基于非天然氨基酸的离子液体、其制备方法及应用

    公开(公告)号:CN115261344A

    公开(公告)日:2022-11-01

    申请号:CN202211042820.8

    申请日:2022-08-29

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及基于非天然氨基酸的离子液体、其制备方法及应用,具体提供了一种用于制备含非天然氨基酸蛋白的物质组合,包括:(1)一种或多种氨基酰‑tRNA合成酶,其能够结合突变的tRNA;(2)一种或多种突变的tRNA,所述突变的tRNA反密码子环上突变为终止密码子的互补序列;(3)多种基于非天然氨基酸的离子液体。所述物质组合可用于重组表达含非天然氨基酸目的蛋白。基于非天然氨基酸的离子液体能够提高基因密码子拓展系统对提前终止密码子(PTC)的通读效率、和/或插入非天然氨基酸效率。

    基于非天然氨基酸的离子液体、其制备方法及应用

    公开(公告)号:CN115261344B

    公开(公告)日:2023-07-21

    申请号:CN202211042820.8

    申请日:2022-08-29

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明涉及基于非天然氨基酸的离子液体、其制备方法及应用,具体提供了一种用于制备含非天然氨基酸蛋白的物质组合,包括:(1)一种或多种氨基酰‑tRNA合成酶,其能够结合突变的tRNA;(2)一种或多种突变的tRNA,所述突变的tRNA反密码子环上突变为终止密码子的互补序列;(3)多种基于非天然氨基酸的离子液体。所述物质组合可用于重组表达含非天然氨基酸目的蛋白。基于非天然氨基酸的离子液体能够提高基因密码子拓展系统对提前终止密码子(PTC)的通读效率、和/或插入非天然氨基酸效率。

    一种含非天然氨基酸蛋白的制备方法

    公开(公告)号:CN113699124B

    公开(公告)日:2022-04-12

    申请号:CN202111050643.3

    申请日:2021-09-08

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 史宁宁

    Abstract: 本发明涉及一种在动物细胞中表达含有非天然氨基酸重组蛋白的方法,在四组氨基酰‑tRNA合成酶和相应tRNA的基础上,构建识别终止密码子的氨基酰‑tRNA,筛选获得三种基因密码子拓展系统。所述三种基因密码子拓展系统对终止密码子通读效率高、相互兼容性强,从而可以在一条外源蛋白上插入三种非天然氨基酸、或对同一细胞的三条外源蛋白上分别插入不同的非天然氨基酸。为进一步提高通读率,还对释放因子eRF1进行了突变以减弱其与终止密码子的相互作用。

    一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法

    公开(公告)号:CN112908407A

    公开(公告)日:2021-06-04

    申请号:CN202110141068.1

    申请日:2021-02-02

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法,包括以下步骤:S1、对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序归档;S2、对单个体系的tRNA进行组学分析;S3、对多个体系的tRNA进行组学比较;S4、建立公式化的质控指标,形成基于tRNA组学的质控指标及报告。本发明通过对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序和组学分析,评估蛋白翻译环节的总体tRNA供给状态,与参比体系进行tRNA组学相似度计算、tRNA组学匹配查询和tRNA组学差异量化,从而实现对蛋白生物合成体系的鉴定、表征和质控等目的。具有适用范围广、指标可量化、稳定性和区分性好等优势,可以从总体tRNA供给角度对蛋白生物合成体系进行多维度量化质控。

    一种含非天然氨基酸蛋白的制备方法

    公开(公告)号:CN113699124A

    公开(公告)日:2021-11-26

    申请号:CN202111050643.3

    申请日:2021-09-08

    Applicant: 北京大学

    Inventor: 夏青 史宁宁

    Abstract: 本发明涉及一种在动物细胞中表达含有非天然氨基酸重组蛋白的方法,在四组氨基酰‑tRNA合成酶和相应tRNA的基础上,构建识别终止密码子的氨基酰‑tRNA,筛选获得三种基因密码子拓展系统。所述三种基因密码子拓展系统对终止密码子通读效率高、相互兼容性强,从而可以在一条外源蛋白上插入三种非天然氨基酸、或对同一细胞的三条外源蛋白上分别插入不同的非天然氨基酸。为进一步提高通读率,还对释放因子eRF1进行了突变以减弱其与终止密码子的相互作用。

    一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法

    公开(公告)号:CN112908407B

    公开(公告)日:2021-10-01

    申请号:CN202110141068.1

    申请日:2021-02-02

    Applicant: 北京大学

    Abstract: 本发明公开了一种用tRNA组学来质控蛋白生物合成体系的方法,包括以下步骤:S1、对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序归档;S2、对单个体系的tRNA进行组学分析;S3、对多个体系的tRNA进行组学比较;S4、建立公式化的质控指标,形成基于tRNA组学的质控指标及报告。本发明通过对蛋白生物合成体系的tRNA进行测序和组学分析,评估蛋白翻译环节的总体tRNA供给状态,与参比体系进行tRNA组学相似度计算、tRNA组学匹配查询和tRNA组学差异量化,从而实现对蛋白生物合成体系的鉴定、表征和质控等目的。具有适用范围广、指标可量化、稳定性和区分性好等优势,可以从总体tRNA供给角度对蛋白生物合成体系进行多维度量化质控。

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