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公开(公告)号:CN117448424A
公开(公告)日:2024-01-26
申请号:CN202311611970.0
申请日:2023-11-29
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞全转录组测序的建库方法,所述方法包括细胞核预处理和生成单细胞全转录组文库步骤。本发明还公开了一种试剂盒,及所述试剂盒在细胞核固定、在细胞核单细胞全转录组建库中的应用。本发明提出的建库方法填补了目前技术空白,目前尚缺少单细胞全转录组的测序技术;解决了现有技术中对于样本限制,本发明的技术方案以固定的细胞核作为实验材料,允许样本复杂性,有效提高样本利用率;操作流程简单,成本低廉,本发明提供的技术方案不依赖于复杂的仪器设备,全程是移液操作,实现了能够以低廉成本进行单细胞测序,有望实现单细胞测序技术平民化,有力促进单细胞测序技术发展,推动了单细胞在生命科学领域的研究。
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公开(公告)号:CN115976172A
公开(公告)日:2023-04-18
申请号:CN202211482201.0
申请日:2022-11-24
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6844 , C12Q1/6869
Abstract: 一种中性粒细胞标志基因集和提高低丰度基因检出率的cDNA扩增方法。本发明公开了一种针对人‑全血中性粒细胞的标志基因集(MarkerGeneSet),所述基因集包括33个中性粒细胞标志基因及相应的引物池序列,可以有效帮助鉴定细胞类型;本发明还针对中性粒细胞标志基因集公开了一种cDNA线性扩增方法,在一定程度上能很好的富集目的基因片段,且能提高单细胞转录组灵敏度、避免扩增偏差和错误,改善了后续单细胞测序过程中部分标志基因丢失进而导致的细胞类型丢失的状况。
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公开(公告)号:CN115612720B
公开(公告)日:2025-03-14
申请号:CN202211189716.1
申请日:2022-09-28
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞测序的猕猴桃根组织细胞核的制备方法,通过独创的裂解液配方和细胞核悬液优化方法制备得到细胞核质量很高。与现有技术中6~7种组分的裂解液配方相比,本发明裂解液配方显著减少;实验流程在30分钟内即可完成细胞核的制备。本发明所述方法避免蔗糖沉积等步骤,节约试剂、耗材,降低成本,同时大大缩短时间,提高效率,便于大量样本实验的开展。本发明还公开了一种KR裂解液,试剂/试剂盒及其在制备适用于单细胞测序的猕猴桃根组织细胞核的方法中的应用。
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公开(公告)号:CN115992086A
公开(公告)日:2023-04-21
申请号:CN202211484254.6
申请日:2022-11-24
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/071 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种从同一肝内胆管组织样本出发,基于同一组织样本同时进行外泌体、单细胞悬液和单细胞核悬液的制备方法。本发明所述的方法可以在同一份样本中得到更多有意义的数据,挖掘到更深层次的生物学信息,从而解析出生物现象背后这个网络最关键的一个动态机制。本发明创新改进地将外泌体制备、单细胞悬液制备和单细胞核悬液制备三种技术相结合,突破了现有的技术障碍,得到样本中更全面的细胞类型的同时,又真正解析了生命现象背后这种细胞互作的网络机制(既能了解单个细胞的功能,又能了解细胞之间是如何传递信号的以及特定的细胞对信号会有什么响应。)从而丰富了研究数据,为挖掘更深层次的生物学机理提供了基础。
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公开(公告)号:CN113717922B
公开(公告)日:2022-10-25
申请号:CN202111067441.X
申请日:2021-09-13
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种转录抑制剂,所述转录抑制剂包含茴香霉素、雷公藤内酯和BMH‑21。本发明还公开了一种含转录抑制剂的酶解液,其包含酶解液和所述的转录抑制剂。本发明还公开了一种含转录抑制剂的试剂盒,所述试剂盒包括含转录抑制剂的酶解液、含转录抑制剂的W5缓冲液和含转录抑制剂的WI缓冲液。本发明还公开了所述转录抑制剂/含转录抑制剂的酶解液/试剂盒在酶解拟南芥细胞中的应用。本发明公开的试剂盒在解离过程中抑制人为或外界因素所导致的转录变化,使植物样本在解离过程中转录模式不会发生变化,结果更加准确可靠,保证测序结果真实稳定。
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公开(公告)号:CN114058564A
