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公开(公告)号：CN114566218B
公开(公告)日：2022-10-25
申请号：CN202210259820.7
申请日：2022-03-16
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明公开一种快速筛选人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的方法，包括如下步骤：下载人类最新基因组序列和对应的注释文件，以及人源hsa‑miR‑576‑3p序列文件；从下载的人类最新基因组序列中提取人类最新基因组序列的染色体长度，并由此从人类最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列；通过seedVicious软件筛选人源hsa‑miR‑576‑3p序列与S2提取的启动子序列，保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类，获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件，在计算机上实现快速对人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的筛选。
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公开(公告)号：CN114550821A
公开(公告)日：2022-05-27
申请号：CN202210261235.0
申请日：2022-03-16
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明公开一种快速筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的方法，包括如下步骤：下载小鼠最新基因组序列和对应的注释文件，以及小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列文件；从下载的小鼠最新基因组序列中提取小鼠最新基因组序列的染色体长度，并由此从小鼠最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列；通过seedVicious软件筛选小鼠mmu‑miR‑25‑3p序列与S2提取的启动子序列，保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类，获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件，在计算机上实现快速对小鼠mmu‑miR‑25‑3p与启动子结合靶点的筛选。
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公开(公告)号：CN114566218A
公开(公告)日：2022-05-31
申请号：CN202210259820.7
申请日：2022-03-16
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
IPC: G16B20/30
Abstract: 本发明公开一种快速筛选人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的方法，包括如下步骤：下载人类最新基因组序列和对应的注释文件，以及人源hsa‑miR‑576‑3p序列文件；从下载的人类最新基因组序列中提取人类最新基因组序列的染色体长度，并由此从人类最新基因组序列和对应的注释文件中提取启动子的序列；通过seedVicious软件筛选人源hsa‑miR‑576‑3p序列与S2提取的启动子序列，保留与miRNA种子序列完全匹配靶标的种类，获得mmu‑miR‑25‑3p与启动子靶标的预测结果。本发明利用现有数据和软件，在计算机上实现快速对人源hsa‑miR‑576‑3p与启动子结合靶点的筛选。
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公开(公告)号：CN114550815A
公开(公告)日：2022-05-27
申请号：CN202210261225.7
申请日：2022-03-16
Applicant: 皖南医学院第一附属医院(皖南医学院弋矶山医院)
Abstract: 本发明公开一种胶质母细胞瘤lncRNA编码微肽的功能预测与筛选方法，包括如下骤：葡萄糖转运体基因集的筛选；葡萄糖转运体基因集在泛癌中的显著差异表达及生存分析；胶质母细胞瘤中SLC2A10的验证及ceRNA预测；进行LINC02381编码对微肽预测，并将预测的微肽定位到人类染色体中，对预测到微肽进行鉴定与功能富集分析，保留与LINC02381同染色体的且预测有潜在功能的微肽。本发明提供一种胶质母细胞瘤lncRNA编码微肽的功能预测与筛选方法，为研究胶质母细胞瘤中的lncRNA编码的微肽在预后或诊断中起到的作用提供基础。
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