基于光谱校正矩阵同步构建的STR遗传标记检测方法及内标

    公开(公告)号:CN119709978A

    公开(公告)日:2025-03-28

    申请号:CN202411808889.6

    申请日:2024-12-10

    Abstract: 本发明公开了一种基于光谱校正矩阵同步构建的STR遗传标记检测方法及内标,创新采用嵌入光谱特征片段的复合内标,重构光谱校正映射计算方法,设计了基于光谱校正矩阵同步构建的STR遗传标记检测方法,去掉专门的光谱校正试剂电泳环节,实现了用一次电泳即可完成样本STR遗传标记检测。利用本发明,可以实现高效开展STR检测,其可以规避仪器因长时间使用、更换STR检测试剂、光路调整、毛细管阵列更换后光谱校正矩阵和实际STR电泳不匹配问题,对降低运行维护代价,确保STR遗传标记检测质量也有重要作用。

    一种利用定点突变及酶切技术制备荧光分子量内标的方法

    公开(公告)号:CN106868001A

    公开(公告)日:2017-06-20

    申请号:CN201710228420.9

    申请日:2017-04-10

    Abstract: 本发明公开了一种利用定点突变及酶切技术制备荧光分子量内标的方法,包括步骤:将目的DNA片段A克隆进质粒载体,得到重组质粒B;以重组质粒B为模板,在DNA片段A的不同长度位置分别进行定点突变,引入限制性酶切位点,并得到相应的重组质粒C;设计DNA片段A的扩增引物F1、R1,并分别在引物5’端进行荧光标记;利用扩增引物F1、R1扩增重组质粒C,得到扩增产物D,将产物D进行纯化;利用限制性内切酶酶切纯化后的扩增产物D,得到酶切产物E,即荧光分子量内标。利用本发明方法可以实现制备从50bp到500bp共14个片段的分子量内标,产物没有引物峰等杂峰,且工艺适用于规模化生产。

    一种利用SLSQP分析二混DNA的混合比例方法

    公开(公告)号:CN119832990A

    公开(公告)日:2025-04-15

    申请号:CN202411876840.4

    申请日:2024-12-19

    Abstract: 本发明公开了一种利用SLSQP分析二混DNA的混合比例方法,包括:数据准备、数据预处理、基因型组合生成、混合后的基因型频率、定义目标函数和优化过程。本发明通过引入最小化目标函数的优化方法,可以在多基因型、多供体的复杂情况下精确估算每个供体的比例,而不需要依赖人工判读或传统的比对方法。另外,本发明通过创建所有可能的基因型组合并筛选符合条件的组合,确保了计算的高效性,并减少了无效组合对分析结果的影响。本发明不仅适用于简单的二等位基因样本,还能够有效处理包含多个等位基因的复杂样本,适用范围更广。本发明通过自动化计算和优化,避免了传统方法中人工操作可能带来的误差,提高了结果的可重复性和可信度。

    一种荧光自适应解析的方法及系统

    公开(公告)号:CN118914151A

    公开(公告)日:2024-11-08

    申请号:CN202411054528.7

    申请日:2024-08-02

    Abstract: 本发明公开了一种荧光自适应解析的方法及系统。该方法包括如下步骤:设置荧光光谱组合的浓度梯度;通过计算光谱空间到荧光染料空间的映射,建立光谱校正模型;判定各浓度梯度的光谱校正模型是否建立成功;用建立成功的光谱校正模型对不同浓度的实际样品进行检验,得到多组光谱校正适配性研究对象;将得到的多组光谱校正适配性研究对象进行融合,得到光谱校正混合标准品;使用光谱校正混合标准品对待测样本进行检测。本发明通过构建出多组光谱校正标准品,在短串联重复序列检测环节,自适应选择最匹配的光谱校正标准品进行混叠光谱解析,极大地增强了光谱校正标准品适配性,从而有效降低了短串联重复序列主峰位置的多色荧光串扰。

    一种电泳迁移率偏移校正的方法及系统

    公开(公告)号:CN117743783A

    公开(公告)日:2024-03-22

    申请号:CN202311623756.7

    申请日:2023-11-30

    Abstract: 本发明公开了一种电泳迁移率偏移校正的方法及系统。该方法包括如下步骤:采集两板标准品DNA测序信号并处理;选取各自的高质量中段信号作为样本训练集和样本测试集;对样本训练集和样本测试集进行批量峰识别和动态规划,确定非标准通道信号的相对偏移参数值和目标函数的最优结果;将非标准通道信号的相对偏移参数值去平均值作为信号偏移的系统误差参数存储在DNA测序仪的信号系统中。本发明摆脱了全过程逐点自适应的计算模式,避免了校正模型在局部低质量信号段的适应性不佳问题,大大提升了计算效率。

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