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公开(公告)号：CN114214448A
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN202111275901.8
申请日：2021-10-29
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院 , 武汉大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供一种用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用。所述SNP标记位于水稻4号染色体第946632bp处，多态性为A/G。本发明针对该SNP位点设计相应的KASP检测引物，通过检测该SNP位点的多态性判断检测植株是否含有水稻抗褐飞虱基因Bph30。本发明提供的SNP标记可以有效鉴别植株中抗褐飞虱基因Bph30基因型。本发明提供的SNP标记及其KASP引物具有操作简单、成本低廉、周期短等优点，且该标记位于Bph30基因内，稳定性好，不受其他基因效应或环境因素的影响，应用于分子辅助选择中，可加快Bph30基因在抗飞虱育种中的应用，显著缩短抗褐飞虱水稻品种的选育周期，降低选育成本。
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公开(公告)号：CN114214448B
公开(公告)日：2023-10-13
申请号：CN202111275901.8
申请日：2021-10-29
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院 , 武汉大学
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供一种用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用。所述SNP标记位于水稻4号染色体第946632bp处，多态性为A/G。本发明针对该SNP位点设计相应的KASP检测引物，通过检测该SNP位点的多态性判断检测植株是否含有水稻抗褐飞虱基因Bph30。本发明提供的SNP标记可以有效鉴别植株中抗褐飞虱基因Bph30基因型。本发明提供的SNP标记及其KASP引物具有操作简单、成本低廉、周期短等优点，且该标记位于Bph30基因内，稳定性好，不受其他基因效应或环境因素的影响，应用于分子辅助选择中，可加快Bph30基因在抗飞虱育种中的应用，显著缩短抗褐飞虱水稻品种的选育周期，降低选育成本。
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公开(公告)号：CN117004755A
公开(公告)日：2023-11-07
申请号：CN202310832165.4
申请日：2023-07-07
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11 , C12R1/645
摘要： 本发明涉及基因组学、分子生物学、生物信息学和植物保护技术领域，具体涉及一种基于KASP技术的稻瘟病菌全基因组SNP分子标记开发及其应用。所述SNP分子标记的编号为BMSNP1‑BMSNP146，其信息如表1所示。利用本发明的SNP标记及其组合对不同病圃稻瘟病菌群体的遗传多样性、结构及其动态变化等进行分析，对揭示该病害流行与演化规律、抗病品种的选育、合理布局与轮换品种、延长品种的使用寿命及有效防治该病害具有重要指导意义。
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公开(公告)号：CN112746120B
公开(公告)日：2022-05-06
申请号：CN202011613354.5
申请日：2020-12-30
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及分子生物学及作物育种技术领域，具体涉及一种基于KASP技术水稻抗稻瘟病基因标记体系及其应用。本发明提供20种水稻抗稻瘟病基因SNP标记，用于扩增该SNP标记的KASP引物组序列如SEQ ID No.1‑60所示。采用本发明提供的KASP引物组可用于水稻分子标记辅助抗病育种，通过导入单个或聚合多个抗稻瘟病基因，实现水稻品种抗病性的定向改良或是培育新的抗病品种；也可对现有水稻品种和资源携带的抗稻瘟病基因类型、数量和组合进行全面系统地检测，为抗病基因及其供体的高效利用和水稻品种的合理布局提供数据支撑。
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公开(公告)号：CN109652579A
公开(公告)日：2019-04-19
申请号：CN201811525754.3
申请日：2018-12-13
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院 , 湖南杂交水稻研究中心
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用。水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记包括位于水稻第6号染色体第10389729～10389747bp处，多态性为5’-CAGGAATCTCAGATGG-3’/5’-TGTTATTCTCAGGTATTAT-3’和位于水稻第6号染色体第10452027bp处，多态性为A/G的分子标记。本发明提供的分子标记能够将Pi2与其它复等位基因进行有效鉴别，具有高度的特异性和准确性；本发明提供的Pi2基因型的检测方法通过扩增产物的电泳条带判定待测水稻材料的Pi2基因型，无需酶切，成本低廉，有利于缩短水稻的育种周期，降低育种成本。
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公开(公告)号：CN109468400A
