东乡绿壳蛋鸡基因组SNP分子标记的筛选方法及其应用

    公开(公告)号:CN109295238A

    公开(公告)日:2019-02-01

    申请号:CN201811298608.1

    申请日:2018-11-01

    IPC分类号: C12Q1/6888 C12Q1/6869

    摘要: 本发明涉及遗传学领域,具体而言,提供了一种东乡绿壳蛋鸡基因组SNP分子标记的筛选方法及其应用。该筛选方法包括:通过高通量测序检测,然后计算遗传统计量,再分析东乡绿壳蛋鸡与其他鸡种群体的遗传差异,最后筛选出东乡绿壳蛋鸡SNP分子标记。该筛选方法具有高效快速筛选出东乡绿壳蛋鸡分子标记的技术效果,筛选得到东乡绿壳蛋鸡的受选择基因作为鉴定东乡绿壳蛋鸡种质的分子标记,成本低,数据量丰富,检测精度高,缓解了目前东乡绿壳蛋鸡遗传分化鉴定中缺少高效的分子生物学方法和遗传标记导致的遗传分化研究成本高精确度低的技术问题,其应用缓解了东乡绿壳蛋鸡的遗传分化研究中缺少高效的分子生物学标记的技术问题。

    一种鉴定天津猴鸡品种的分子标记组合及其应用

    公开(公告)号:CN116426647A

    公开(公告)日:2023-07-14

    申请号:CN202310228225.1

    申请日:2023-03-10

    摘要: 本发明公开了一种鉴定天津猴鸡品种的分子标记组合及其应用,涉及分子生物学检测领域。该分子标记组合包括核苷酸序列分别如SEQ ID NO.1‑19所示的分子标记。本发明基于包括天津猴鸡在内的25个代表性中国地方鸡种和2个引进品种的大规模群体,鉴定特异性SNPs位点,筛选出鉴定天津猴鸡的分子标记,结合现有特异性SNP位点的检测方法和AHP层次分析法综合考虑特异性位点的等位基因频率和基因型类型,在确保鉴定准确性的同时,提高了检测效率和评价的科学性。本发明通过使用分子标记技术对天津猴鸡进行科学的品种特异性鉴定和评价,操作简单且结果可靠,可以为地方鸡遗传资源保护和合理利用提供科学依据。

    一种鸡保种群个体选配优化的方法

    公开(公告)号:CN106086172B

    公开(公告)日:2019-09-17

    申请号:CN201610422017.5

    申请日:2016-06-13

    IPC分类号: C12Q1/6888

    摘要: 本发明公开了一种鸡保种群个体选配优化的方法,提取鸡保种群留种公、母鸡个体血液DNA,通过简化基因组测序技术进行测序,并与GenBank数据库参考鸡种进行序列比对,找到存在于不同个体上的SNP位点。通过这些SNP位点的等位基因频率和基因型频率计算出个体自身近交系数和个体间亲缘关系系数,根据统计量的值优化个体选配,避开近交系数过高个体及家系内亲缘关系系数过高交配组合,从而达到降低保种群近交水平和维持遗传多样性总量稳态的目的。通过本发明,能有效解决鸡品种资源保护过程中存在的依靠系谱信息无法进行个体精细选配的难题,能有效降低保种群近交水平,进而达到维持遗传多样性稳态,提高保种效果和保种效率的目的。

    金湖乌凤鸡分子标记的筛选方法及其应用

    公开(公告)号:CN109321665A

    公开(公告)日:2019-02-12

    申请号:CN201811298610.9

    申请日:2018-11-01

    IPC分类号: C12Q1/6888

    摘要: 本发明提供了一种金湖乌凤鸡分子标记的筛选方法及其应用,涉及遗传学领域。该金湖乌凤鸡分子标记的筛选方法,包括通过高通量测序检测SNP标记,计算遗传统计量分析比较金湖乌凤鸡群体与其他鸡种群体的遗传差异,筛选出金湖乌凤鸡的分子标记,缓解了目前金湖乌凤鸡保种效果的评价过程中缺少高效的分子生物学方法导致的金湖乌凤鸡遗传分化研究成本高、精确度低的技术问题,达到了高效快速筛选出用于评价金湖乌凤鸡保种效果的分子标记技术效果。本发明还提供了金湖乌凤鸡分子标记的筛选方法和筛选出的分子标记的应用,缓解了金湖乌凤鸡研究中缺少分子生物学标记和筛选方法的技术问题。