本发明涉及电动车辆电池技术领域，具体而言，涉及一种电池箱温控方法及系统。方法包括：步骤S11，基于电池箱内电池充电或放电，温控装置给电池供给温控液；其中，电池包括第一电池和第二电池；步骤S12，基于温控液的供给，温控液依次流经第一电池和第二电池，然后返回温控装置；步骤S13，基于第二电池的内部温度和温控装置出液口的温控液的温度的差值大于第一温度阈值，控制温控液依次流经第二电池和第一电池，然后返回温控装置。本发明还公开了一种电池箱温控系统。这样就解决了如何减小车辆内电池之间的温度差的问题。