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公开(公告)号:CN113454234A
公开(公告)日:2021-09-28
申请号:CN202080014409.2
申请日:2020-02-12
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 艾琳·夏姆 , 克里斯蒂娜·范 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
摘要: 本文的公开内容包括用于标记核酸靶的系统、方法、组合物和试剂盒。在一些实施方案中,该方法包括在文库制备(例如,杂合体文库制备)期间使用靶特异性引物和靶非特异性引物。在一些实施方案中,该方法在cDNA文库制备和/或测序文库制备期间增加了选择的低丰度靶的丰度。
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公开(公告)号:CN117056774A
公开(公告)日:2023-11-14
申请号:CN202310996650.5
申请日:2017-11-07
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 胡静 , 克里斯蒂娜·范 , 大卫·罗森菲尔德 , 范珏 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号: G06F18/24 , G16B30/10 , G06F18/23 , C12Q1/6869
摘要: 本申请涉及用于细胞标记分类的方法。本文中公开了用于对细胞标记进行分类例如对信号细胞标记进行鉴定的方法和系统。在一些实施例中,该方法包括:获得使用细胞中的利用条形码被条形码化的靶创建的经条形码化的靶的测序数据,其中条形码包含细胞标记和分子标记。在对这些细胞标记分等级后,可以确定累积和图的二阶导数图的最小值。使用这些方法,基于与细胞标记相关联的具有不同序列的分子标记的数目和细胞标记阈值,可以将该细胞标记分类为信号细胞标记或噪声细胞标记。
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公开(公告)号:CN109906274B
公开(公告)日:2023-08-25
申请号:CN201780068299.6
申请日:2017-11-07
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 胡静 , 克里斯蒂娜·范 , 大卫·罗森菲尔德 , 范珏 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号: C12Q1/6869
摘要: 本文中公开了用于对细胞标记进行分类例如对信号细胞标记进行鉴定的方法和系统。在一些实施例中,该方法包括:获得使用细胞中的利用条形码被条形码化的靶创建的经条形码化的靶的测序数据,其中条形码包含细胞标记和分子标记。在对这些细胞标记分等级后,可以确定累积和图的二阶导数图的最小值。使用这些方法,基于与细胞标记相关联的具有不同序列的分子标记的数目和细胞标记阈值,可以将该细胞标记分类为信号细胞标记或噪声细胞标记。
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公开(公告)号:CN107407691B
公开(公告)日:2021-07-27
申请号:CN201680013557.6
申请日:2016-01-22
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 克里斯蒂娜·范 , 斯蒂芬·P·A·福多尔 , 格伦·弗 , 杰弗里·菲舍 , 戴维·斯特恩 , 贾尼斯·莱 , 阿瑞·钱尼 , 菲利普·斯普勒 , 李思行 , 黄小华 , 金柏莉·R·梅茨勒 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
摘要: 在此披露了包括如下项的装置和系统:a)基底,所述基底包括至少100个微孔和多个珠,其中多个所述至少100个微孔各自含有单一珠,并且其中所述微孔的平均直径与所述珠的直径的比率在约1.2至约1.8的范围内;b)与所述基底流体连通的流动池;以及c)至少一个入口和至少一个出口,其中所述至少一个入口和至少一个出口能够引导流体流通过所述流动池,从而使所述微孔与所述流体接触。
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公开(公告)号:CN112840024A
公开(公告)日:2021-05-25
申请号:CN201980065685.9
申请日:2019-07-29
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克 , 艾琳·夏姆 , 克里斯蒂娜·张 , 克里斯蒂娜·范
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C12Q1/6869
摘要: 本文公开了适用于在单一步骤中进行单个核捕获和条形码化的方法、组合物和试剂盒。在一些实施方案中,该方法包括使用核分离组合物分离核。核分离组合物可以包含能够与核的一种或更多种组分特异性结合的核结合试剂。该方法可以包括使用条形码将核中的靶条形码化,以产生用于测序分析的条形码化靶。
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公开(公告)号:CN112272710A
公开(公告)日:2021-01-26
申请号:CN201980037175.0
申请日:2019-05-01
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 克里斯蒂娜·范 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
IPC分类号: C12Q1/6806 , C12Q1/6869
摘要: 本文披露内容包括用于样品分析,特别是单细胞分析的系统、方法、组合物和试剂盒。包含捕获序列(或其互补序列)的核酸片段可由双链基因组脱氧核糖核酸(gDNA)例如使用转座体产生,进行条形码化以产生具有细胞标记/标识符的单链DNA(ssDNA)片段,并测序。可以基于获得的测序数据中的ssDNA片段的序列来确定与所述gDNA相关的(例如,基因组、染色质可接近性、甲基化组)信息。
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公开(公告)号:CN107407691A
公开(公告)日:2017-11-28
申请号:CN201680013557.6
申请日:2016-01-22
申请人: 贝克顿迪金森公司
发明人: 克里斯蒂娜·范 , 斯蒂芬·P·A·福多尔 , 格伦·弗 , 杰弗里·菲舍 , 戴维·斯特恩 , 贾尼斯·莱 , 阿瑞·钱尼 , 菲利普·斯普勒 , 李思行 , 黄小华 , 金柏莉·R·梅茨勒 , 伊丽莎白·玛丽·瓦尔扎克
CPC分类号: C12N15/1065 , B01L3/502715 , B01L3/502738 , B01L3/502746 , B01L3/502761 , B01L2200/026 , B01L2200/0647 , B01L2300/06 , B01L2300/0654 , B01L2300/0819 , B01L2300/0877 , B01L2300/12 , B01L2300/18 , B01L2400/082 , C12Q1/6846 , C12Q1/6874 , G01N35/0098 , C12Q2521/107 , C12Q2525/173 , C12Q2525/185 , C12Q2531/113 , C12Q2535/122 , C12Q2563/143 , C12Q2563/149
摘要: 在此披露了包括如下项的装置和系统:a)基底,所述基底包括至少100个微孔和多个珠,其中多个所述至少100个微孔各自含有单一珠,并且其中所述微孔的平均直径与所述珠的直径的比率在约1.2至约1.8的范围内;b)与所述基底流体连通的流动池;以及c)至少一个入口和至少一个出口,其中所述至少一个入口和至少一个出口能够引导流体流通过所述流动池,从而使所述微孔与所述流体接触。
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