-
公开(公告)号:CN119108043A
公开(公告)日:2024-12-10
申请号:CN202311103791.6
申请日:2023-08-30
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
Abstract: 本发明公开了一种基于中药活性化合物结构‑疾病靶点‑信号通路多层次整合的方法,涉及中药组分靶点预测领域,包括如下步骤:S1、获取中药活性化合物的结构式;S2、绘制步骤S1中检索到的结构式,另存为sdf格式,并将sdf格式转化为smiles格式;S3、将结构式导入靶标数据库预测中药活性化合物潜在靶点;S4、针对目标疾病,找到疾病相关的hub基因,即目标疾病靶点;S5、使用网络药理学对S3中获得的中药活性化合物潜在靶点和S4中得到的目标疾病靶点进行共有基因分析,得到共有靶点;S6、通过分子对接找到中药活性化合物的化学结构与共有靶点结合位点,筛选出最关键hub基因;S7、对最关键hub基因进行富集分析,预测白及多糖结构‑疾病靶点‑信号通路。
-
公开(公告)号:CN114566218B
公开(公告)日:2022-10-25
申请号:CN202210259820.7
申请日:2022-03-16
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明公开一种快速筛选人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的方法,包括如下步骤:下载人类最新基因组序列和对应的注释文件,以及人源hsa‑miR‑576‑3p序列文件;从下载的人类最新基因组序列中提取人类最新基因组序列的染色体长度,并由此从人类最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列;通过seedVicious软件筛选人源hsa‑miR‑576‑3p序列与S2提取的启动子序列,保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类,获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件,在计算机上实现快速对人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的筛选。
-
公开(公告)号:CN115011685A
公开(公告)日:2022-09-06
申请号:CN202210650896.2
申请日:2022-06-09
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/113
Abstract: 本发明公开了一种与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络,通过对正常组、慢性不可预测温和应激组和CUMS+豆腐果苷组大鼠海马组织进行全转录组RNA测序,对测序结果进行差异lncRNAs和mRNAs表达分析,筛选差异表达的关键基因;通过对lncRNA靶基因和差异表达基因进行GO和KEGG的富集化分析得到关键基因及其相关的lncRNAs,使用TargetScan和miRanda数据库预测与lncRNAs及其mRNAs有结合可能性及结合位点的miRNAs;通过分子生物学技术验证与豆腐果苷抗抑郁作用显著相关的内源竞争RNA调控网络:lncRNA‑Gnl3l/miR‑128‑3p/Prim1。该调控网络在抑郁症发生发展中具有重要的作用,通过探索抗抑郁药对该ceRNA网络的调控,对于抑郁症的早期诊断工具的开发、靶向药物的开发等方面具有重要的应用意义。
-
公开(公告)号:CN113332324A
公开(公告)日:2021-09-03
申请号:CN202110693038.1
申请日:2021-06-22
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: A61K36/42 , A61P35/00 , G16B15/30 , G16H70/40 , A61K31/4188
Abstract: 本发明公开一种中药罗汉果在制备防治胶质母细胞瘤产品中的应用、一种中药罗汉果在逆转胶质母细胞瘤替莫唑胺耐药性产品中的应用及一种网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制的方法,本发明通过网络药理学探索中药罗汉果治疗胶质母细胞瘤的作用机制,预测罗汉果中化合物和GBM中的罗汉果靶标DEGs具有较高的结合效率,通过抑制罗汉果靶标DEGs表达的途径逆转TMZ耐药性,从而实现调控胶质母细胞瘤细胞的功能。
-
-
-