一种适用于单细胞测序的小鼠视网膜冰冻组织细胞核悬液及其制备方法和应用

    公开(公告)号:CN114015752B

    公开(公告)日:2023-08-22

    申请号:CN202111248805.4

    申请日:2021-10-26

    Abstract: 本发明公开了一种小鼠视网膜组织单细胞测序细胞核悬液的制备方法,所述方法包括:配置细胞核裂解液、细胞核洗涤缓冲液、碘克沙醇‑蔗糖溶液1、碘克沙醇‑蔗糖溶液2,并置于冰上预冷;将小鼠视网膜冰冻组织取出至置于冰上的培养皿中,用预冷的PBS洗涤后,转移至离心管中;离心管埋于冰中,加入细胞核裂解液,使用电动匀浆破碎组织并孵育;使用细胞筛进行过滤至新的离心管中,离心弃上清;使用碘克沙醇‑蔗糖溶液进行密度梯度离心;向细胞核沉淀中加入细胞核洗涤缓冲液,离心弃上清;用细胞核洗涤缓冲液重悬沉淀,吸取单细胞核进行镜检细胞核浓度、细胞核碎片比例及细胞核结团比例。本发明还公开了上述制备方法在单细胞转录组测序中的应用。

    一种适用于单细胞测序的低温解离试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN113604539B

    公开(公告)日:2023-07-14

    申请号:CN202110901060.0

    申请日:2021-08-06

    Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞测序的低温解离试剂盒,所述试剂盒包括酶解液、酶解缓冲液1、酶解缓冲液2。本发明还公开了所述试剂盒在单细胞测序中的应用。本发明提供的适用于单细胞测序的低温解离试剂盒将有力的促进低温解离的开展和广泛应用,进一步提升单细胞测序数据质量。本发明提供的试剂盒成分可以直接使用,操作人员不需要再进行解离液的配置;提升效率的同时,使操作步骤实现“标准化”,更有利于避免因为人为配置带来的操作误差,提升数据质量。

    基于参考基因组注释文件的高通量测序技术动物tRFs数据分析方法

    公开(公告)号:CN111354418A

    公开(公告)日:2020-06-30

    申请号:CN202010057500.4

    申请日:2020-01-19

    Abstract: 本发明提出了一种基于参考基因组注释文件的高通量测序技术动物tRFs数据分析方法,包括文件准备步骤、tRNA数据库整理步骤、GO、KEGG背景文件整理步骤、下机数据质控步骤、参考基因组比对步骤、tRFs比对注释步骤、差异tRFs分析步骤、靶基因预测及富集分析步骤、网页版报告整理步骤。本发明结果全面,包含涉及到的tRFs分析内容以及其靶基因预测,GO、KEGG富集分析以及对应的可视化展示;自动整理所有分析结果,每一步分析完成之后自动对结果进行汇总统计,可视化,以及逻辑化归类整理,结果文件可直接用于生成网页版报告;所有操作步骤可以溯源,方便错误查询,如果分析报错,会有对应的报错日志信息。

    一种高通量研究水稻转录因子的方法

    公开(公告)号:CN110904141A

    公开(公告)日:2020-03-24

    申请号:CN201811090668.4

    申请日:2018-09-17

    Abstract: 本发明公开了一种高通量研究水稻转录因子的方法,涉及分子生物学与生物化学领域,方法包括将水稻中的1800个转录因子基因序列通过在合适的位点设计引物并用PCR将目标序列扩增出来,扩增产物通过同源重组方法连接进入酵母双杂交的AD载体PGADT7,构建成功的AD载体通过大肠杆菌进行扩繁、抽提并测序鉴定,鉴定正确的载体转入酵母Y187菌株,生成最终的水稻转录因子文库。本发明为对水稻转录因子进行高通量一对一的筛选的方式提供可行性,所得的阳性质粒无需再进行后续一对一验证及测序,简化了工作流程,提高了水稻转录因子的研究效率。

Patent Agency Ranking