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公开(公告)号:CN117576085A
公开(公告)日:2024-02-20
申请号:CN202410037266.7
申请日:2024-01-10
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻悦生物科技江苏有限公司
Abstract: 本发明公开一种基于全局莫兰指数的结肠癌预后预测方法及系统,获取结肠癌组织样品切片的全切片数字图像,所述结肠癌组织样品切片经染色及荧光免疫标记处理;提取数字图像中核心肿瘤区域中所有细胞的坐标,以及每个细胞的荧光强度值,并预设阳性阈值,筛选出超过阳性阈值的荧光强度值;基于筛选出的荧光强度值及对应的坐标值计算核心肿瘤区域的莫兰指数;获取莫兰指数的最佳截断值,基于最佳截断值将样品划分至不同风险组。本发明的量化指标考虑了整个肿瘤区域内的T细胞分布情况,同时顾及T细胞表达量的影响,指标覆盖的信息更全面,为评估结肠癌患者的预后提供新的指标和方法。
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公开(公告)号:CN116913380A
公开(公告)日:2023-10-20
申请号:CN202311168288.9
申请日:2023-09-12
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 武汉臻和医学检验实验室有限公司
Abstract: 本发明提供了一种晚期肿瘤ctDNA动态变化判定方法及装置,属于医学检测技术领域。包括接收晚期肿瘤治前血浆和配对的血细胞的测序数据,构建肿瘤患者治疗前血浆个性化变异图谱;根据血浆变异图谱追踪治疗后血浆的变异信号;基于临床治疗前后突变位点的变异频率以及测序深度定量权重,评估治疗对位点变异频率变化的贡献度,降低测序和分析造成波动的影响,对晚期患者治疗前后血浆ctDNA的变化进行更准确的定量,评估患者对治疗方式是否响应。计算所述的装置、存储介质及设备均是基于所述的方法实现。本发明能够更准确地对晚期肿瘤ctDNA动态变化进行判定,可有效提高对晚期肿瘤患者进行疗效评估的精准度。
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公开(公告)号:CN116287279A
公开(公告)日:2023-06-23
申请号:CN202310595127.1
申请日:2023-05-25
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
IPC: C12Q1/6886 , G16B40/20 , G16B25/10 , G16H50/30
Abstract: 本申请公开了一种用于检测胰腺癌的生物标志物及其应用,属于医学检测技术领域。该生物标志物是肿瘤特异甲基化连锁区域组合中至少一个区域,该甲基化连锁区域的甲基化结果,如该区域内甲基化片段占比,即覆盖甲基化连锁区域中发生甲基化的片段数与覆盖该区域所有片段数的比例,在健康人群和胰腺癌的患者中具有显著差异,该生物标志物结合本申请提供的胰腺癌风险评估模型,可以有效检测胰腺癌。还可以将甲基化连锁区域组合中至少一个区域中甲基化结果与蛋白组合物CA19‑9和NSE联合作为生物标志物,可以有效检测胰腺癌。
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公开(公告)号:CN114898802B
公开(公告)日:2022-09-30
申请号:CN202210824046.X
申请日:2022-07-14
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种基于血浆cfDNA甲基化测序数据的末端序列频率分布特征确定方法、评价方法及装置,包括:接收待确定血浆样本的cfDNA甲基化测序数据;与参考基因组进行比对,得到测序Reads的比对位置信息;基于比对位置信息,得到cfDNA甲基化测序数据中血浆cfDNA片段的5’末端在参考基因组上的准确位置;对测序Reads进行过滤;截取FLAG等于163的Reads中血浆cfDNA片段的5’末端的4或6个碱基序列作为末端序列;统计血浆样本中每种末端序列占所有末端序列的比例,得到血浆样本末端序列的频率分布特征。其对末端序列频率分布特征进行确定为后续评价提供基础,提高检测灵敏度。
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公开(公告)号:CN112766428B
公开(公告)日:2021-07-02
申请号:CN202110374936.0
申请日:2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质,其中,方法包括:获取多个肿瘤组织样本的测序数据,并计算拷贝数数值;筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因;对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别;筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别;基于拷贝数变异计算第一主成分,并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响;根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值,并根据该值对各样本类别的样本进行分类,完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型,分辨率高、分型精准,且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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公开(公告)号:CN112766428A
公开(公告)日:2021-05-07
申请号:CN202110374936.0
申请日:2021-04-08
Applicant: 臻和(北京)生物科技有限公司 , 臻和精准医学检验实验室无锡有限公司
Abstract: 本发明提供了一种肿瘤分子分型方法及装置、终端设备及可读存储介质,其中,方法包括:获取多个肿瘤组织样本的测序数据,并计算拷贝数数值;筛选各肿瘤组织样本中发生变异的基因;对发生变异的基因进行无监督聚类得到多个样本类别;筛选各样本类别样本间基因拷贝数变异显著的基因并无监督聚类得到多个基因类别;基于拷贝数变异计算第一主成分,并通过回归分析确定第一主成分对患者预后的影响;根据第一主成分对患者预后的影响计算各肿瘤组织样本的拷贝数变异分值,并根据该值对各样本类别的样本进行分类,完成对肿瘤的分子分型。其基于每个基因的拷贝数变异进行分子分型,分辨率高、分型精准,且可以显著区分不同分子分型肿瘤患者的预后。
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