本发明公开了一种超远程制导火箭总体协调多学科分级优化方法，首先建立制导火箭纵向运动方程；然后将各项总体指标按照设计的逻辑顺序和重要程度进行协调分级；再针对第一层级指标，建立无约束优化模型；接下来建立改进的智能单粒子优化算法，对第一层级指标进行优化；之后针对第二层级指标建立约束优化模型，采用惩罚函数法转化为无约束优化问题；最后采用改进的智能单粒子优化算法，对第二层级指标进行循环优化。本方法可使超远程制导火箭的多学科优化结果快速收敛，且实现总体指标最优和指标之间协调匹配，计算量小、简单有效、易于工程实现。