公开(公告)号：CN118360431A

公开(公告)日：2024-07-19

申请号：CN202410647596.8

申请日：2024-05-23

Applicant: 福建农林大学

Inventor： 赵新旺 ,  赵薇彤 ,  邓祖湖 ,  张木清 ,  徐良年 ,  黄国强 ,  黄潮华

IPC: C12Q1/6895 ,  C12Q1/6858

Abstract: 本发明公开了一套甘蔗品种真实性检测SNP标记及应用，包括177个核心SNP标记，SNP标记符合下述条件：F_MISSING≤0.3||MAF≥0.05，QUAL≥30.0||QD≥2.0||FS≤60.0||MQ≥40.0||SOR≤4.0条件；hwe平衡常数p≥0.01；均匀分布在甘蔗各染色体上且该位点上下100bp没有其他变异位点；采用LDR多重SNP分型试剂盒进行标记开发，能够转化成果的位点。本发明的优点：该套SNP标记组合建立DNA指纹图谱库，从而可以对甘蔗品种进行聚类分析和品种鉴定，使得检测结果更精准、高效；该套SNP标记稳定性好，均匀分布在甘蔗的80条染色体上，具有较好的可重复性；基于LDR技术的SNP引物组合在DNA质量满足常规PCR反应需求的情况下，对甘蔗品种检测的准确度和分辨率均很高，检测效率是SSR标记的10‑20倍，检测成本与SSR标记相当，检测过程更加快速、通量更高，同时检测过程中无需使用丙烯酰胺等有毒化学试剂，安全性高、环境友好。