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公开(公告)号：CN117524352A
公开(公告)日：2024-02-06
申请号：CN202311571270.3
申请日：2023-11-23
Applicant: 浙江大学
IPC: G16C20/50 , G16C20/70 , G06N3/0455 , G06N3/08
Abstract: 本发明公开一种基于图神经网络扩散模型的PROTAC分子设计方法，具体为：将两个待处理配体片段分子图输入到经过训练的最优三维等变的分子图神经网络扩散模型中，根据化学连接体片段分子图中的原子的数值设计符合配体片段分子图的化学连接体片段，输出化学连接体片段预测分子图，将该预测分子图输入至化学键重建模块中以获取其键级信息，而后将待处理化学连接体片段分子图的键级信息与两个待处理配体片段分子图进行融合，得到完整的蛋白降解靶向嵌合体分子结构，完成PROTAC分子设计。本发明将三维等变的分子图神经网络扩散模型运用到蛋白降解靶向嵌合体化合物分子设计中为该类型的药物分子设计及筛选提供了重要的解决思路。
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