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公开(公告)号：CN109023537B
公开(公告)日：2021-10-08
申请号：CN201811025369.2
申请日：2018-09-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术。具体地，本发明方法包括步骤：(a)提供DNA片段和辅助核酸片段；(b)向DNA片段和辅助核酸片段两端添加接头；(c)用特异性抗体捕获、富集末端带有接头的DNA片段和辅助核酸片段；(d)用特异性酶去除所述辅助核酸片段；(e)用特异性引物对所述步骤(c)中捕获、富集的DNA片段和辅助核酸片段进行扩增，从而获得扩增产物。本发明方法更适用于少量来源的微量样品的文库构建；文库质量好，无污染；成本较低，具有较高的普遍适用性。
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公开(公告)号：CN111254192A
公开(公告)日：2020-06-09
申请号：CN202010124590.4
申请日：2020-02-27
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供了一种DNA甲基化标志物LPCAT1在制备诊断PCOS试剂盒中的应用，属于生物医药技术领域。本发明首次发现相对于正常组织，LPCAT1基因的表达水平和启动子区DNA甲基化水平在PCOS患者卵巢颗粒细胞中呈现显著性差异，可作为PCOS相关的生物标志物，开发为PCOS诊断检测试剂盒；本发明还通过检测卵巢颗粒细胞样品中的，LPCAT1基因的表达水平和启动子区DNA甲基化水平，可以快速、准确及清楚的确定PCOS的发生。
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公开(公告)号：CN110747269A
公开(公告)日：2020-02-04
申请号：CN201911023570.1
申请日：2019-10-25
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6883
Abstract: 本发明涉及一种用于PCOS诊断的颗粒细胞生物标志物及其筛选方法和诊断试剂盒，采用RNA-seq、miRNA-seq与MBD-seq技术联合分析的方法，在全基因组范围内筛选PCOS相关生物标志物，并发现了新的诊断标志物。标志物包括miR-429，miR-141-3p，和miR-126-3p；和/或，XIAP基因，BRD3基因，MAPK14基因和SLC7A5基因。与现有技术相比，本发明具有检测灵敏性和精确度高等优点。
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公开(公告)号：CN109825559A
公开(公告)日：2019-05-31
申请号：CN201910180935.5
申请日：2019-03-11
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明公开了一种血浆cfDNA全局性甲基化检测方法及应用，涉及生物检测技术领域，其中，所述血浆cfDNA全局性甲基化检测方法为在从血浆中提取出的少量cfDNA中补加甲基化且含有生物素标记的外源DNA(λDNA)，然后进行富集甲基化实验，将收集的产物通过PCR扩增后，再基于生物素-链霉亲和素反应、采用链霉亲和素磁珠去除带有生物素标记的λDNA，得到cfDNA扩增文库，并进行高通量测序。本发明适用于少量的血浆cfDNA甲基化分析，无需特定地商品化试剂盒，操作简便高效，减少了样品的损失、提高了建库效率、且极大地提高了MeDIP等富集甲基化实验方法地检测灵敏性，具有较广泛的适用性。
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公开(公告)号：CN109097439A
公开(公告)日：2018-12-28
申请号：CN201811024725.9
申请日：2018-09-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6804
Abstract: 本发明提供了一种检测少量样品全基因组DNA甲基化的方法。具体地，本发明的方法包括步骤：(a)提供DNA片段；(b)在所述DNA片段两端添加接头；(c)向所述末端带有接头的DNA中加入辅助核酸片段，形成第一混合物；(d)将所述第一混合物进行热变性，使双链DNA成为单链DNA，形成第二混合物；(e)用特异性抗体对所述第二混合物中甲基化的核酸片段进行捕获；(f)用特异性引物对被捕获的核酸片段进行扩增，从而获得含有甲基化的核酸片段的扩增产物。本发明的方法适用于极少量来源样品的甲基化核酸测序分析，而且成本较低，具有很高的普遍适用性。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109023537A
公开(公告)日：2018-12-18
申请号：CN201811025369.2
申请日：2018-09-04
Applicant: 上海交通大学
IPC: C40B50/06
