基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法

    公开(公告)号:CN107881221A

    公开(公告)日:2018-04-06

    申请号:CN201711487999.7

    申请日:2017-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种基于Lectin 基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法,具体步骤如下:(1)基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,确定待测样品是否为隐孢子虫阳性,以及属于哪一种隐孢子虫种;(2)若待测样品属于C. parvum、C. hominis、C. cuniculus、horse genotype或驴源C. hominis中的一种,则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明,Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA 序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度,可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。

    基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法

    公开(公告)号:CN107881221B

    公开(公告)日:2021-03-02

    申请号:CN201711487999.7

    申请日:2017-12-29

    Abstract: 本发明公开了一种基于Lectin基因对部分隐孢子虫种类的分子鉴定方法,具体步骤如下:(1)基于SSU rRNA基因对待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,确定待测样品是否为隐孢子虫阳性,以及属于哪一种隐孢子虫种;(2)若待测样品属于C.parvum、C.hominis、C.cuniculus、horse genotype或驴源C.hominis中的一种,则基于Lectin基因对同种隐孢子虫不同分离株的待测样品进行巢式PCR扩增,测序比对,通过待测样品的Lectin基因位点上的连续的CAA三联密码子的个数确定待测样品是否为同种隐孢子虫不同分离株。本发明经序列比对及进化树结果表明,Lectin基因作隐孢子虫鉴定工具用于SSU rRNA序列相近隐孢子虫种的鉴定有更好的区分度,可望为隐孢子虫的分子流行病学、群体遗传分析增添新的分子工具。

    基于FTA卡从粪便中提取隐孢子虫卵囊DNA的方法

    公开(公告)号:CN105907751A

    公开(公告)日:2016-08-31

    申请号:CN201610509281.2

    申请日:2016-06-27

    CPC classification number: C12N15/1006 C12Q2523/308

    Abstract: 本发明属于分子生物学领域,涉及一种基于FTA卡提取DNA的方法,具体涉及一种基于FTA卡从粪便中提取隐孢子虫卵囊DNA的方法。提取步骤如下:收集经隐孢子虫卵囊感染成功后的犊牛粪便,获得隐孢子虫卵囊,定量污染粪便;将奶牛粪便涂抹于FTA卡上,常温晾干FTA卡,打孔获得FTA圆片;将获得的FTA圆片分别放入离心管内,去污并清洗,加入FTA卡清洗液,室温孵育后加入1×TE溶液,室温孵育,将清洗后的FTA圆片完全干燥,完成粪便中隐孢子虫卵囊DNA的提取。本发明只需携带FTA卡到养殖场采集粪便样本,经FTA洗脱液和其他有机溶液清洗后,可将FTA卡片用作DNA模板进行PCR扩增,成本低廉,方便快捷。

Patent Agency Ranking