一种人血清中肿瘤标记物Bicr6蛋白的质谱筛选方法

    公开(公告)号:CN101793882A

    公开(公告)日:2010-08-04

    申请号:CN201010105550.1

    申请日:2010-02-04

    Abstract: 本发明提供了一种人血清中肿瘤标记物Bicr6蛋白的质谱筛选方法,其特征在于,具体步骤为:取人血清,用磁珠吸附后洗脱得到磁珠富集液;将磁珠富集液加入基质溶液,按以下条件进行基质辅助激光解离电离飞行时间质谱检测:第一离子源电压:20kv;第二离子源电压:18.6kv;晶体电压:7.6kv;脉冲离子时间:320ns;极性:正;矩阵抑制模式:门控;门控强度:最大;抑制高限:600Da;检测器:1400-1500v;样本率:1.00Gs/s;电子获取:增强,100mv;实时流畅:高;激光频率:20Hz;激光衰减:关73%,范围20%;质荷比为4964±1处的峰为Bicr6蛋白。本发明时间短、灵敏度高。

    一种肝细胞癌诊断的tsRNA生物标志物及其应用

    公开(公告)号:CN118326039B

    公开(公告)日:2024-11-19

    申请号:CN202410527529.2

    申请日:2024-04-29

    Abstract: 本发明公开了一种肝细胞癌诊断的tsRNA生物标志物及其应用,该tsRNA生物标志物用于制备诊断肝细胞癌的产品,tsRNA生物标志物为tRF‑3a亚型,进一步为tRF‑3a‑Pro,产品可为实时定量荧光PCR检测试剂盒,包含检测血清中tRF‑3a‑Pro的引物对,序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。本发明先通过高通量测序筛选HCC患者组织及血清中高表达的tsRNA,再通过人群验证后获取有诊断价值的tsRNA,经验证tRF‑3a‑Pro对肝癌诊断具有较好的灵敏度和特异性,将其作为肝细胞癌诊断的生物标志物,采用经典实时定量荧光PCR检测易于推广应用,具有重要的临床应用价值。

    一种肝细胞癌诊断的tsRNA生物标志物及其应用

    公开(公告)号:CN118326039A

    公开(公告)日:2024-07-12

    申请号:CN202410527529.2

    申请日:2024-04-29

    Abstract: 本发明公开了一种肝细胞癌诊断的tsRNA生物标志物及其应用,该tsRNA生物标志物用于制备诊断肝细胞癌的产品,tsRNA生物标志物为tRF‑3a亚型,进一步为tRF‑3a‑Pro,产品可为实时定量荧光PCR检测试剂盒,包含检测血清中tRF‑3a‑Pro的引物对,序列如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示。本发明先通过高通量测序筛选HCC患者组织及血清中高表达的tsRNA,再通过人群验证后获取有诊断价值的tsRNA,经验证tRF‑3a‑Pro对肝癌诊断具有较好的灵敏度和特异性,将其作为肝细胞癌诊断的生物标志物,采用经典实时定量荧光PCR检测易于推广应用,具有重要的临床应用价值。

    用于诊断胃癌、预测胃癌预后的ctDNA甲基化区段标志物

    公开(公告)号:CN118086490A

    公开(公告)日:2024-05-28

    申请号:CN202311454976.1

    申请日:2023-11-02

    Abstract: 本发明公开了一种用于诊断胃癌、预测胃癌预后的ctDNA甲基化区段标志物。本发明通过Twist甲基化测序从临床样本的组织和血液样本中筛选及鉴定ctDNA甲基化标志物,并利用机器学习结合网上数据库来筛选差异甲基化区域并建立胃癌的诊断模型,最后,验证23个ctDNA甲基化区段的胃癌诊断模型。本发明中应用了三种机器学习算法来进一步验证和筛选ctDNA甲基化区段标志物,获得了基于LASSO回归分析的最佳胃癌诊断模型,LASSO回归模型中训练组和验证组的敏感性和特异性分别为93.75%和93.33%,表明本发明的ctDNA甲基化区段标志物及胃癌诊断模型具有良好的临床应用潜力及价值。

    一种人血清中钙依赖分泌蛋白1的质谱检测方法

    公开(公告)号:CN101776642B

    公开(公告)日:2012-10-31

    申请号:CN201010105552.0

    申请日:2010-02-04

    Abstract: 本发明涉及一种人血清中钙依赖分泌蛋白1的质谱检测方法,其特征在于,具体步骤为:取人血清,利用磁珠吸附蛋白得到磁珠富集液;将磁珠富集液加入基质溶液,按以下条件进行基质辅助激光解离电离飞行时间质谱检测:第一离子源电压:20kv;第二离子源电压:18.6kv;晶体电压:7.6kv;脉冲离子时间:320ns;极性:正;矩阵抑制模式:门控;门控强度:最大;抑制高限:600Da;检测器:1400-1500v;样本率:1.00Gs/s;电子获取:增强,100mv;实时流畅:高;激光频率:20Hz;激光衰减:关73%,范围20%;质荷比为5336±1处峰为钙依赖分泌蛋白1。本发明的优点为时间短、灵敏度高。

    一种人血清中钙依赖分泌蛋白1的质谱检测方法

    公开(公告)号:CN101776642A

    公开(公告)日:2010-07-14

    申请号:CN201010105552.0

    申请日:2010-02-04

    Abstract: 本发明涉及一种人血清中钙依赖分泌蛋白1的质谱检测方法,其特征在于,具体步骤为:取人血清,利用磁珠吸附蛋白得到磁珠富集液;将磁珠富集液加入基质溶液,按以下条件进行基质辅助激光解离电离飞行时间质谱检测:第一离子源电压:20kV;第二离子源电压:18.6kV;晶体电压:7.6kV;脉冲离子时间:320ns;极性:正;矩阵抑制模式:门控;门控强度:最大;抑制高限:600Da;检测器:1400-1500V;样本率:1.00Gs/s;电子获取:增强,100mV;实时流畅:高;激光频率:20Hz;激光衰减:关73%,范围20%;质荷比为5336±1处峰为钙依赖分泌蛋白1。本发明的优点为时间短、灵敏度高。

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