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公开(公告)号:CN118629538A
公开(公告)日:2024-09-10
申请号:CN202310200273.X
申请日:2023-03-03
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16C20/50
Abstract: 本公开的实施例提供了用于药物设计的方法、装置、设备、介质和程序产品。用于药物设计的方法包括获取表示蛋白质三维结构的蛋白质数据和表示待与蛋白质三维结构结合的初始分子的初始分子数据。该方法还包括:基于蛋白质数据和初始分子数据,确定表示初始分子中的第一分子片段的第一分子片段数据。该方法还包括:基于第一分子片段数据和初始分子数据,生成表示目标分子的目标分子数据。通过本公开的实施例,针对蛋白质三维结构,通过在初始分子中自动确定的分子片段并基于所确定的分子片段来优化初始分子,可以有针对性地实现对药物分子的片段式人工智能优化,从而降低药物发现的时间和人力成本。
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公开(公告)号:CN119920352A
公开(公告)日:2025-05-02
申请号:CN202311437769.5
申请日:2023-10-31
Applicant: 华为云计算技术有限公司 , 中国科学院上海药物研究所
Abstract: 本申请公开了一种化合物安全性预测方法、装置及计算设备集群,该方法应用于云服务中心,云服务中心包括多个云应用实例,该方法包括:云应用实例根据多个化合物、多个靶点以及多个脱靶预测模型,确定每个化合物与每个靶点之间的第一概率;将第一概率输入药物不良反应ADR预测模型,得到每个化合物和每个ADR之间的第二概率;根据脱靶靶点的数量、第二概率以及每个ADR的危险性评分,确定多个化合物的安全性评分,预测化合物的安全性。上述过程通过将脱靶预测结果作为特征输入ADR预测中,实现脱靶预测和ADR预测的结合,从靶点层面揭示ADR的作用机制,并量化化合物安全性水平,在药物开发阶段化合物的安全性评估提供依据。
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公开(公告)号:CN117253544A
公开(公告)日:2023-12-19
申请号:CN202210645440.7
申请日:2022-06-08
Applicant: 华为云计算技术有限公司
Abstract: 本申请涉及人工智能的生物医药应用领域,尤其涉及一种噬菌体宿主预测方法、装置及存储介质。所述方法包括:获取目标基因组,目标基因组包括目标噬菌体的基因组和目标细菌的基因组;根据目标基因组进行基因的注释得到基因组序列,基因组序列包括目标噬菌体吸附并裂解目标细菌的生命过程中的至少一个基因序列;根据基因组序列进行噬菌体宿主预测得到预测结果,预测结果指示目标噬菌体与目标细菌之间的相互作用情况。由于基因的注释在噬菌体吸附并裂解细菌中起到非常重要的作用,且是特异性的,因此本申请实施例通过对目标噬菌体和目标细菌的基因组进行基因的注释并作为输入参数来进行噬菌体宿主预测,保证了噬菌体宿主预测的准确性和高效性。
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公开(公告)号:CN118571308A
公开(公告)日:2024-08-30
申请号:CN202310436968.8
申请日:2023-04-21
Applicant: 华为云计算技术有限公司 , 北京大学
Abstract: 本申请实施例提供了一种基于元动力学的靶点发现方法及相关装置,应用于生物、医药、药物设计领域。该方法包括:对配体结构和受体结构进行动力学模拟,使得配体结构在动力学模拟过程中遍历受体结构表面;确定配体结构在受体结构表面的各个结合位点的目标信息;根据各个结合位点的目标信息的排序输出确定受体结构的口袋信息。在这个过程中,通过一次遍历就可以获得多个结合位点,能够使得受体构象搜索的范围更广,并减小了计算量,提高了结合位点的发现效率。
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公开(公告)号:CN118866158A
公开(公告)日:2024-10-29
申请号:CN202310786254.X
申请日:2023-06-29
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16C20/50
Abstract: 本申请提供了一种分子对接方法及系统,能够实现高效、准确且低成本的分子对接。其中,本申请提供的分子对接方法可以应用于分子对接系统。分子对接系统获取第一分子和第二分子,然后将第一分子的各自由度变量进行离散化,并使用二值变量对离散后的各自由度变量进行编码,得到对应的编码向量。之后,分子对接系统基于第一分子和第二分子间的相互作用势能构造一个关于多个二值变量的目标函数,通过对该目标函数进行最小化处理,得到第一分子的各自由度变量的解。最后,分子对接系统基于上述得到的第一分子的各自由度变量的解将第一分子和第二分子进行对接。
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公开(公告)号:CN117174185A
公开(公告)日:2023-12-05
申请号:CN202211019436.6
申请日:2022-08-24
Applicant: 华为云计算技术有限公司
IPC: G16C10/00 , G16C20/50 , G06N3/08 , G06N3/0464
Abstract: 本申请提供了人工智能领域一种分子优化方法以及装置,基于伊辛模型来构造目标函数,并使用量子退火算法来进行求解,从而可以高效准确地求解得到最优的分子结构。该方法包括:首先,获取第一数据集合和属性集合,该第一数据集合中包括多组数据,该多组数据可以用于表示多种分子结构,每组数据可以表示至少一种分子结构,属性集合中包括表示多种分子结构的属性的值,每组数据具有对应的至少一种分子属性,如分子的韧性、毒性或者溶解性等属性;根据第一数据集合以及属性集合构造目标函数;随后通过量子退火算法对目标函数进行求解,得到分子序列,该分子序列可以用于表示求解得到的分子结构。
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公开(公告)号:CN116935975A
公开(公告)日:2023-10-24
申请号:CN202210334013.7
申请日:2022-03-31
Applicant: 华为云计算技术有限公司
Abstract: 本申请提供了一种分子生成方法及相关装置,分子生成方法包括:接收用户在终端输入的约束条件,约束条件用于指示分子的属性需要满足的条件,分子的属性包括分子的分子量、水溶性、脂溶性、生物活性、可合成性、与特定分子的对接结合性、与源分子的相似度、所包含的特定子结构、药代动力学和毒性中的任意一项或多项;根据约束条件生成第一分子集合,第一分子集合包括一个或多个分子;向终端返回第一分子集合中一个或多个分子的信息。根据本申请提供的分子生成方法生成分子,能够提高分子生成效率,节省时间成本及人力物力财力等成本。
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