一种热管理分配控制系统，包括：车室加热回路，该车室加热回路包括热源、第一泵和放热器；以及电池加热回路，电池加热回路包括第一流路、第二流路和热交换器，第一流路以热交换器与放热器并联设置的形式通过三通流量调节阀连接车室加热回路，第二流路上设置有第二泵和电池换热器，第一流路和第二流路相互独立，热交换器使第一流路与第二流路中的冷却液进行热交换；还包括调节热源的输出、三通流量调节阀的开度、第一泵的输出和第二泵的输出的控制单元；在车室与电池同时加热时，控制单元调节第一泵的输出和/或调节第二泵的输出。本发明能进行大范围且精确的热源放热量分配，且在分配热源放热量的过程中确保车室加热的舒适性。