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公开(公告)号：CN113832252B
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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公开(公告)号：CN113930538B
公开(公告)日：2024-01-23
申请号：CN202111288744.4
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , G16B20/20
Abstract: 本发明公开了一种用于鉴定水稻适种区域的试剂盒及其预测方法和预测模型的构建，涉及水稻种植环境检测技术领域，水稻是比较重要的粮食作物，本发明通过高通量测序的方法，检测和分析籼稻和粳稻群体中SNP位点的基因型，获得了特定的目标SNP位点，采用机器学习和人工智能的方法，构建分析模型，用于对待测水稻品种进行适种区预测。综合预测准确率超过90％，相对于常规的适种区域评价方法，具有成本低，时间短等技术优势。
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公开(公告)号：CN106636433B
公开(公告)日：2020-04-14
申请号：CN201710064068.X
申请日：2017-01-24
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6869 , C12Q1/04 , C40B50/06 , G16B30/10 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了一种桑葚病原菌高通量鉴定及种属分类的方法。本发明通过收集桑葚病果；提取桑葚病果的总DNA；Illumina DNA文库构建；Illumina高通量测序；去除测序数据中桑树基因组序列；组装微生物基因组序列；组装完整核糖体DNA序列；筛选标记微生物核糖体DNA序列；对比分析核糖体DNA序列进行种属分类，实现对桑树病原菌的鉴定及种属分类。结果显示，运用本发明方法对桑葚菌核病病原菌进行鉴定及种属分类，共鉴定出3种真菌，其中相对丰度最高的为Ciboria属病原菌，据此确定桑肥大性菌核病病原菌为Ciboria，并根据比对结果，确定其为Ciboria carunculoides；该属大多数为植物病原菌，可导致植物的果实、种子出现僵化、膨大等症状，与研究的桑葚菌核病的病征相符合。
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公开(公告)号：CN107164471A
公开(公告)日：2017-09-15
申请号：CN201710354083.8
申请日：2017-05-18
Applicant: 华南农业大学
Abstract: 本发明公开了一组快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的引物组以及分子鉴定方法。所述引物组序列分别如SEQ ID NO.1～2所示。本发明在完成对广东株白僵菌线粒体全基因组序列的高通量测序和多个虫草科物种的线粒体全基因组生物信息学比较分析的基础上，比较白僵菌线粒体基因序列在地理种属上的差异，发现白僵菌的核糖体蛋白基因rps3变异明显；并基于此设计筛选得到了1对能特异检测白僵菌的引物，建立了高效、快速鉴别中药材僵蚕中白僵菌真伪的分子鉴定方法，方法简便快速、特异性好，灵敏度高，且适用性广，可实现对不同产地僵蚕中白僵菌真伪的鉴别；为中药材僵蚕的质量标准化和规范化以及临床用药安全提供了技术支持。
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公开(公告)号：CN113832252A
公开(公告)日：2021-12-24
申请号：CN202111288746.3
申请日：2021-11-02
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种籼粳稻SNP位点基因型检测的方法，涉及生物技术领域。通过对水稻全基因组进行超低深度测序，获取核心SNP位点的基因型，经过近距离SNP的基因型组成分析，校正后，综合判定核心SNP位点的基因型。本发明提供的方法可以在超低的测序深度(2‑10倍)下实现高达90％的检测正确率。极大程度上降低了抽样数量，降低了工作量，优化了测试区域，使得检测结果更为准确。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN111893206A
公开(公告)日：2020-11-06
申请号：CN202010841238.2
申请日：2020-08-20
