公开(公告)号：CN113025527A

公开(公告)日：2021-06-25

申请号：CN202110320992.6

申请日：2021-03-25

Applicant: 上海市第十人民医院

Inventor： 杨蓉 ,  秦环龙 ,  黄林生 ,  毕德玺

IPC: C12N1/20 ,  C12N1/02 ,  C12Q1/6883 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/14 ,  C12R1/46

Abstract: 本发明提供了一种用来预测婴幼儿肥胖病的乳源性唾液链球菌及其分离方法。该乳源性唾液链球菌的为唾液链球菌菌株SHDP5A1，其16SrRNA基因序列如SEQ ID NO:1所示，分类命名为Streptococcus salivarius，保藏编号为CCTCCNO:M 2021060，保藏日期为2021年01月14日，保藏单位为中国典型培养物保藏中心，保藏单位地址为中国武汉市武汉大学。本发明提供的一种用来预测婴幼儿肥胖病的乳源性唾液链球菌作为兼性厌氧菌，容易在在肠道中进行定植，为后期肠道菌群的成熟和稳定创造条件，因此通过对生命早期唾液链球菌的丰度检测可实现对子代肥胖的预测。

公开(公告)号：CN112980975A

公开(公告)日：2021-06-18

申请号：CN202110250360.7

申请日：2021-03-08

Applicant: 上海市第十人民医院

Inventor： 秦环龙 ,  蔚青 ,  毕德玺 ,  朱崟

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明涉及生物医药技术领域，具体涉及一种具核梭杆菌的亚种检测和鉴定方法。具核梭杆菌与多种疾病密切关联，近期研究表明其可促进结直肠肿瘤发生发展。但目前还缺乏一种精确、直观的检测方法用来区别具核梭杆菌的不同亚种。具核梭杆菌不同亚种在生物学特性、定植及致病能力上均存在差异，因此精确的亚种鉴定对于了解其致病机制具有深远意义。本发明提供了一组用于鉴定具核梭杆菌亚种的特异性DNA序列，并设计了相应的检测引物，阐述了其在亚种水平检测和鉴定具核梭杆菌的应用。该发明可促进揭示病灶中具核梭杆菌的亚种构成及来源，将有助于探究不同亚种与疾病间的关系，及相关流行病学特征。

公开(公告)号：CN112410242A

公开(公告)日：2021-02-26

申请号：CN202010865347.8

申请日：2020-08-25

Applicant: 上海市第十人民医院

Inventor： 秦环龙 ,  蔚青 ,  朱慧媛 ,  毕德玺

IPC: C12N1/20 ,  A61K35/74 ,  A61P35/00 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明一株分离自直肠癌肿瘤组织的狄氏副拟杆菌株及其应用，该狄氏副拟杆菌株命名为DXBHYZ1，分类命名为Parabacteroides distasonis，于2020年06月19日保藏于中国典型培养物保藏中心，其保藏编号为CCTCC NO：M 2020223。目前已报道的用于研究的狄氏副拟杆菌菌株为在代谢综合征表型减轻的小鼠盲肠中分离出的CGMCC1.30169，而非从结直肠癌肿瘤组织中分离获得，其在抑制结直肠癌发生发展的相关研究中并不能充分代表肠道狄氏副拟杆菌的生物学特性。而本发明的狄氏副拟杆菌株DXBHYZ1直接来源于直肠癌肿瘤组织，在进行一系列肠癌相关的体内内外实验时更能反应真实性并更具代表性。

公开(公告)号：CN111254186A

公开(公告)日：2020-06-09

申请号：CN202010246901.4

申请日：2020-03-31

Applicant: 上海市第十人民医院

Inventor： 毕德玺 ,  秦环龙 ,  蔚青 ,  朱崟 ,  张扬

IPC: C12Q1/6851 ,  C12Q1/689 ,  C12Q1/06

Abstract: 本发明提供了一种对梭杆菌进行分子检测或对其菌种水平分类鉴定的方法，以rpoB基因作为梭杆菌的检测和分类鉴定靶标，其包括如下步骤：对样本的基因进行扩增；对扩增子进行高通量测序和比对分析序列，所得数据按100％一致性建立OTU；将上述OTU序列与梭杆菌全基因组中的特征序列片段所对应的序列比对，剔除无相似性的非特异OTU序列后，共同建立进化树，按进化关系注释各OTU对应的菌种，实现样本中梭杆菌群体的分类鉴定，以及不同菌种的丰度定量。本发明结合高通量测序技术，对特异性引物扩增后所得的扩增子序列进行测定，通过构建进化树的方法对样本中的梭杆菌菌种甚至亚种进行鉴别，有助于揭示微生态样本中梭杆菌属的菌种水平结构组成。

公开(公告)号：CN110903997A

公开(公告)日：2020-03-24

申请号：CN201911013460.7

申请日：2019-10-23

Applicant: 上海市第十人民医院

Inventor： 秦环龙 ,  蔚青 ,  毕德玺

IPC: C12N1/20 ,  C12N5/09 ,  C12R1/01

Abstract: 本发明提供了一株从大肠癌肿瘤组织中获取的不属于已知的具核梭杆菌亚种的具核梭杆菌THCT14E2，该菌株的16SrRNA基因序列具体如SEQ ID NO:1所示。THCT14E2的分类命名为Fusobacterium nucleatum，其保藏编号为CCTCC NO：M 2019361，保藏日期为2019年05月17日，保藏单位为中国典型培养物保藏中心。结直肠癌细胞系与THCT14E2共培养的结果说明THCT14E2可显著促进结直肠癌细胞增殖，因此，THCT14E2可促进了解结直肠癌微生态的多样性，将有助于结直肠癌来源的具核梭杆菌的功能研究。