公开(公告)日：2019-03-15
申请号：CN201811495414.0
申请日：2018-12-07
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记，包括标记SNP1和/或标记SNP2，其中，标记SNP1所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2886707碱基处，该处碱基为G或A；标记SNP2所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2888118碱基处，该处碱基为G或A。针对所述分子标记分别设计特异性扩增引物，通过PCR扩增进行Pi36基因型的检测。本发明的分子标记为共显性，可有效区分3种不同基因型，所述分子标记可用于选育抗稻瘟病水稻，缩短抗稻瘟病水稻的育种周期，加快育种速度，降低育种成本，具有操作简单，成本低廉，周期短等优点。
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公开(公告)号：CN109280718A
公开(公告)日：2019-01-29
申请号：CN201811259556.7
申请日：2018-10-26
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12Q1/6858 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及水稻温敏不育基因tms5的功能分子标记及其检测引物与应用。本发明提供一种水稻温敏不育基因tms5的SNP分子标记的检测引物，所述SNP分子标记包含第71位碱基的C/A多态性，所述检测引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1～4所示的第一引物、第二引物、第三引物和第四引物。本发明利用ARMS-PCR检测tms5基因携带的第71位碱基由C到A的功能突变，可以有效地避免假阳性，能够实现温敏不育性状的准确检测；并且检测结果可以直接根据琼脂糖凝胶电泳条带进行判断，检测程序简单易行，成本低廉，适于进行广泛推广应用。
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公开(公告)号：CN116287405A
公开(公告)日：2023-06-23
申请号：CN202310292101.X
申请日：2023-03-23
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及分子生物学及植物分子育种技术领域，具体公开了用于检测OsTCP19基因的KASP引物组合及其应用。本发明用于检测OsTCP19基因的KASP引物组合，其包括两条特异性引物和一条通用引物，其中，特异性引物的序列如SEQ ID NO.1‑2所示，通用引物的序列如SEQ ID NO.3所示；两条特异性引物分别标记产生不同荧光色的荧光报告基团。本发明针对OsTCP19基因功能变异开发的KASP引物组合，能特异区分OsTCP19基因优势等位和劣势等位，准确性好，可用于水稻早期对植株进行基因鉴定来筛选氮高效植株，节约了大量人力、物力成本，可高效运用于水稻商业化育种中氮高效利用品种的选育。
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公开(公告)号：CN109652579B
公开(公告)日：2022-05-06
申请号：CN201811525754.3
申请日：2018-12-13
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院 , 湖南杂交水稻研究中心
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明涉及水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记及其检测方法与应用。水稻抗稻瘟病基因Pi2的共显性分子标记包括位于水稻第6号染色体第10389729～10389747bp处，多态性为5’‑CAGGAATCTCAGATGG‑3’/5’‑TGTTATTCTCAGGTATTAT‑3’和位于水稻第6号染色体第10452027bp处，多态性为A/G的分子标记。本发明提供的分子标记能够将Pi2与其它复等位基因进行有效鉴别，具有高度的特异性和准确性；本发明提供的Pi2基因型的检测方法通过扩增产物的电泳条带判定待测水稻材料的Pi2基因型，无需酶切，成本低廉，有利于缩短水稻的育种周期，降低育种成本。
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公开(公告)号：CN109468400B
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN201811495414.0
申请日：2018-12-07
申请人： 袁隆平农业高科技股份有限公司 , 湖南隆平高科种业科学研究院有限公司 , 湖南亚华种业科学研究院
IPC分类号： C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要： 本发明提供水稻抗稻瘟病基因Pi36共显性分子标记，包括标记SNP1和/或标记SNP2，其中，标记SNP1所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2886707碱基处，该处碱基为G或A；标记SNP2所含的多态性位点位于相应于水稻日本晴8号染色体2888118碱基处，该处碱基为G或A。针对所述分子标记分别设计特异性扩增引物，通过PCR扩增进行Pi36基因型的检测。本发明的分子标记为共显性，可有效区分3种不同基因型，所述分子标记可用于选育抗稻瘟病水稻，缩短抗稻瘟病水稻的育种周期，加快育种速度，降低育种成本，具有操作简单，成本低廉，周期短等优点。
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