一种确定软质岩大变形区铁路空间线位的方法，以大幅度降低选线成本和节省勘察工期。包括如下步骤：将软质岩大变形按变形程度由弱到强划分为轻微大变形、中等大变形、强烈大变形、极强大变形共四个等级；确定各大变形等级的临界最大初始地应力；确定深度和最大水平应力之间关系；确定各大变形等级的临界深度；确定软质岩大变形区铁路空间线位，垂直隧道轴线布置控制性大变形剖面，根据大变形各等级的临界埋深界线将剖面分为非大变形区、轻微大变形区、中等大变形区、强烈大变形区和及极强大变形区；通过空间线位平面位置调整、空间线位纵断面位置调整的协调配合，使预设隧道绕避风险大的强烈大变形区和及极强大变形区。