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公开(公告)号:CN110938681A
公开(公告)日:2020-03-31
申请号:CN201911378483.8
申请日:2019-12-27
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种富集核酸延伸产物的方法,包括a.对样品中包含一组或多组等位基因对的核酸进行富集,所述富集的产物至少5kb,优选至少8kb,更优选至少10kb,并且富集的产物包含至少一组等位基因对;b.在探针与核酸杂交的条件下将探针与含有核酸的样品接触,所述探针包括分别靶向所述至少一组等位基因对中任一组的两条等位基因的至少两种探针,并且靶向其中一条等位基因的探针的延伸受到抑制,c.延伸探针,和d.富集延伸产物。
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公开(公告)号:CN109971831A
公开(公告)日:2019-07-05
申请号:CN201910311573.9
申请日:2019-04-18
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6816
Abstract: 本发明提供一种富集核酸延伸产物的方法,包括a.在探针与核酸杂交的条件下将探针与含有核酸的样品接触,其中,所述核酸包含等位基因对,所述探针包括分别靶向等位基因对中两条等位基因的至少两种探针,并且靶向其中一条等位基因的探针的延伸受到抑制,b.延伸探针,和c.富集延伸产物。本发明提供用于单倍型分离的试剂盒。
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公开(公告)号:CN119506274A
公开(公告)日:2025-02-25
申请号:CN202311069435.7
申请日:2023-08-23
Applicant: 重庆市人口和计划生育科学技术研究院 , 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12N15/11 , C12Q1/6888 , C12Q1/686 , C12N15/12
Abstract: 本发明涉及对单细胞全基因组扩增产物进行质控的方法和系统,包括对不同染色体片段进行检测。本发明还涉及所述方法中所用的试剂。
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公开(公告)号:CN114250279B
公开(公告)日:2024-04-30
申请号:CN202011004177.0
申请日:2020-09-22
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6858
Abstract: 本发明涉及分子生物学技术领域,特别是涉及一种单倍型的构建方法,所述构建方法包括以下步骤:针对目的基因设计多对PCR引物,以使扩增后相邻两条PCR产物具有重叠区域,且所有PCR产物能完全覆盖目的基因;利用设计的PCR引物扩增目的基因;以扩增得到的所有PCR产物为模板进行长读长二代测序文库构建并上机测序;数据分析:通过组装获得目的基因的单倍型信息。可以利用现有的长读长二代测序技术实现目标区域的靶向单倍型检测,极大地提高现有的长读长二代测序技术的应用范围;此外,也在靶向测序领域实现了单倍型检测的可能;以更低的成本实现靶向基因组单倍型检测,且准确率达到了100%。
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公开(公告)号:CN111154820B
公开(公告)日:2021-12-21
申请号:CN202010030832.3
申请日:2020-01-13
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6848 , C12P19/34
Abstract: 本发明涉及生物技术领域,特别是涉及一种降低核酸扩增复制滑移率的方法。本发明提供一种降低核酸扩增复制滑移率的方法,包括:在SD聚合酶存在的条件下对模板核酸进行扩增,以提供扩增产物,所述模板核酸包括重复序列,所述重复序列包括多个重复单元,所述扩增产物的复制滑移率≤8%。本发明所提供的降低核酸扩增复制滑移率的方法及其相关试剂盒、以及PCR扩增体系,能够有效减少核酸扩增中出现的非特异性扩增和复制滑移,其扩增获得的产物具有优良的扩增忠实性,具有良好的产业化前景。
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公开(公告)号:CN111304309A
公开(公告)日:2020-06-19
申请号:CN202010152944.6
申请日:2020-03-06
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , G16B30/10
