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公开(公告)号：CN117292813A
公开(公告)日：2023-12-26
申请号：CN202310046383.5
申请日：2023-01-31
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司 , 上海安图生物技术有限公司
Abstract: 本发明涉及无创产前分子诊断技术领域，具体涉及一种区分胎儿性别用计算机系统、无创产前诊断用诊断系统。本发明通过先过滤掉特定区域Y染色体序列读数，再选取特定区域Y染色体序列数据作为Y染色体特征序列读数r，以Y染色体特征序列读数计算Y染色体比例R＝r/S(S为所有常染色体序列读数的总和)，提高胎儿性别判断准确性；进一步的，本发明选取怀有女胎的孕妇样本作为参考样本，计算参考样本数据集所有样本Y染色体比例的平均值mean，标准偏差sd，计算待测样本结果判定特征值M＝R‑mean/sd，将M与阈值比较，大于阈值预测判定为男胎，否则预测判定为女胎，进一步提高胎儿性别判断准确性。
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公开(公告)号：CN117976051A
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202311817803.1
申请日：2023-12-27
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司 , 上海安图生物技术有限公司
Abstract: 本发明涉及微生物宏基因组测序检测技术领域，具体涉及一种宏基因组测序数据分析方法、计算机介质、系统。本发明方法，以reads比对到基因组上的离散程度(指标1)联合属内最高reads数比值(指标2)，作为数据过滤条件，对微生物基因组序列比对结果进行过滤，排除假阳性。本发明充分考虑过滤指标的生物学意义，以reads覆盖在基因组上的离散程度作为过滤指标，减弱基因组大小差异的影响。同时，相比传统的方法，采用reads数与属内最高reads数物种的reads数比值作为过滤指标，评估受属内reads数最高物种同源性带来的干扰，进一步降低假阳性。相对传统阈值的过滤效果，本发明可以在保证足够敏感性的同时，有效控制假阳性结果。
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公开(公告)号：CN110305933A
公开(公告)日：2019-10-08
申请号：CN201910768126.6
申请日：2019-08-20
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
Abstract: 本发明公开了一种快速检测药敏的方法，包括以下步骤：第一步，用营养肉汤和抗菌药物进行混合，配制成浓度呈梯度变化的抗菌药物稀释液；第二步，用超纯水配制待检测菌株的标准菌悬液，再用肉汤稀释后备用；第三步，在第一步配制的抗菌药物稀释液中分别加入等体积的经肉汤稀释的标准菌悬液混匀，得到的混合液按照抗菌药物稀释液的浓度梯度依次滴加于质谱仪样品靶板上点样，点样完成后孵育2.0～5.0h；第四步，孵育完成后，弃肉汤，晾干，滴加质谱鉴定前处理试剂，结晶后用质谱仪进行微生物鉴定并判读结果。本发明方法前处理操作简单，能够更快速的直观地给出准确的药敏结果，给临床及时指导合理用药提供一定的参考。
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公开(公告)号：CN114464257B
公开(公告)日：2025-02-25
申请号：CN202210251396.1
申请日：2022-03-15
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
IPC: G16B20/30 , G06N20/00 , G16B40/00 , G06F18/24 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，具体公开了一种基于二代测序的微卫星不稳定性检测方法及装置。本发明的检测方法利用二代测序技术获得的测序读段，先计算得到待测样本中每个候选微卫星位点的平均缺失单元数，据此检测每个微卫星位点的MSI状态，再以此评估待测样本的MSI状态。本发明将微卫星位点的平均缺失单元数作为特征值，无需使用参考样本，也不用比较每个位点的多态分布，检测原理简单，计算简便，对测序深度的要求低，临床可实施性好，稳定性高，检测结果准确可靠，与PCR金标准的一致性为100％。
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公开(公告)号：CN119418766A
公开(公告)日：2025-02-11
申请号：CN202411465822.7
申请日：2024-10-21
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司 , 上海安图生物技术有限公司
Abstract: 本发明涉及生物信息学技术领域，具体涉及一种超深度测序检测ctDNA的背景噪音突变过滤方法、计算机介质、计算机系统。本发明在所有目标位点向左右两侧延伸一段区域内的非目标区域上，根据突变方向分类，统计对应突变方向为背景突变的概率作为基线，基于目标位点测序深度、背景突变的概率构建模型，计算出突变为背景突变的最大突变次数作为区分真实突变和背景突变阈值。本发明区别于传统的依赖正常样本构建基线的背景噪音过滤方式，仅使用待测样本自身即可构建基线，并构建过滤模型，很好的区分了真实突变和背景突变；同时，本发明方法可通过具体的参数调整实现不同灵敏度和特异性的性能指标，以满足不同的应用场景需求。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN117976052A
