本发明公开了一种利用微流控技术制备灵芝多糖微胶囊的方法，属于微胶囊制备技术领域。本发明运用模塑法制备两片微流道芯片，通过热键合法封接两片芯片制得中空结构的微流控芯片。灵芝多糖粉末按比例混入食用油脂中作为微胶囊芯材，与固化液氯化钙溶液同轴同向进料，在海藻酸钠溶液流体动力剪切作用下形成氯化钙溶液包裹灵芝多糖油脂溶液的凝胶膜微胶囊，所述凝胶膜微胶囊与壳聚糖溶液发生聚电解质络合反应形成双层复合膜微胶囊。本发明提供的利用微流控技术制备灵芝多糖微胶囊的方法操作简易，自动化程度高，微流控芯片制备简单，制得的微胶囊具有较高的包埋率，且微胶囊的颗粒尺寸可控，生物活性较好。