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公开(公告)号:CN102212518B
公开(公告)日:2013-06-05
申请号:CN201010148985.4
申请日:2010-04-06
摘要: 本发明公开了一种小麦印度腥黑穗病菌检测标准分子,为能够进行复制的质粒,所述质粒中含有序列A和B中至少一种,A(Seq ID No.1)与小麦印度腥黑穗病菌线粒体DNA上一段2.3kb的核酸序列(AF218059)同源性为99.56%,B(Seq ID No.2)与小麦印度腥黑穗病菌核糖体内转录间隔区的DNA序列(AF399888)同源性为99.85%。本发明还公开了上述标准分子的制备和检测方法。本发明构建的标准分子可以代替小麦印度腥黑穗病菌DNA作为小麦印度腥黑穗病菌分子检测的阳性对照,适用于对小麦印度腥黑穗病菌的定性PCR和定量PCR检测,适合于口岸检验检疫、农业生产、植物保护等。
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公开(公告)号:CN102212611A
公开(公告)日:2011-10-12
申请号:CN201010149033.4
申请日:2010-04-06
摘要: 本发明公开了一种黑麦草腥黑粉菌检测的标准分子,为能够进行复制的质粒,且所述质粒中含有序列A(Seq ID No.1)和序列B(Seq ID No.2)中的至少一种。序列A与黑麦草腥黑粉菌线粒体DNA一段2.3kb的核酸序列同源性为99.65%,B与黑麦草腥黑粉菌核糖体内转录间隔区的DNA序列同源性为100%。本发明还公开了上述标准分子的制备方法和检测方法。本发明中构建的标准分子可以代替黑麦草腥黑粉菌DNA作为黑麦草腥黑粉菌分子检测的阳性对照,该标准分子适用于对黑麦草腥黑粉菌的定性PCR和定量PCR检测。该标准分子适合于口岸检验检疫、农业生产、植物保护等部门使用。
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公开(公告)号:CN102212518A
公开(公告)日:2011-10-12
申请号:CN201010148985.4
申请日:2010-04-06
摘要: 本发明公开了一种小麦印度腥黑穗病菌检测标准分子,为能够进行复制的质粒,所述质粒中含有序列A和B中至少一种,A(Seq ID No.1)与小麦印度腥黑穗病菌线粒体DNA上一段2.3kb的核酸序列(AF218059)同源性为99.56%,B(Seq ID No.2)与小麦印度腥黑穗病菌核糖体内转录间隔区的DNA序列(AF399888)同源性为99.85%。本发明还公开了上述标准分子的制备和检测方法。本发明构建的标准分子可以代替小麦印度腥黑穗病菌DNA作为小麦印度腥黑穗病菌分子检测的阳性对照,适用于对小麦印度腥黑穗病菌的定性PCR和定量PCR检测,适合于口岸检验检疫、农业生产、植物保护等。
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公开(公告)号:CN106636352A
公开(公告)日:2017-05-10
申请号:CN201611000084.4
申请日:2016-11-14
CPC分类号: C12Q1/6869 , C12Q1/6895 , G06F19/20 , C12Q2531/113 , C12Q2535/122
摘要: 本申请公开了一种基于高通量测序技术的小麦病原微生物检测方法及其应用。本申请的检测方法,包括1)提取待检小麦或小麦筛下物的基因组DNA;2)采用真菌ITS区通用引物对基因组DNA进行PCR扩增建库;3)高通量测序;4)将高通量测序结果根据97%以上相似性进行聚类分析,根据分类单元分析取待检小麦样品或小麦筛下物样品的病原微生物群落。本申请的检测方法,利用高通量测序技术,对小麦或小麦筛下物的基因组DNA进行测序,并通过生物信息学分析得到OTU,全面的分析出小麦携带病原真菌情况,为评估其有害性和风险性奠定了基础,特别适用于进出境检验检疫等部门,以突破或制定出相应的技术壁垒,保障小麦生产和贸易的安全。
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公开(公告)号:CN102212611B
公开(公告)日:2013-02-20
申请号:CN201010149033.4
申请日:2010-04-06