Abstract: 本发明提供一种测序平台标签序列污染的检测方法,至少包括以下步骤:(1)将待测标签序列与已知序列连接,获得标签序列-已知序列,测序平台的标签序列种类固定且已知;(2)对步骤(1)获得的序列进行测序,获得测序结果,所述测序结果包括序列的碱基排列和序列的数量;(3)根据标签序列的种类的不同,对测序结果进行拆分,若一已知序列rm除了在其对应的标签序列Tm的分类结果中出现外,还在其他标签序列Tn的分类结果中出现,则所述标签序列Tm被所述其他标签序列Tn污染;其中,m,n为自然数,且m≠n。本发明通过验证标签序列的单一性,保证后续的下机数据的可信性。
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公开(公告)号:CN110791554A
公开(公告)日:2020-02-14
申请号:CN201911082549.9
申请日:2019-11-07
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6851
Abstract: 本发明提供一种微量DNA的定量方法,至少包括以下步骤:设计内标模板;设计能够同时扩增目标模板和内标模板的引物对;利用所述引物对,将待测DNA序列和内标模板混合后进行PCR扩增;将扩增产物用二代测序平台对应的接头引物对进行再次扩增,获得二代测序文库;对所述二代测序文库进行二代测序平台测序;根据公式待测DNA的拷贝数=C*A1/A2,计算得目标模板的拷贝数,即为待测DNA的拷贝数;其中,C为内标模板的拷贝数;A1为目标模板序列的测序覆盖深度;A2为内标模板序列的测序覆盖深度。本发明不仅可以准确定量微量DNA,还可以直接读取目标DNA模板的序列,定量结果准确性不受非特异性扩增的影响。
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公开(公告)号:CN119799868A
公开(公告)日:2025-04-11
申请号:CN202311314314.4
申请日:2023-10-10
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及基因检测领域,特别是涉及一种用于检测地中海贫血基因突变的试剂盒及方法,所述试剂盒包括接头元件、引物池、PCR试剂,所述引物池由用于检测HBA基因和HBB基因突变的引物和用于检测内参基因的引物组成,所述用于检测HBA基因的引物包括用于检测HBA基因簇上X特异性区段、Y特异性区段、Z特异性区段的引物。本发明可以实现地中海贫血基因HBA1、HBA2、HBB基因缺失型与非缺失型的同时检测,极大的降低了缺失型突变漏检的可能性。相对于传统检测方法,本发明通量更高,检测范围更广,更容易检出稀有突变,同时实现α‑地贫和β‑地贫基因检测。一个样本仅需一管反应,更容易实现检测流程的自动化。
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公开(公告)号:CN118028455A
公开(公告)日:2024-05-14
申请号:CN202410301300.7
申请日:2024-03-15
Applicant: 万远 , 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6883 , C12Q1/6851 , C12N15/11 , G16B20/20
Abstract: 本发明涉及基因检测领域,特别是涉及一种基于α‑珠蛋白基因拷贝数变异检测基因分型的方法及其装置,所述方法通过检测α‑珠蛋白基因上多个特异性区段的拷贝数和参比基因上的特异性内参区段的拷贝数,根据拷贝数与α‑珠蛋白基因突变类型之间的匹配关系从而得到α‑珠蛋白基因的突变类型,所述α‑珠蛋白基因上特异性区段如下:X特异性区段:基因组位置为chr16:170701‑171989;Y特异性区段:基因组位置为chr16:174964‑175810;Z特异性区段:基因组位置为chr16:165401‑169452和/或chr16:177538‑183301。本发明的方法检测适用性广,可以用于荧光定量PCR、数字PCR、高通量测序平台。
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公开(公告)号:CN117568447A
公开(公告)日:2024-02-20
申请号:CN202310957712.1
申请日:2023-08-01
Applicant: 上海韦翰斯生物医药科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/11 , C12Q1/6869 , C12Q1/686 , C40B50/06
Abstract: 本发明涉及分子生物学领域,特别是涉及一种构建多重PCR靶向测序文库的方法及试剂盒,所述试剂盒包括接头元件、引物池、PCR试剂和Mg2+,所述接头元件包括第一核苷酸链和第二核苷酸链,第一核苷酸链包括第一通用序列、分子标签、第二通用序列,第二核苷酸链包括第二通用序列的互补序列,所述引物池包括20~30000条特异性引物,每条特异性引物均由第三通用序列和特异性序列形成,所述特异性序列为与目的基因片段相同或互补的序列,所述Mg2+的工作浓度为5mM以下。所述构建多重PCR靶向测序文库的方法为使用所述的试剂盒进行文库构建。本发明的方法可以直接用于目标区域靶向建库测序,较长分子标签UMI的加入使本方法相对传统扩增子建库有更高的检测准确度、特异性。
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