本发明提供一种用于鉴定水稻抗褐飞虱基因Bph30的SNP标记及其应用。所述SNP标记位于水稻4号染色体第946632bp处，多态性为A/G。本发明针对该SNP位点设计相应的KASP检测引物，通过检测该SNP位点的多态性判断检测植株是否含有水稻抗褐飞虱基因Bph30。本发明提供的SNP标记可以有效鉴别植株中抗褐飞虱基因Bph30基因型。本发明提供的SNP标记及其KASP引物具有操作简单、成本低廉、周期短等优点，且该标记位于Bph30基因内，稳定性好，不受其他基因效应或环境因素的影响，应用于分子辅助选择中，可加快Bph30基因在抗飞虱育种中的应用，显著缩短抗褐飞虱水稻品种的选育周期，降低选育成本。