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202311829123.1
申请日：2023-12-28
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
Abstract: 本发明属于生物信息学领域，具体公开了一种检测基因融合的方法及装置。本发明的方法通过合并成对的2条reads中存在重叠区域的split reads，再从中选择soft clip的碱基数大于特定阈值的split reads进行分析，提高了可利用split reads的占比，同时也使序列比对结果更加准确，从而提高了检测的灵敏度、特异性和稳定性。进一步通过区分几种融合重排方式，过滤掉不合理重排方式并设置质控标准，提高了检测的准确度和特异性，减少了假阳性结果。相较传统的寻找discordant reads或是对测序片段进行组装的方法，本发明的方法检测流程更短，能有效缩短检测周期，降低运算资源消耗。
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公开(公告)号：CN114464257A
公开(公告)日：2022-05-10
申请号：CN202210251396.1
申请日：2022-03-15
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
IPC: G16B20/30 , G06N20/00 , G06K9/62 , C12Q1/6869
Abstract: 本发明属于生物信息学技术领域，具体公开了一种基于二代测序的微卫星不稳定性检测方法及装置。本发明的检测方法利用二代测序技术获得的测序读段，先计算得到待测样本中每个候选微卫星位点的平均缺失单元数，据此检测每个微卫星位点的MSI状态，再以此评估待测样本的MSI状态。本发明将微卫星位点的平均缺失单元数作为特征值，无需使用参考样本，也不用比较每个位点的多态分布，检测原理简单，计算简便，对测序深度的要求低，临床可实施性好，稳定性高，检测结果准确可靠，与PCR金标准的一致性为100％。
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公开(公告)号：CN119724364A
公开(公告)日：2025-03-28
申请号：CN202411914152.2
申请日：2024-12-24
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
Abstract: 本申请公开了一种易混菌鉴定方法、装置、设备及介质，涉及微生物鉴定技术领域，包括获取原始质谱仪发送的质谱鉴定结果，判断质谱鉴定结果中是否存在易混菌，若质谱鉴定结果中存在易混菌，则判断模型库中是否存在与易混菌的类型相同的微差异分析模型；若模型库中存在与易混菌的类型相同的微差异分析模型，则调取微差异分析模型对易混菌进行分析鉴定，以得到模型分析鉴定结果；若模型库中不存在与易混菌的类型相同的微差异分析模型，则采用动态匹配算法对易混菌进行动态运算鉴定，或采用动态匹配算法并调取微差异分析模型对易混菌进行动态运算鉴定，以得到动态运算鉴定结果，提高基质辅助激光解吸飞行时间质谱仪对相近微生物鉴定的准确性和效率。
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公开(公告)号：CN117965526A
公开(公告)日：2024-05-03
申请号：CN202311871159.6
申请日：2023-12-29
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明属于生物检测技术领域，具体公开了一种病原微生物样本去宿主基因组核酸提取试剂、试剂盒及应用。本发明提供的核酸提取试剂包括去宿主基因组试剂和病原微生物核酸提取试剂，其中去宿主基因组试剂通过在含皂苷的去宿主裂解缓冲液中添加Tween系列表面活性剂，并进一步添加烷基糖苷，能够有效提高人源宿主核酸去除率，在不降低测序文库浓度的前提下提高病原微生物核酸占比，增强病原体检出能力。本发明将病原微生物核酸提取试剂中的裂解缓冲液和结合缓冲液合二为一，一方面能够简化试剂组成，降低成本，另一方面能够提高病原微生物核酸得率，提高测序文库浓度，增加测序数据比对到库占比，进一步提高病原微生物检出能力。
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公开(公告)号：CN114686589A
公开(公告)日：2022-07-01
申请号：CN202210257233.4
申请日：2022-03-16
Applicant: 郑州安图生物工程股份有限公司
IPC: C12Q1/6886 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06 , C12N15/11
Abstract: 本发明涉及分子诊断技术领域，具体涉及BRCA全外显子基因突变检测用组合物、试剂盒、测序文库构建方法。本发明组合物中特异性扩增引物对靶向区域包括全部编码区；外显子和内含子交界处±20bp；5UTR区：2号外显子全长+1号内含子至少20bp；3UTR区：终止密码子之后至少20bp；所有转录本的编码区的并集；以人基因组DNA为模板扩增获得的扩增子长度范围为120bp‑200bp，能够靶向捕获小片段DNA模板，应用在FFPE样本提取的DNA模板，提高模板利用率。
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