公开(公告)日:2022-02-18
申请号:CN202111263878.0
申请日:2021-10-27
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种适用于酶解艾草叶片组织的酶解液,所述酶解液包括酶解液A和YF缓冲液,所述酶解液A中含有2%(m/v)纤维素酶R‑10、0.4%(m/v)离析酶R‑10、0.1~1%(m/v)果胶酶、1~3%(m/v)半纤维素酶、0.45~0.55mol/L甘露醇、20mM MES、20mM KCl、10mM CaCl2、0.1%(v/v)BSA,溶解于超纯水中;所述YF溶液中含有20mM MES、20mM KCl、0.1%(v/v)BSA、0.5mol/L甘露醇、1~3%(m/v)聚乙烯吡咯烷酮PVP‑40,溶于超纯水中。本发明还公开了上述酶解液在制备艾草叶片组织原生质体中的应用,所述制备方法包括配置酶解液、样本预处理、酶解、过滤、离心、洗涤原生质体沉淀、镜检原生质体活性。本发明还公开了上述制备方法制备获得的艾草叶片组织原生质体在单细胞转录组测序中的应用。
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公开(公告)号:CN113717922A
公开(公告)日:2021-11-30
申请号:CN202111067441.X
申请日:2021-09-13
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/04 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种转录抑制剂,所述转录抑制剂包含茴香霉素、雷公藤内酯和BMH‑21。本发明还公开了一种含转录抑制剂的酶解液,其包含酶解液和所述的转录抑制剂。本发明还公开了一种含转录抑制剂的试剂盒,所述试剂盒包括含转录抑制剂的酶解液、含转录抑制剂的W5缓冲液和含转录抑制剂的WI缓冲液。本发明还公开了所述转录抑制剂/含转录抑制剂的酶解液/试剂盒在酶解拟南芥细胞中的应用。本发明公开的试剂盒在解离过程中抑制人为或外界因素所导致的转录变化,使植物样本在解离过程中转录模式不会发生变化,结果更加准确可靠,保证测序结果真实稳定。
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公开(公告)号:CN119913240A
公开(公告)日:2025-05-02
申请号:CN202311427348.4
申请日:2023-10-31
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明提出了一种适用于烟草叶柄组织的空间全转录测序方法和应用。本发明方法中,采用适用于烟草叶柄的组织包埋方法、冷冻切片方法,有效保证烟草叶柄切片均匀平整,维持结构完整;采用适用于植物组织透化前的预处理液,可有效酶解植物组织细胞壁并增加细胞膜通透性,使RNA更好释放;采用适用于烟草叶柄组织原位聚腺苷酸化的处理方法,可有效对切片样本中非编码RNA进行原位聚腺苷酸化,提高非编码RNA的捕获效率;采用适用于空间全转录组测序流程的可从cDNA文库中去除rRNA的方法,可有效通过湿实验端从文库中去除rRNA,避免由于捕获核糖体RNA量过高而导致其他RNA种类的测序深度降低,极大提高数据利用率。本发明具有广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN115074309B
公开(公告)日:2024-05-28
申请号:CN202210722601.8
申请日:2022-06-24
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12N5/071 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明首次创新公开了一种在同一小鼠肾脏样本中同时进行单细胞悬液和单细胞核悬液制备、同时进行单细胞测序和单细胞核测序的方法。本发明还公开用于前述方法中的试剂盒。本发明填补现有技术空白,获取样本中更全面的细胞类型,为挖掘更深层次生物学机理提供了新的技术方案,具有广泛应用前景。
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公开(公告)号:CN115612720A
公开(公告)日:2023-01-17
申请号:CN202211189716.1
申请日:2022-09-28
Applicant: 上海欧易生物医学科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞测序的猕猴桃根组织细胞核的制备方法,通过独创的裂解液配方和细胞核悬液优化方法制备得到细胞核质量很高。与现有技术中6~7种组分的裂解液配方相比,本发明裂解液配方显著减少;实验流程在30分钟内即可完成细胞核的制备。本发明所述方法避免蔗糖沉积等步骤,节约试剂、耗材,降低成本,同时大大缩短时间,提高效率,便于大量样本实验的开展。本发明还公开了一种KR裂解液,试剂/试剂盒及其在制备适用于单细胞测序的猕猴桃根组织细胞核的方法中的应用。
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