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公开(公告)号:CN118272375A
公开(公告)日:2024-07-02
申请号:CN202410366608.X
申请日:2024-03-28
Applicant: 福建医科大学附属第一医院 , 福州大学
IPC: C12N15/113 , C12Q1/04 , C12R1/01
Abstract: 本发明涉及一种基于无细胞转录翻译系统的沙眼衣原体立足开关及其在检测沙眼衣原体中的应用。所述沙眼衣原体立足开关是根据沙眼衣原体保守序列DNA设计的具有立足结构的RNA序列,可与沙眼衣原体保守序列DNA所转录的RNA发生碱基互补配对,激活lacZ报告基因的表达;所述沙眼衣原体立足开关由sensor RNA和trigger RNA组成;所述sensor RNA为沙眼衣原体立足开关,由sensor DNA体外转录而来;所述trigger RNA用于激活沙眼衣原体立足开关,由trigger DNA体外转录而来。本发明将沙眼衣原体立足开关和无细胞转录翻译系统相结合,无需专门检测仪器和专业技术人员操作,为定性检测沙眼衣原体提供了一个简单的可肉眼观察的比色结果,具有便携、快速、低成本、实时检测等优势。
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公开(公告)号:CN108330213B
公开(公告)日:2021-07-13
申请号:CN201810352275.X
申请日:2018-04-19
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种同时进行HBV DNA定量、基因分型及RT区突变检测方法,其中采用了引物为F:5’ GCCTCAGTCCGTTTCTC 3’,R:5’ AAAGGGACTCAAGATGTTGT 3’,以及体系A和体系B的探针,引入探针熔解曲线法结合COLD‑PCR,用于HBV RT区179~191、193~208已知及未知的突变DNA的定量检测(该RT区的准种差异最具显著性)。本方法不需要添加昂贵的设备,仅通过反应体系的优化和后期熔解曲线分析,就可实现对低比例突变株的灵敏检测,特别适合在普通的临床基因扩增实验室推广开展。
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公开(公告)号:CN102230020B
公开(公告)日:2013-05-22
申请号:CN201110135296.4
申请日:2011-05-24
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 本发明提供了一种检测乙肝病毒YMDD耐药突变的方法,该方法利用RT-ARMS-qPCR方法检测乙肝病毒YMDD耐药突变。本发明采用序列特异性引物和荧光染料SYBRGreenⅠ进行扩增,实现了反应的实时监测,缩短检测时间,简化了操作步骤,而且不需要扩增后的分析过程,减少了产物污染的可能,与Taqman探针需双标记方法比较,SYBRGreenⅠ不需要设计合成荧光探针,简化了设计思路,成本较低。并结合熔解曲线分析,具有反应的特异性。
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公开(公告)号:CN103320531A
公开(公告)日:2013-09-25
申请号:CN201310249437.4
申请日:2013-06-22
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 乙型肝炎病毒基因突变是导致病毒耐药的基础,现阶段的检测技术存在着较低的灵敏度、价格较贵、操作不够简便、数据分析工作量大或存在碱基错配等缺点。本发明提供了一种高灵敏度的COLD-PCR联合测序技术并将其应用于HBV已知和未知多个耐药突变的检测,具有高度灵敏、简便、价廉和实用的优点。
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公开(公告)号:CN102140537B
公开(公告)日:2013-04-03
申请号:CN201110024107.6
申请日:2011-01-19
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 本发明提供了一种HBV基因分型的PCR检测方法。该方法根据乙型肝炎病毒基因型的全基因组序列设计引物;在上述引物的存在下,在荧光PCR仪中,对从血清样品提取的DNA进行PCR扩增,利用熔解曲线分析PCR产物,根据PCR产物的Tm值来判断基因型,实现乙型肝炎病毒的基因分型。本发明建立的PCR熔解曲线法操作简便,与商品化的基因分型试剂盒的检测结果相比有较高的符合率,可用于临床上HBV基因型的检测。本发明在利用PCR技术的基础上,建立了一种依据Tm值判断HBV基因型的PCR熔解曲线法,能简便快速、准确地鉴定HBV基因型。
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公开(公告)号:CN102230020A
公开(公告)日:2011-11-02
申请号:CN201110135296.4
申请日:2011-05-24
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 本发明提供了一种检测乙肝病毒YMDD耐药突变的方法,该方法利用RT-ARMS-qPCR方法检测乙肝病毒YMDD耐药突变。本发明采用序列特异性引物和荧光染料SYBRGreenⅠ进行扩增,实现了反应的实时监测,缩短检测时间,简化了操作步骤,而且不需要扩增后的分析过程,减少了产物污染的可能,与Taqman探针需双标记方法比较,SYBRGreenⅠ不需要设计合成荧光探针,简化了设计思路,成本较低。并结合熔解曲线分析,具有反应的特异性。
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公开(公告)号:CN108330213A
公开(公告)日:2018-07-27
申请号:CN201810352275.X
申请日:2018-04-19
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6851 , C12Q1/6858 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供一种同时进行HBV DNA定量、基因分型及RT区突变检测方法,其中采用了引物为F:5’GCCTCAGTCCGTTTCTC 3’,R:5’AAAGGGACTCAAGATGTTGT 3’,以及体系A和体系B的探针,引入探针熔解曲线法结合COLD-PCR,用于HBV RT区179~191、193~208已知及未知的突变DNA的定量检测(该RT区的准种差异最具显著性)。本方法不需要添加昂贵的设备,仅通过反应体系的优化和后期熔解曲线分析,就可实现对低比例突变株的灵敏检测,特别适合在普通的临床基因扩增实验室推广开展。
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公开(公告)号:CN103320531B
公开(公告)日:2015-07-29
申请号:CN201310249437.4
申请日:2013-06-22
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 乙型肝炎病毒基因突变是导致病毒耐药的基础,现阶段的检测技术存在着较低的灵敏度、价格较贵、操作不够简便、数据分析工作量大或存在碱基错配等缺点。本发明提供了一种高灵敏度的COLD-PCR联合测序技术并将其应用于HBV已知和未知多个耐药突变的检测,具有高度灵敏、简便、价廉和实用的优点。
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公开(公告)号:CN102140537A
公开(公告)日:2011-08-03
申请号:CN201110024107.6
申请日:2011-01-19
Applicant: 福建医科大学附属第一医院
Abstract: 本发明提供了一种HBV基因分型的PCR检测方法。该方法根据乙型肝炎病毒基因型的全基因组序列设计引物;在上述引物的存在下,在荧光PCR仪中,对从血清样品提取的DNA进行PCR扩增,利用熔解曲线分析PCR产物,根据PCR产物的Tm值来判断基因型,实现乙型肝炎病毒的基因分型。本发明建立的PCR熔解曲线法操作简便,与商品化的基因分型试剂盒的检测结果相比有较高的符合率,可用于临床上HBV基因型的检测。本发明在利用PCR技术的基础上,建立了一种依据Tm值判断HBV基因型的PCR熔解曲线法,能简便快速、准确地鉴定HBV基因型。
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