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公开(公告)号：CN116978462A
公开(公告)日：2023-10-31
申请号：CN202310954854.2
申请日：2023-07-31
Applicant: 江南大学
IPC: G16B40/00 , G16B5/00 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种基于扩散模型生成非天然启动子的方法，属于生物信息技术领域。所述为实现生成启动子，建立了基于扩散模型的深度学习网络。同时，本申请对生成启动子进行了真假判定和功能性区间分析，结果显示，生成的启动子中超过40％为真启动子，且序列具有显著的‑35和‑10功能区，具有较高的可信度。
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公开(公告)号：CN114317473B
公开(公告)日：2023-08-29
申请号：CN202011588017.5
申请日：2020-12-29
Applicant: 江南大学
IPC: C12N9/10 , C12N15/54 , A23C9/12 , A23C19/032 , A23C19/06 , A23G9/36 , A23L11/00 , A23L13/40 , A23L13/74 , A23L17/00 , A23L27/60
Abstract: 本发明公开了一种催化活性和热稳定性提高的谷氨酰胺转氨酶变体，属于生物领域和食品领域。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体为热稳定性改善的酶，包含对应于SEQ ID NO.1所示的多肽的第287位的取代。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体可以在食品处理、加工和转化等方面进行应用，可以用于保持或改善食品的品质、稠度、弹性、水分或粘度。热稳定性改善的谷氨酰胺转氨酶变体更利于其在严苛的工业环境中稳定应用，如人造肉肉糜加工及肉丸加工。
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公开(公告)号：CN112553176B
公开(公告)日：2022-04-29
申请号：CN202011586398.3
申请日：2020-12-29
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种热稳定性提高的谷氨酰胺转氨酶，属于生物领域和食品领域。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体为热稳定性改善的酶，包含对应于SEQ ID NO.1所示的多肽的第1‑4位的取代。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体可以在食品处理、加工和转化等方面进行应用，可以用于保持或改善食品的品质、稠度、弹性、水分或粘度。热稳定性改善的谷氨酰胺转氨酶变体更利于其在严苛的工业环境中稳定应用，如人造肉肉糜加工及肉丸加工。
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公开(公告)号：CN111518781A
公开(公告)日：2020-08-11
申请号：CN201910702850.9
申请日：2019-07-31
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种谷氨酰胺转氨酶复合酶及其在人造肉加工中的应用，属于生物工程和食品工程技术领域。本发明提供了一种谷氨酰胺转氨酶复合酶，是将枯草芽孢杆菌、Acetanaerobacterium elongatum、Marasmitruncus massiliensis、Sporobacter termitidis、茂源链霉菌来源的谷氨酰胺转氨酶进行混合或在细胞中共表达得到的。在人造肉加工中加入该酶可解决人造肉质地疏松的问题。
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公开(公告)号：CN111513262A
公开(公告)日：2020-08-11
申请号：CN201910702815.7
申请日：2019-07-31
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种提高动物细胞来源人造肉颜色品相的方法，属于食品工程和酶工程技术领域。本发明是对动物干细胞培育出人造肉的品相改进。其处理方法为：将78‑90％的动物干细胞培养所得肉糜、10‑25％的水分、0.5‑3％大豆血红蛋白，混合后在18‑28℃、转速1000‑2000r/min下搅拌10‑30min，人造肉颜色可由淡黄变为深红色。该方法加工的人造肉中解决了人造肉制作后颜色浅的品相问题。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN119763665A
公开(公告)日：2025-04-04
申请号：CN202411631566.4
申请日：2024-11-15
Applicant: 江南大学