摘要: 本发明公开了一种黑麦草腥黑粉菌检测的标准分子,为能够进行复制的质粒,且所述质粒中含有序列A(Seq ID No.1)和序列B(Seq ID No.2)中的至少一种。序列A与黑麦草腥黑粉菌线粒体DNA一段2.3kb的核酸序列同源性为99.65%,B与黑麦草腥黑粉菌核糖体内转录间隔区的DNA序列同源性为100%。本发明还公开了上述标准分子的制备方法和检测方法。本发明中构建的标准分子可以代替黑麦草腥黑粉菌DNA作为黑麦草腥黑粉菌分子检测的阳性对照,该标准分子适用于对黑麦草腥黑粉菌的定性PCR和定量PCR检测。该标准分子适合于口岸检验检疫、农业生产、植物保护等部门使用。
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公开(公告)号:CN110031438A
公开(公告)日:2019-07-19
申请号:CN201910320257.8
申请日:2019-04-19
摘要: 本申请公开了一种美澳型核果褐腐病菌的活性检测方法。本申请的活性检测方法包括采用荧光染料对美澳型核果褐腐病菌孢子进行染色,根据染色情况判断活性;荧光染料为碘化丙啶和/或荧光素双醋酸酯;碘化丙啶染色条件为终浓度0.00025mg/mL对孢子进行4min避光染色;荧光素双醋酸酯染色条件为终浓度0.0025mg/mL对孢子进行16min避光染色。本申请的活性检测方法,能直接观察孢子死活,操作简单,整个检测过程不足30分钟,提高了活性检测效率。本申请的活性检测方法具有快速、准确、灵敏、重复性好等优点,能替代传统形态学检测,为口岸检疫、农业生产、植物保护等部门提供了一种新的快速、有效的检测方法和途径。
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公开(公告)号:CN105734049B
公开(公告)日:2018-12-18
申请号:CN201610137584.6
申请日:2016-03-10
IPC分类号: C12N15/10 , C12Q1/6895 , C12N15/11
摘要: 本申请公开了一种DNA条形码制备方法及草莓疫霉红心病菌DNA条形码。本申请的制备方法,包括用高通量测序技术对靶标菌株基因组DNA进行测序,并对测序结果进行生物信息学分析,采用系统进化树分析基因组DNA中各基因片段进化关系,获得靶标菌株与同属菌株的相似度大于或等于95%、小于100%,片段不大于1000bp的单拷贝基因片段,对单拷贝基因片段进行遗传距离分析,能真实反映亲缘关系的即靶标菌株DNA条形码。本申请的制备方法,利用高通量测序技术对基因组DNA进行全面分析,并用系统进化树和遗传距离分析,获得DNA条形码;为DNA条形码制备提供了一种简单、有效途径;获得的DNA条形码能最有效表征靶标菌株。
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公开(公告)号:CN101857904B
公开(公告)日:2013-10-16
申请号:CN200910106536.0
申请日:2009-04-10
摘要: 本发明涉及一种同时检测烟草环斑病毒、南方菜豆花叶病毒、番茄环斑病毒、南芥菜花叶病毒四种中一种或多种大豆病毒病害的简单、快速、特异、灵敏的实时荧光PCR检测方法及其试剂盒。所述实时荧光PCR检测方法使用SEQ ID NO:1、SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3、SEQ ID NO:4、SEQID NO:5、SEQ ID NO:6、SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8中的引物序列和SEQID NO:9、SEQ ID NO:10、SEQ ID NO:11、SEQ ID NO:12中的寡核苷酸探针。本发明的实时荧光PCR检测方法及其试剂盒适合于口岸检验检疫、农业生产、植物保护等部门使用。
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公开(公告)号:CN101798593B
公开(公告)日:2012-10-03
申请号:CN200910246404.8
申请日:2009-11-19
摘要: 一种大豆锈病菌的检测引物、试剂盒以及实时PCR检测方法,引物包括正向引物Rs-F和反向引物Rs-R,正向引物的序列是:5’-GTGCACTTTATTGTGGCTCAAAACT-3’;反向引物的序列是:5’-ATGATTAATAGGTGGGTTGCAGC-3’。检测方法依次有合成引物、待测物中加入引物、扩增反应:包括预变性、重复进行一个反应区间、对PCR仪自动记录的反应结果进行HRM分析。具有检测简单、快速、准确、特异性强、灵敏度高、重复性好、易于推广应用的优点,可广泛用于对实际检疫和田间调查过程中所发现的病组织进行大豆锈病菌分子生物学鉴定或检测,特别适用于口岸检疫等时效性要求特别强的场合使用。
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