一种适用于单细胞核全转录组测序的建库方法、试剂盒及应用

    公开(公告)号:CN117448424A

    公开(公告)日:2024-01-26

    申请号:CN202311611970.0

    申请日:2023-11-29

    Abstract: 本发明公开了一种适用于单细胞全转录组测序的建库方法,所述方法包括细胞核预处理和生成单细胞全转录组文库步骤。本发明还公开了一种试剂盒,及所述试剂盒在细胞核固定、在细胞核单细胞全转录组建库中的应用。本发明提出的建库方法填补了目前技术空白,目前尚缺少单细胞全转录组的测序技术;解决了现有技术中对于样本限制,本发明的技术方案以固定的细胞核作为实验材料,允许样本复杂性,有效提高样本利用率;操作流程简单,成本低廉,本发明提供的技术方案不依赖于复杂的仪器设备,全程是移液操作,实现了能够以低廉成本进行单细胞测序,有望实现单细胞测序技术平民化,有力促进单细胞测序技术发展,推动了单细胞在生命科学领域的研究。

    一种在同一肝内胆管组织样本中同时进行外泌体、单细胞、单细胞核测序的方法

    公开(公告)号:CN115992086A

    公开(公告)日:2023-04-21

    申请号:CN202211484254.6

    申请日:2022-11-24

    Abstract: 本发明公开了一种从同一肝内胆管组织样本出发,基于同一组织样本同时进行外泌体、单细胞悬液和单细胞核悬液的制备方法。本发明所述的方法可以在同一份样本中得到更多有意义的数据,挖掘到更深层次的生物学信息,从而解析出生物现象背后这个网络最关键的一个动态机制。本发明创新改进地将外泌体制备、单细胞悬液制备和单细胞核悬液制备三种技术相结合,突破了现有的技术障碍,得到样本中更全面的细胞类型的同时,又真正解析了生命现象背后这种细胞互作的网络机制(既能了解单个细胞的功能,又能了解细胞之间是如何传递信号的以及特定的细胞对信号会有什么响应。)从而丰富了研究数据,为挖掘更深层次的生物学机理提供了基础。

    一种适用于烟草叶柄组织的空间全转录测序方法及应用

    公开(公告)号:CN119913240A

    公开(公告)日:2025-05-02

    申请号:CN202311427348.4

    申请日:2023-10-31

    Abstract: 本发明提出了一种适用于烟草叶柄组织的空间全转录测序方法和应用。本发明方法中,采用适用于烟草叶柄的组织包埋方法、冷冻切片方法,有效保证烟草叶柄切片均匀平整,维持结构完整;采用适用于植物组织透化前的预处理液,可有效酶解植物组织细胞壁并增加细胞膜通透性,使RNA更好释放;采用适用于烟草叶柄组织原位聚腺苷酸化的处理方法,可有效对切片样本中非编码RNA进行原位聚腺苷酸化,提高非编码RNA的捕获效率;采用适用于空间全转录组测序流程的可从cDNA文库中去除rRNA的方法,可有效通过湿实验端从文库中去除rRNA,避免由于捕获核糖体RNA量过高而导致其他RNA种类的测序深度降低,极大提高数据利用率。本发明具有广泛应用前景。

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