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公开(公告)号：CN113930538A
公开(公告)日：2022-01-14
申请号：CN202111288744.4
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建，涉及水稻种植环境检测技术领域，水稻是比较重要的粮食作物，本发明通过高通量测序的方法，检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型，获得了特定的目标SNP位点，采用机器学习和人工智能的方法，构建分析模型，用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90％，相对于常规的适种区域评价方法，具有成本低，时间短等技术优势。
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公开(公告)号：CN107164471B
公开(公告)日：2020-08-07
申请号：CN201710354083.8
申请日：2017-05-18
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/04 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一组快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的引物组以及分子鉴定方法。所述引物组序列分别如SEQ ID NO.1～2所示。本发明在完成对广东株白僵菌线粒体全基因组序列的高通量测序和多个虫草科物种的线粒体全基因组生物信息学比较分析的基础上，比较白僵菌线粒体基因序列在地理种属上的差异，发现白僵菌的核糖体蛋白基因rps3变异明显；并基于此设计筛选得到了1对能特异检测白僵菌的引物，建立了高效、快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的分子鉴定方法，方法简便快速、特异性好，灵敏度高，且适用性广，可实现对不同产地僵蚕中白僵菌真伪的鉴别；为中药材僵蚕的质量标准化和规范化以及临床用药安全提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN106868116A
公开(公告)日：2017-06-20
申请号：CN201710064067.5
申请日：2017-01-24
Applicant: 华南农业大学
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , G16B30/00 , G16B40/00 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种桑树病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑树病叶或感病部位的器官；提取桑树病叶或感病部位的器官的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑树黑斑病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出16种真菌，其中相对丰度最高的为Pseudocercospor属病原菌，由此推定桑树黑斑病病原菌的病原菌为Pseudocercospora，并命名为Pseudocercospora mori；该属绝大部分为植物病原，大部分导致植物出现褐斑，与本发明叶片病征相符合。
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公开(公告)号：CN116555463A
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202210109298.4
申请日：2022-01-28
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴别日本晴、台中65和中花11的InDel分子标记及其应用。本发明通过对日本晴、台中65和中花11这三个粳稻品种的全基因组序列进行双端比对等一系列比对筛选，获得了可用于鉴别上述三个粳稻品种的特异性InDel分子标记。在此基础上，本发明通过设计筛选检测所述InDel分子标记的引物组，开发了能快速、准确地对日本晴、台中65和中花11这三个粳稻品种进行区分，同时还可用于鉴定这三个粳稻品种纯度及其杂交F1代真伪的试剂盒和方法，且检测特异性高，鉴定成本低，通量高，适用于生产实践。
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公开(公告)号：CN114058728A
公开(公告)日：2022-02-18
申请号：CN202111388078.1
申请日：2021-11-22
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司 , 广州美斛健生物技术有限公司 , 广东陈皮人家陈皮集团有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12Q1/6806 , G16B20/20 , G06K9/62
Abstract: 本发明公开了一套用于茶枝柑品系鉴定的分子标记及其应用，所述分子标记包括表2‑3中给出的337个SNP位点，所述茶枝柑为大洞5号、大种油身和细种油身。本发明优点有：所用的SNP位点少，品系鉴定准确，有利于遗传育种的应用，避免品系退化，为保障陈皮市场的品质提供基础。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN109609681B
公开(公告)日：2021-09-24
申请号：CN201910049659.9
申请日：2019-01-18
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于叶绿体基因组序列的火炬松个体鉴定方法，检测待测样本的叶绿体基因组的分子标记。利用存在于21个火炬松种质间的21个叶绿体基因组SNP特异性位点，实现了对不同个体的区分，并能够以此鉴定其父系祖先。本发明首先发现火炬松叶绿体基因组序列的多态性，发现了叶绿体基因组可以作为种群亲缘关系鉴定。通过对叶绿体基因组序列差异区段的比较，获得能够用于筛选鉴定火炬松个体的种质或父系祖先的鉴定的分子标记，并进一步获得检测分子标记的特异性PCR扩增引物，从而实现了利用PCR扩增技术对群体进行快速鉴定，在火炬松育种领域会发挥中大的作用。
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公开(公告)号：CN106868116B
公开(公告)日：2020-12-11
申请号：CN201710064067.5
申请日：2017-01-24
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6895 , G16B30/00 , G16B40/00
Abstract: 本发明公开了一种桑树病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑树病叶或感病部位的器官；提取桑树病叶或感病部位的器官的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑树黑斑病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出16种真菌，其中相对丰度最高的为Pseudocercospor属病原菌，由此推定桑树黑斑病病原菌的病原菌为Pseudocercospora，并命名为Pseudocercospora mori；该属绝大部分为植物病原，大部分导致植物出现褐斑，与本发明叶片病征相符合。
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公开(公告)号：CN111485030A
公开(公告)日：2020-08-04
申请号：CN201910073594.1
申请日：2019-01-25
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司 , 广州美斛健生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明提供一种水稻转录因子BTF3在鉴别粳稻和籼稻中的应用以及一种鉴别粳稻和籼稻的方法，涉及水稻品种鉴别技术领域。本发明所述水稻转录因子BTF3在鉴别粳稻和籼稻中的应用利用该转录因子BTF3在粳稻和籼稻中存在多态性差异，能方便准确的地将水稻栽培品种进行籼稻和粳稻的种质资源区分。本发明还提供利用上述水稻转录因子BTF3鉴别粳稻和籼稻的方法，只需要进行PCR以及酶切，即可实现粳稻和籼稻的快速鉴别。本发明所述鉴别方法的成本低、通量高、加上特异性高(即准确度高)，适用于生产实践中。
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公开(公告)号：CN106636433A
公开(公告)日：2017-05-10
申请号：CN201710064068.X
申请日：2017-01-24
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一种桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑葚病果；提取桑葚病果的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类，实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑葚菌核病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出3种真菌，其中相对丰度最高的为Ciboria属病原菌，据此确定桑肥大性菌核病病原菌为Ciboria，并根据比对结果，确定其为Ciboria carunculoides；该属大多数为植物病原菌，可导致植物的果实、种子出现僵化、膨大等症状，与研究的桑葚菌核病的病征相符合。
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公开(公告)号：CN113870946B
公开(公告)日：2025-04-25
申请号：CN202111290339.6
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种水稻SNP位点的筛选方法以及鉴定水稻品种的方法，涉及生物分子技术领域，本申请提出在筛选用于鉴定水稻品种的SNP位点前，先对用于获取SNP位点的水稻样本进行过滤，先过滤掉非核心群体样本后，再对SNP位点进行筛选和检测，这样能够显著提高SNP位点对于鉴定和分析特定水稻品种的针对性和有效性，为特定水稻品种的有效鉴定以及水稻优质异种基因图谱的构建提供了途径。
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