抑制剂,所述转录抑制剂包含茴香霉素、雷公藤内酯和BMH‑21。本发明还公开了一种含转录抑制剂的酶解液,其包含酶解液和所述的转录抑制剂。本发明还公开了一种含转录抑制剂的试剂盒,所述试剂盒包括含转录抑制剂的酶解液、含转录抑制剂的W5缓冲液和含转录抑制剂的WI缓冲液。本发明还公开了所述转录抑制剂/含转录抑制剂的酶解液/试剂盒在酶解拟南芥细胞中的应用。本发明公开的试剂盒在解离过程中抑制人为或外界因素所导致的转录变化,使植物样本在解离过程中转录模式不会发生变化,结果更加准确可靠,保证测序结果真实稳定。
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公开(公告)号:CN111709219A
公开(公告)日:2020-09-25
申请号:CN202010349145.8
申请日:2020-04-28
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/169 , G06F40/174 , G06F40/18 , G06F40/166 , G06T11/40 , G16B45/00 , G06F16/81
Abstract: 本发明提供了单组学及多组学KEGG PATHWAY map表达热图个性化展示的方法及应用,在多组学联合的KEGG PATHWAY map中,通过颜色标尺以及元素填充色、元素图形展现等方式同时批量呈现各组学元素在各KEGG PATHWAY map中的表达、差异水平及其显著性。基于此发明,可以对KEGG PATHWAY map在单组学,多组学范围内进行拓展,可批量处理、可个性化修改,可从转录、蛋白和代谢中单一组学到多组学以不同尺度不同形式清晰具体展示其中元素的表达及显著性。
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公开(公告)号:CN111354418A
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN202010057500.4
申请日:2020-01-19
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明提出了一种基于参考基因组注释文件的高通量测序技术动物tRFs数据分析方法,包括文件准备步骤、tRNA数据库整理步骤、GO、KEGG背景文件整理步骤、下机数据质控步骤、参考基因组比对步骤、tRFs比对注释步骤、差异tRFs分析步骤、靶基因预测及富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面,包含涉及到的tRFs分析内容以及其靶基因预测,GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示;自动整理所有分析结果,每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计,可视化,以及逻辑化归类整理,结果文件可直接用于生成网页版报告;所有操作步骤可以溯源,方便错误查询,如果分析报错,会有对应的报错日志信息。
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公开(公告)号:CN111353283A
公开(公告)日:2020-06-30
申请号:CN202010057492.3
申请日:2020-01-19
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: G06F40/174 , G06F40/186 , G06F8/38
Abstract: 本发明提出了一种自动化报告生成方法,实现高度统一的报告输出,强化了风格统一类型。生成网页报告的同时,自动化生成word报告,word报告中自动插入链接,自动生成文档目录。生成的网页报告仅保存为单一文件,所以数据均存储在文件中,统一呈现,避免显示错误。网页报告中充满了各种交互式操作内容,可以非常方便客户进行结果查看。本发明还提出了一种自动化报告生成系统。
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公开(公告)号:CN111197086A
公开(公告)日:2020-05-26
申请号:CN202010192809.4
申请日:2020-03-18
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及一种基于三代测序的FMR1的检测引物、体系及方法,包括使用自主设计的引物进行扩增,加入扩增增强剂,选用特定的扩增条件等等。本发明降低了FMR1扩增的难度,可同时检测基因型,三代测序检测全长,CGG重复的检出更精确。
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公开(公告)号:CN110904141A
公开(公告)日:2020-03-24
申请号:CN201811090668.4
申请日:2018-09-17
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种高通量研究水稻转录因子的方法,涉及分子生物学与生物化学领域,方法包括将水稻中的1800个转录因子基因序列通过在合适的位点设计引物并用PCR将目标序列扩增出来,扩增产物通过同源重组方法连接进入酵母双杂交的AD载体PGADT7,构建成功的AD载体通过大肠杆菌进行扩繁、抽提并测序鉴定,鉴定正确的载体转入酵母Y187菌株,生成最终的水稻转录因子文库。本发明为对水稻转录因子进行高通量一对一的筛选的方式提供可行性,所得的阳性质粒无需再进行后续一对一验证及测序,简化了工作流程,提高了水稻转录因子的研究效率。
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