本发明公开了一种纳豆激酶干燥保护剂，它包括：海藻糖；还包括麦芽糊精；海藻糖和麦芽糊精的质量比为2:1~4；制备方法，它包括：按海藻糖、麦芽糊精质量比为2:1~4分别称取海藻糖与麦芽糊精，加入蒸馏水中，搅拌，获得纳豆激酶干燥保护剂；一种纳豆激酶干燥方法，它包括：将纳豆激酶粗酶液与一种纳豆激酶干燥保护剂按体积比1:2~5混合，均质，喷雾干燥，收集纳豆激酶酶粉；生产的纳豆激酶酶活平均值为(210200±19126)FU/g；本发明优点在于：1）利用豆渣为基质生产纳豆激酶，提高豆渣附加值，其酶活性与大豆基质的纳豆激酶产量媲美；2）降低了干燥过程酶活性损失，提高纳豆激酶稳定性。