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公开(公告)号:CN107881221A
公开(公告)日:2018-04-06
申请号:CN201711487999.7
申请日:2017-12-29
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6848 , C12Q1/6893
CPC classification number: Y02A50/451 , C12Q1/6848 , C12Q1/6893 , C12Q2549/119 , C12Q2537/165
Abstract: 本发明公开了一种基于Lectin 基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法,具体步骤如下:(1)基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,确定待测样品是否为隐孢子虫阳性,以及属于哪一种隐孢子虫种;(2)若待测样品属于C. parvum、C. hominis、C. cuniculus、horse genotype或驴源C. hominis中的一种,则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明,Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA 序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度,可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。
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公开(公告)号:CN106119355A
公开(公告)日:2016-11-16
申请号:CN201610492725.6
申请日:2016-06-27
Applicant: 河南农业大学
CPC classification number: Y02A50/451 , C12Q1/6893 , C12N15/1003 , C12Q1/686 , C12Q2565/625 , C12Q2527/125
Abstract: 本发明属于生物技术领域,涉及一种基于FTA卡检测粪便中隐孢子虫卵囊的方法。步骤如下:纯化收集隐孢子虫卵囊,计数稀释后,定量污染粪便后涂抹于FTA卡上备用;将阳性粪便样品涂抹于FTA卡上备用;用FTA卡收集新鲜粪便备用;在FTA卡上打孔,并洗脱FTA圆片;以清洗好的FTA卡片为DNA模板,以根据隐孢子虫18SrRNA设计的引物进行PCR扩增,然后进行琼脂糖凝胶电泳检测。本发明代替了传统商业化粪便DNA提取试剂盒提取DNA时繁琐的步骤和高昂的价格,具有成本低廉,方便快捷的优点。
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公开(公告)号:CN107881221B
公开(公告)日:2021-03-02
申请号:CN201711487999.7
申请日:2017-12-29
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12Q1/6848 , C12Q1/6893
Abstract: 本发明公开了一种基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法,具体步骤如下:(1)基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,确定待测样品是否为隐孢子虫阳性,以及属于哪一种隐孢子虫种;(2)若待测样品属于C.parvum、C.hominis、C.cuniculus、horse genotype或驴源C.hominis中的一种,则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明,Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度,可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。
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公开(公告)号:CN105907751A
公开(公告)日:2016-08-31
申请号:CN201610509281.2
申请日:2016-06-27
Applicant: 河南农业大学
IPC: C12N15/10
CPC classification number: C12N15/1006 , C12Q2523/308
Abstract: 本发明属于分子生物学领域,涉及一种基于FTA卡提取DNA的方法,具体涉及一种基于FTA卡从粪便中提取隐孢子虫卵囊DNA的方法。提取步骤如下:收集经隐孢子虫卵囊感染成功后的犊牛粪便,获得隐孢子虫卵囊,定量污染粪便;将奶牛粪便涂抹于FTA卡上,常温晾干FTA卡,打孔获得FTA圆片;将获得的FTA圆片分别放入离心管内,去污并清洗,加入FTA卡清洗液,室温孵育后加入1×TE溶液,室温孵育,将清洗后的FTA圆片完全干燥,完成粪便中隐孢子虫卵囊DNA的提取。本发明只需携带FTA卡到养殖场采集粪便样本,经FTA洗脱液和其他有机溶液清洗后,可将FTA卡片用作DNA模板进行PCR扩增,成本低廉,方便快捷。
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