本发明公开了一种基于遗传算法的全钒液流电池储能系统运行优化方法，包括步骤：1、根据全钒液流电池的等效电路模型建立全钒液流电池的数学模型；2、参数辨识；3、构建瞬时能量效率方程；4、构建最高的瞬时能量效率的代价函数来最小化能量损耗，并确定约束条件；5、构建适应度函数、选择概率函数、变异概率函数；6、采用遗传算法计算，输入功率值PCh/Dis和剩余电量SOC求解得到瞬时能量效率误差的绝对值小于规定的数值时的最高瞬时能量效率，以及对应的流速、温度和电压。本发明以温度、流速、电流三个因素，采用遗传算法，对全钒液流电池的储能系统进行优化，提高电堆的瞬时能量效率，进而提高全钒液流电池的系统效率。