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公开(公告)号:CN113789396A
公开(公告)日:2021-12-14
申请号:CN202111078574.7
申请日:2021-09-15
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用。本发明的基因组合物包括基因SNX3、AKIRIN2、TMEM87B、STEAP3、PPME1、LGALS7B、ARFRP1、STX11、RP11‑295P9.3和RP11‑434D12.1。本发明运用LASSO回归(套索回归)和二分类Logistic回归筛选与肠道菌群占比相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到食管癌中对应评分的截断值,可用于食管癌患者相关肠道菌群的占比的推测。本发明基于基因组合物构建的评分模型经验证,具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN113789396B
公开(公告)日:2024-01-23
申请号:CN202111078574.7
申请日:2021-09-15
Applicant: 复旦大学附属中山医院
Abstract: 本发明公开了一种用于检测食管癌患者特定肠道菌群占比的基因组合物及其应用。本发明的基因组合物包括基因SNX3、AKIRIN2、TMEM87B、STEAP3、PPME1、LGALS7B、ARFRP1、STX11、RP11‑295P9.3和RP11‑434D12.1。本发明运用LASSO回归(套索回归)和二分类Logistic回归筛选与肠道菌群占比相关的基因,并构建评分Score,通过ROC曲线分析得到食管癌中对应评分的截断值,可用于食管癌患者相关肠道菌群的占比的推测。本发明基于基因组合物构建的评分模型经验证,具有准确性高,特异性好的优点,有很好的应用前景。
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公开(公告)号:CN115910204A
公开(公告)日:2023-04-04
申请号:CN202211395976.4
申请日:2022-11-09
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G16B20/50 , G16B40/00 , C12Q1/6886
Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌EGFR突变的基因组合物及其应用。所述基因组合物由CST5、ENPP3、FNDC5、GLIS2、IFNLR1、LRRC31、PSPH、TNFRSF10B组成。本发明通过运用limma包筛选与肺腺癌EGFR突变密切相关的差异基因,通过Lasso回归和logistic回归构建上述基因表达组成的评分Score,可用于肺腺癌EGFR突变的检测。实验验证该评分检测模型方法具有灵敏度高、特异度高的特点,同时性价比高,具有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN115747332A
公开(公告)日:2023-03-07
申请号:CN202211251112.5
申请日:2022-10-13
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12Q1/6886 , G16B25/10 , G16B20/50
Abstract: 本发明公开了一种检测肺腺癌SMAD4突变的试剂盒。本发明通过运用limma包筛选与SMAD4密切相关的差异基因,通过Lasso回归最终挑选出13个基因TRIM48,HS3ST1,GPA33,STK39,GPR110,IPCEF1,ALPPL2,KCNQ3,ADAM28,CDC42EP1,ZBTB18,MYCN和HKDC1,并通过logistic回归构建上述基因组成的评分模型;绘制受试者工作特征曲线获得截断值,可用于肺腺癌SMAD4突变的检测。实验验证该方法具有灵敏度、特异度高的特点,有广泛的应用前景。
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公开(公告)号:CN219475619U
公开(公告)日:2023-08-04
申请号:CN202320141471.9
申请日:2023-01-16
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: G01N33/531
Abstract: 本实用新型公开了一种蛋白质免疫印迹实验用抗体孵育盒。该抗体孵育盒包括盒体与盒盖,所述盒体内设有多个平行的孵育槽,所述孵育槽的一端设有加样口,所述加样口的宽度大于孵育槽的宽度;所述孵育槽的宽度设为0.4~0.6cm,所述加样口的宽度设为0.8~1.2cm,所述孵育槽的长度设为8cm、高度设为3cm。本实用新型提出的抗体孵育盒的结构和规格适合将膜竖放,从而可以根据膜的不同高度加入不同体积的抗体稀释液,可以节省抗体,从而节省实验费用,此外,抗体加样口的设计,方便使用移液器吸取抗体液并回收抗体,进一步降低实验费用;该抗体孵育盒的结构设计适应于不同宽度的膜,可替代以前的多种不同规格的抗体孵育盒。
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