本发明涉及故障诊断技术领域，公开了一种基于未知输入观测器的离散切换系统的鲁棒故障估计方法，将原离散切换系统的状态向量和故障向量整合为增广系统的状态向量，得到增广系统；基于P半径技术，设计一个未知输入观测器(UIO)来估计增广系统的状态和故障；给出假设条件，利用线性矩阵不等式技术和Schur补引理对观测器进行求解；对故障估计误差进行分析。与现有技术相比，本发明针对离散切换系统基于P半径技术设计未知输入鲁棒故障估计观测器，利用线性矩阵不等式技术和Schur补引理对观测器进行求解并对故障估计误差进行分析，以保证误差系统的稳定，故障估计对未知输入干扰具有完全鲁棒性，该方法与其他传统方法相比，具有更精确的边界和更高的效率。