本发明提供了一种磁浮列车停车系统及方法，系统包括：地面停车触发装置和车载停车控制装置；车载停车控制装置包括：信号接收模块、信号判断模块和信号执行模块；信号接收模块与地面停车触发装置连接；信号判断模块分别与信号接收模块和信号执行模块连接；信号接收模块，用于接收地面停车触发装置所发送的停车信号；信号判断模块，用于判断停车信号的类型；信号判断模块，还用于判断当前列车运行速度与速度阈值；信号执行模块，用于根据判断结果，执行相应的停车操作。该系统可以避免列车冲出线路末端的不良后果，从而有效提高列车在运行过程中整体的安全性和稳定性。该方法具有相同的有益效果。