CPC classification number: C40B50/06
Abstract: 本发明提供了一种微量DNA样品高通量测序文库的构建技术。具体地，本发明方法包括步骤：(a)提供DNA片段和辅助核酸片段；(b)向DNA片段和辅助核酸片段两端添加接头；(c)用特异性抗体捕获、富集末端带有接头的DNA片段和辅助核酸片段；(d)用特异性酶去除所述辅助核酸片段；(e)用特异性引物对所述步骤(c)中捕获、富集的DNA片段和辅助核酸片段进行扩增，从而获得扩增产物。本发明方法更适用于少量来源的微量样品的文库构建；文库质量好，无污染；成本较低，具有较高的普遍适用性。
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公开(公告)号：CN105902561A
公开(公告)日：2016-08-31
申请号：CN201610378853.8
申请日：2016-05-31
Applicant: 上海交通大学
IPC: A61K31/715 , A61K36/04 , A61P35/00 , A61K31/337 , A61K31/513 , A61K33/24 , A61K31/519
CPC classification number: A61K31/715 , A61K31/337 , A61K31/513 , A61K31/519 , A61K33/24 , A61K36/04 , A61K2300/00
Abstract: 本发明提供了一种龙须菜多糖的应用以及含有龙须菜多糖的抗肿瘤药物，该应用为龙须菜多糖作为增效剂在抗肿瘤药物制备中的应用，该抗肿瘤药物包含有龙须菜多糖增效剂、抗肿瘤活性成分以及药学上可接受的辅料。本发明首次发现海藻龙须菜多糖与化疗药紫杉醇、氟尿嘧啶、甲氨蝶呤和顺铂等联合使用可以增加化疗药治疗肿瘤的效果。龙须菜多糖与化疗药联用对于多个不同组织来源的肿瘤细胞具有抑制肿瘤增殖和活性的作用，包括肺癌、胃癌和宫颈癌等，龙须菜多糖对化疗药的增效作用呈剂量依赖性，且龙须菜多糖体外细胞实验中工作浓度未见毒性，具有药源丰富、安全无毒的特征，可开发为用于抗肿瘤化疗药增效剂的抗肿瘤药物或预防保健品，具有临床应用前景。
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公开(公告)号：CN115651973B
公开(公告)日：2023-09-29
申请号：CN202211093343.8
申请日：2022-09-08
Applicant: 苏州京脉生物科技有限公司 , 上海交通大学
IPC: C12Q1/6869 , G16B40/00 , G16B30/00
Abstract: 本申请提供一种可传代细胞的高保真甲基化位点的分离与分析方法，包括步骤：(A)将可传代细胞进行传代培养多代后，取不同代数的细胞进行基因组DNA提取，作为实验样本；(B)将spike‑in加入实验样本中，进行重亚硫酸盐转化，构建简并代表性重亚硫酸盐测序文库，并进行测序；所述spike‑in为甲基化和未甲基化的lambda DNA；(C)对于测序数据，根据spike‑in计算转化效率和错误转化率最终对甲基化水平的评估产生偏差，并且对每个位点的DNA甲基化水平采用二项分布近似贝叶斯模型进行定量检测，通过比较不同代别的甲基化水平得到高保真甲基化位点。
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公开(公告)号：CN116106540A
公开(公告)日：2023-05-12
申请号：CN202310145143.0
申请日：2023-02-21
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N33/535 , G01N33/569 , G01N23/223 , G01N21/78 , G01N33/58
Abstract: 本发明提供了一种用于生物大组织高分辨率成像的标记方法，具体的，本发明提供了一种对组织样本进行均匀可控性免疫标记的方法。本发明的方法可同时解决特异性标记、大尺度样本均匀标记和反差强度可控三个问题，实现对生物大组织高分辨率成像的特定结构标记。
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公开(公告)号：CN108796039B
公开(公告)日：2021-10-08
申请号：CN201810697732.9
申请日：2018-06-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开了一种用于DNA甲基化检测的试剂盒，其至少包括生物素标记的甲基化的λ‑DNA和链霉素包被的磁珠。还公开了该试剂盒在少量DNA样品甲基化检测中的应用，样品量可低至1ng。本发明还公开了一种DNA甲基化检测的方法及其应用。本发明提供的技术方案显著降低了DNA甲基化检测所需的最低起始样品量，且不需要特定的试剂盒和实验设备，节省成本，具有较高的普适性。在富集甲基化DNA的同时不引入外源DNA污染，若采取文库构建和高通量测序的检测方法时不会受到外源DNA信息的影响，有利于进一步降低测序成本，提高数据质量。
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