公开(公告)号：CN102628045A

公开(公告)日：2012-08-08

申请号：CN201210100786.5

申请日：2012-04-09

Applicant: 西北农林科技大学 ,  杨凌科元克隆股份有限公司

Inventor： 佟琪 ,  张涌 ,  余源 ,  王勇胜 ,  权富生 ,  苏峰 ,  刘军

IPC: C12N15/113 ,  C12N15/63 ,  C12N5/10

Abstract: 本发明公开了一种干扰BVDV复制的shRNA表达载体及构建的重组细胞，针对BVDV的不同区域设计了不同的shRNA片段。shRNA在宿主细胞内转录后经剪切加工后形成siRNA，作用于病毒RNA的不同区域，干扰病毒的复制和表达。由于在牛肾脏细胞、睾丸细胞等存在BVDV细胞表面受体，因此BVDV对胎牛肾脏细胞、睾丸细胞最敏感，那么牛胎儿成纤维细胞做为体细胞核移植的供体细胞，进行诱导重编程之后形成的了转基因克隆牛完整的个体，其肾脏等BVDV敏感器官具有抑制该病毒表达的能力。

公开(公告)号：CN107145767A

公开(公告)日：2017-09-08

申请号：CN201710250569.7

申请日：2017-04-17

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 张涌 ,  陈奇 ,  佟琪

IPC: G06F19/22

CPC classification number: G06F19/22

Abstract: 本发明公开了一种通用RGEN基因编辑靶位点快速筛选系统。本发明通过“流水‑管道”设计思想，设计了碱基模式匹配模块、GC含量分析模块、连续n个相同碱基识别模块，形成了一个兼容性强、方便快捷并且适用于大规模数据分析的系统。支持任意模式序列在全基因组范围的匹配与查找，有效应对RNA介导核酸内切酶的快速发展。极大改善目前现有核酸内切酶工具仅能以有限模式和低通量筛选靶位点的现状。另外，本系统的模块构架及相关算法也适用于解决从任意长度字符串中抓取特定要求的子字符串这一类问题。

公开(公告)号：CN107145767B

公开(公告)日：2018-09-25

申请号：CN201710250569.7

申请日：2017-04-17

Applicant: 西北农林科技大学

Inventor： 张涌 ,  陈奇 ,  佟琪

IPC: G06F19/22

Abstract: 本发明公开了一种通用RGEN基因编辑靶位点快速筛选系统。本发明通过“流水‑管道”设计思想，设计了碱基模式匹配模块、GC含量分析模块、连续n个相同碱基识别模块，形成了一个兼容性强、方便快捷并且适用于大规模数据分析的系统。支持任意模式序列在全基因组范围的匹配与查找，有效应对RNA介导核酸内切酶的快速发展。极大改善目前现有核酸内切酶工具仅能以有限模式和低通量筛选靶位点的现状。另外，本系统的模块构架及相关算法也适用于解决从任意长度字符串中抓取特定要求的子字符串这一类问题。

公开(公告)号：CN103820494B

公开(公告)日：2016-03-02

申请号：CN201410073055.5

申请日：2014-02-28

Applicant: 西北农林科技大学 ,  杨凌科元克隆股份有限公司

Inventor： 张涌 ,  余源 ,  李仲夏 ,  佟琪 ,  王易之 ,  王勇胜 ,  刘军 ,  权富生 ,  郭泽坤

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/66

Abstract: 本发明公开了一种可去除随机整合的位点特异性整合载体及其构建方法和应用，包括pUC ori、attB序列和多克隆位点MCS，在attB序列上下游分别设有第一loxP序列和第一rox序列，CMV启动子连接在第一loxP序列的上游，负筛选基因与第一rox序列相连接，负筛选基因下游还连接有内核糖体结合位点IRES2，IRES2下游为荧光标记基因，荧光标记基因下游为MCS，MCS上下游分别设有第二rox序列和第二loxP序列，并且分别与第一rox序列和第一loxP序列方向相同，MCS下游为正筛选元件。本发明为在细胞筛选中提供剔除随机整合重组细胞而直接筛选出假attP位点特异整合的重组细胞的新的应用。

公开(公告)号：CN103820494A

公开(公告)日：2014-05-28

申请号：CN201410073055.5

申请日：2014-02-28

Applicant: 西北农林科技大学 ,  杨凌科元克隆股份有限公司

Inventor： 张涌 ,  余源 ,  李仲夏 ,  佟琪 ,  王易之 ,  王勇胜 ,  刘军 ,  权富生 ,  郭泽坤

IPC: C12N15/85 ,  C12N15/66

Abstract: 本发明公开了一种可去除随机整合的位点特异性整合载体及其构建方法和应用，包括pUC？ori、attB序列和多克隆位点MCS，在attB序列上下游分别设有第一loxP序列和第一rox序列，CMV启动子连接在第一loxP序列的上游，负筛选基因与第一rox序列相连接，负筛选基因下游还连接有内核糖体结合位点IRES2，IRES2下游为荧光标记基因，荧光标记基因下游为MCS，MCS上下游分别设有第二rox序列和第二loxP序列，并且分别与第一rox序列和第一loxP序列方向相同，MCS下游为正筛选元件。本发明为在细胞筛选中提供剔除随机整合重组细胞而直接筛选出假attP位点特异整合的重组细胞的新的应用。