Applicant: 华南农业大学 , 广州美斛健生物技术有限公司 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种高石斛碱含量石斛材料的鉴定方法和试剂盒，涉及石斛检测技术及育种技术领域。该鉴定方法通过对待鉴定石斛材料的目标基因序列与标准序列比较，如果目标基因的序列与标准序列在目标位点处的碱基序列一致，则指示待鉴定石斛材料为高石斛碱含量石斛。采用该鉴定方法可以鉴定出高石斛碱含量的石斛材料。
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公开(公告)号：CN111485031A
公开(公告)日：2020-08-04
申请号：CN201910083002.4
申请日：2019-01-25
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司 , 广州美斛健生物技术有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种水稻分子标记DOF8及其应用、一种利用水稻分子标记DOF8鉴别粳稻和籼稻的方法，涉及水稻品种鉴别技术领域。本发明所述分子标记DOF8中包括位于水稻基因组2号染色体、第2743687位碱基的多态性为A/G的核苷酸序列。本发明提供的水稻分子标记DOF8特异性高，能方便准确的地将水稻栽培品种进行籼稻和粳稻的种质资源区分。本发明还提供利用上述水稻分子标记DOF8鉴别粳稻和籼稻的方法，只需要进行PCR以及酶切，即可实现粳稻和籼稻的快速鉴别。本发明所述鉴别方法的成本低、通量高、加上特异性高(即准确度高)，适用于生产实践中。同理，所述分子标记DOF8还可用于鉴别普通野生稻和尼瓦拉野生稻。
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公开(公告)号：CN109609681A
公开(公告)日：2019-04-12
申请号：CN201910049659.9
申请日：2019-01-18
Applicant: 华南农业大学
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种基于叶绿体基因组序列的火炬松个体鉴定方法，检测待测样本的叶绿体基因组的分子标记。利用存在于21个火炬松种质间的21个叶绿体基因组SNP特异性位点，实现了对不同个体的区分，并能够以此鉴定其父系祖先。本发明首先发现火炬松叶绿体基因组序列的多态性，发现了叶绿体基因组可以作为种群亲缘关系鉴定。通过对叶绿体基因组序列差异区段的比较，获得能够用于筛选鉴定火炬松个体的种质或父系祖先的鉴定的分子标记，并进一步获得检测分子标记的特异性PCR扩增引物，从而实现了利用PCR扩增技术对群体进行快速鉴定，在火炬松育种领域会发挥中大的作用。
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公开(公告)号：CN119570917A
公开(公告)日：2025-03-07
申请号：CN202411687079.X
申请日：2024-11-25
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种KASII基因用于奇楠沉香和白木香鉴定的方法。以奇楠沉香KASII基因型为TT、白木香KASII基因型为AA为依据进行奇楠沉香和白木香的鉴定。以奇楠沉香和白木香的KASII基因编码区20号碱基为目标位点，采用PCR与Sanger测序的方法，对KASII基因PCR扩增产物进行Sanger测序，如KASII基因型为TT则为奇楠沉香，如KASII基因型为AA则为白木香。本发明的KASII基因用于奇楠沉香和白木香鉴定的方法，通过对奇楠沉香和白木香进行高通量测序，在全基因组范围内进行基因型检测分析，发现有KASII基因在奇楠沉香和白木香之间具有显著差异，且基因功能较明确。利用二者在基因型的差异，采用PCR扩增与Sanger测序的方法，用于奇楠沉香和白木香种质的鉴定。
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公开(公告)号：CN114058728B
公开(公告)日：2023-08-08
申请号：CN202111388078.1
申请日：2021-11-22
Applicant: 华南农业大学 , 广州瑞科基因科技有限公司 , 广州美斛健生物技术有限公司 , 广东陈皮人家陈皮集团有限公司
IPC: C12Q1/6895 , C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12Q1/6806 , G16B20/20 , G06F18/2135
Abstract: 本发明公开了一套用于茶枝柑品系鉴定的分子标记及其应用，所述分子标记包括表2‑3中给出的337个SNP位点，所述茶枝柑为大洞5号、大种油身和细种油身。本发明优点有：所用的SNP位点少，品系鉴定准确，有利于遗传育种的应用，避免品系退化，为保障陈皮市场的品质提供基础。
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