IPC: G16B40/00 , G06N3/042 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明涉及一种基于图表示学习的基因调控网络推断方法及系统，该方法包括：通过单细胞RNA测序数据构建基因调控网络数据集，将已知相互作用的基因对作为正样本，未知相互作用的基因对作为负样本，并随机划分为训练集、验证集和测试集；将训练集中的先验基因调控网络和基因表达谱输入到预构建的基因调控网络推断模型中进行迭代训练，得到基因对预测值；构建包含图对比学习正则项的损失函数，计算预测值与真实值之间的损失值来更新模型参数，当训练轮次达到阈值时，输出模型训练参数，并加载到模型中，对未知相互作用的基因对进行调控关系预测。本发明解决了传统生物实验成本高和现有计算模型精度低的问题，提高了基因调控网络的推断精度。
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公开(公告)号：CN115050420B
公开(公告)日：2025-03-28
申请号：CN202210715298.9
申请日：2022-06-22
Applicant: 江南大学
IPC: G16B20/30 , G16B40/00 , G06N3/0455 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种基于卷积神经网络预测蛋白/酶底物结合位点的方法，属于生物信息技术领域。该方法建立了基于Densenet模块和Unet模块的深度卷积神经网络模型DUnet，该模型中因为Densenet模块的存在，使得网络的每一层都与其余层密集连接，从而为实现增强特征提取提供了可能，同时，本申请对训练集中蛋白‑配体进行旋转，实现增强特征提取，进一步提高了蛋白/酶底物结合位点的预测精度，并采用公开数据集COACH420以及BU48对本申请预测方法的识别底物结合位置和范围上进行了验证，证明其预测结果更精准。对基于结构的蛋白改造、缩短蛋白/酶的进化周期，降低实验成本具有重大意义。
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公开(公告)号：CN118638758A
公开(公告)日：2024-09-13
申请号：CN202410837216.7
申请日：2024-06-26
Applicant: 江南大学
Abstract: 本发明公开了一种提高积雪草酸C28‑O葡萄糖糖基化修饰的方法，属于酶工程技术领域。本发明筛选了催化效率提高的UDP‑葡萄糖基转移酶CaUGT73AD1，通过更换启动子及融合促溶标签，提高了CaUGT73AD1的可溶性表达水平和积雪草酸的转化效率；进一步通过对CaUGT73AD1表面电荷优化，获得了CaUGT73AD1突变体。在大肠杆菌中完成上述优化可使葡萄糖糖基化修饰积雪草酸生成积雪草酸单葡萄糖苷的转化率提高至67.6％。进一步将上述优化用于双质粒表达的酶级联催化积雪草酸合成积雪草苷的系统中，可使积雪草苷产量增加3.37倍。
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公开(公告)号：CN116705167A
公开(公告)日：2023-09-05
申请号：CN202310575873.4
申请日：2023-05-22
Applicant: 江南大学
IPC: G16B40/00 , G16B30/00 , G06F18/241 , G06F18/214 , G06F18/213 , G06N3/0464 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开了一种基于深度学习的大肠杆菌启动子识别及强弱分类方法，属于生物信息技术领域。所述方法包括：对基因序列进行数字化处理、对训练样本进行扩充、构建深度学习网络模型用于特征学习。本发明采用的残差网络结合自注意力机制，具有更深的网络深度并且可有效识别序列的小区段关键区域与全长序列的关联。相比于现有的采用一维卷积神经网络结合双向长短期记忆，其中，启动子真伪数据集仅包含6764个样本；启动子强弱数据集包含3382个样本。本发明旨在通过增加网络深度、数据集样本量来提高整体的判别精度，所构建的模型不仅可以用于启动子识别与强弱判定，且更有助于辅助挖掘强启动子。
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公开(公告)号：CN114317473A
公开(公告)日：2022-04-12
申请号：CN202011588017.5
申请日：2020-12-29
Applicant: 江南大学
IPC: C12N9/10 , C12N15/54 , A23C9/12 , A23C19/032 , A23C19/06 , A23G9/36 , A23L11/00 , A23L13/40 , A23L13/70 , A23L17/00 , A23L27/60
Abstract: 本发明公开了一种催化活性和热稳定性提高的谷氨酰胺转氨酶变体，属于生物领域和食品领域。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体为热稳定性改善的酶，包含对应于SEQ ID NO.1所示的多肽的第287位的取代。本发明的谷氨酰胺转氨酶变体可以在食品处理、加工和转化等方面进行应用，可以用于保持或改善食品的品质、稠度、弹性、水分或粘度。热稳定性改善的谷氨酰胺转氨酶变体更利于其在严苛的工业环境中稳定应用，如人造肉肉糜加工及肉丸加工。
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