tRNA在促进mRNA的蛋白编码能力中的用途

    公开(公告)号:CN118995711A

    公开(公告)日:2024-11-22

    申请号:CN202411211495.2

    申请日:2024-08-30

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及tRNA在促进mRNA的蛋白编码能力中的用途,通过过表达tRNA提高目的蛋白的表达水平,所述tRNA对应的密码子能够促进或提高所述mRNA的稳定性。本发明还提供了一种新型的tRNA+mRNA免疫增强型疫苗,通过引入一种或多种tRNA分子的方式增强mRNA疫苗的抗原蛋白编码能力,从而激起体内产生更强的体液免疫和细胞免疫应答。本发明还提供一种用于生产抗体的重组细胞,所述重组细胞过表达能够提高抗体表达量的tRNA,所述tRNA包括tRNA isodecoder家族。本发明还提供一种用于生产或包装重组AAV的重组细胞,其特征在于所述重组细胞过表达能够提高AAV包装效率的tRNA。

    一种定点修饰的工程化tRNA及其应用

    公开(公告)号:CN118389493A

    公开(公告)日:2024-07-26

    申请号:CN202410576786.5

    申请日:2024-05-10

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 沈雨轩

    Abstract: 一种定点修饰的工程化tRNA及其应用,所述修饰是以一个或多个修饰的核苷酸替换tRNA分子上,选自第4、9、13、14、17、18、27、28、32、34、35、36、37、38、39、49、50、54、55、58、72位的一个或多个天然未修饰的核苷酸。本发明定点修饰的tRNA与未经修饰的tRNA相比,具有更高的结构稳定性和/或更强的抗核酸酶降解能力,并且氨酰化效率不显著降低、免疫原性不显著升高。所述修饰的tRNA可用于消除无义突变导致的翻译提前终止,在治疗无义突变相关的遗传疾病、肿瘤等方面具有巨大的应用潜力。工程化tRNA的修饰对tRNA成药也有借鉴意义,可指导天然tRNA的修饰设计。

    一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法

    公开(公告)号:CN112908407A

    公开(公告)日:2021-06-04

    申请号:CN202110141068.1

    申请日:2021-02-02

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法,包括以下步骤:S1、对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序归档;S2、对单个体系的tRNA进行组学分析;S3、对多个体系的tRNA进行组学比较;S4、建立公式化的质控指标,形成基于tRNA组学的质控指标及报告。本发明通过对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序和组学分析,评估蛋白翻译环节的总体tRNA供给状态,与参比体系进行tRNA组学相似度计算、tRNA组学匹配查询和tRNA组学差异量化,从而实现对蛋白生物合成体系的鉴定、表征和质控等目的。具有适用范围广、指标可量化、稳定性和区分性好等优势,可以从总体tRNA供给角度对蛋白生物合成体系进行多维度量化质控。

    抑制性tRNA通读提前终止密码子疾病中的截短蛋白

    公开(公告)号:CN107177592B

    公开(公告)日:2021-03-30

    申请号:CN201610134656.1

    申请日:2016-03-10

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 王天畅 杨琦

    Abstract: 本发明涉及利用构建抑制性tRNA延长致病基因无义突变体的截短蛋白,使哺乳动物细胞中产生全长有功能的蛋白,从而恢复突变体的正常结构和功能。发明中涉及无义突变的体系包括单基因遗传病的致病基因和肿瘤细胞内的肿瘤抑制基因。本发明主要涉及构筑对应三种终止密码子的19种抑制性tRNA,在哺乳动物细胞中高效通读dystrophin蛋白,并在肿瘤细胞通读无义突变蛋白,作用显著。

    利用抑制性tRNA系统制备PTC稳定细胞系及应用

    公开(公告)号:CN110846311A

    公开(公告)日:2020-02-28

    申请号:CN201810947478.3

    申请日:2018-08-20

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明属于生物制药领域,具体涉及抑制性tRNA调控提前终止密码子(PTC)通读的稳定细胞系制备方法及应用。本发明主要涉及构筑20种对应三种终止密码子的抑制性tRNA,利用20种抑制性tRNA通读提前终止密码子(PTC,UAG/UAA/UGA)。本发明还涉及串联多拷贝正交tRNA的质粒载体的构建方法,以及借助线性化质粒、慢病毒或Tol2转座子系统将串联的抑制性tRNA基因稳定整合到细胞基因组的方法。本发明进一步涉及稳定细胞系的应用,如包装复制缺陷型(PTC)病毒疫苗。

    利用优化的基因密码子扩展系统通读提前终止密码子疾病中的截短蛋白

    公开(公告)号:CN107177593A

    公开(公告)日:2017-09-19

    申请号:CN201610134657.6

    申请日:2016-03-10

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 杨琦

    Abstract: 本发明涉及利用基因密码扩展的非天然氨基酸系统,高效率通读单基因遗传病中致病基因的无义突变位点,恢复突变体蛋白的正常结构和功能。通过改造古甲烷球菌的tRNA(tRNAPyl),得到全新的高通读效率的UAA和UGA编码的非天然氨基酸系统,扩展了tRNAPyl和吡咯赖氨酰‑tRNA合成酶(PylRS)正交对的使用范围。构建了模拟内源性提前终止密码子的质粒——在由内含子和外显子组成的Smad基因上引入提前终止密码子,可以用于评价通读内源性提前终止密码子的效率。发明中涉及无义突变的系统主要包括单基因遗传病的致病基因和肿瘤细胞内的肿瘤抑制基因。

    抑制性tRNA通读提前终止密码子疾病中的截短蛋白

    公开(公告)号:CN107177592A

    公开(公告)日:2017-09-19

    申请号:CN201610134656.1

    申请日:2016-03-10

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 王天畅 杨琦

    CPC classification number: A61K48/00 C12N15/113 C12N15/1135 C12N2310/10

    Abstract: 本发明涉及利用构建抑制性tRNA延长致病基因无义突变体的截短蛋白,使哺乳动物细胞中产生全长有功能的蛋白,从而恢复突变体的正常结构和功能。发明中涉及无义突变的体系包括单基因遗传病的致病基因和肿瘤细胞内的肿瘤抑制基因。本发明主要涉及构筑对应三种终止密码子的19种抑制性tRNA,在哺乳动物细胞中高效通读dystrophin蛋白,并在肿瘤细胞通读无义突变蛋白,作用显著。

    一种含非天然氨基酸蛋白的制备方法

    公开(公告)号:CN113699124A

    公开(公告)日:2021-11-26

    申请号:CN202111050643.3

    申请日:2021-09-08

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 史宁宁

    Abstract: 本发明涉及一种在动物细胞中表达含有非天然氨基酸重组蛋白的方法,在四组氨基酰‑tRNA合成酶和相应tRNA的基础上,构建识别终止密码子的氨基酰‑tRNA,筛选获得三种基因密码子拓展系统。所述三种基因密码子拓展系统对终止密码子通读效率高、相互兼容性强,从而可以在一条外源蛋白上插入三种非天然氨基酸、或对同一细胞的三条外源蛋白上分别插入不同的非天然氨基酸。为进一步提高通读率,还对释放因子eRF1进行了突变以减弱其与终止密码子的相互作用。

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