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公开(公告)号：CN114277092A
公开(公告)日：2022-04-05
申请号：CN202111473132.2
申请日：2021-12-02
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要： 本发明属于基因测序领域，具体涉及一种纳米孔测序平台的RNA病毒宏转录组建库方法。针对纳米孔测序平台通量低、临床样本宿主含量高和总RNA中包含大量核糖体RNA问题，通过反向富集等，对临床样本进行不完全宿主细胞DNA去除以及核糖体RNA去除；针对临床样本病毒载量低以及RNA病毒基因组多样性高问题，采用单引物等温扩增等主动正向富集cDNA。本发明通过正、反向富集步骤，成功搭建了纳米孔测序平台RNA病毒宏转录组建库检测流程，满足了临床对于未知RNA病毒病原体的快速鉴定，适用于推广应用。
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公开(公告)号：CN114277092B
公开(公告)日：2023-03-24
申请号：CN202111473132.2
申请日：2021-12-02
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司 , 江苏先声诊断医疗器械有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C12Q1/6869 , C40B50/06
摘要： 本发明属于基因测序领域，具体涉及一种纳米孔测序平台的RNA病毒宏转录组建库方法。针对纳米孔测序平台通量低、临床样本宿主含量高和总RNA中包含大量核糖体RNA问题，通过反向富集等，对临床样本进行不完全宿主细胞DNA去除以及核糖体RNA去除；针对临床样本病毒载量低以及RNA病毒基因组多样性高问题，采用单引物等温扩增等主动正向富集cDNA。本发明通过正、反向富集步骤，成功搭建了纳米孔测序平台RNA病毒宏转录组建库检测流程，满足了临床对于未知RNA病毒病原体的快速鉴定，适用于推广应用。
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公开(公告)号：CN113249440B
公开(公告)日：2022-03-22
申请号：CN202110650442.0
申请日：2021-06-10
申请人： 南京先声医学检验实验室有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明提供了一种基于纳米孔测序平台的组织样本宏基因组建库和检测方法。本发明测试不同破碎管对组织以及病原体的破碎效果，发现Lysing Matrix A管可替代常规的组织研磨加Proteinase K消化过程做到组织匀浆，最终选用Lysing Matrix A管进行组织破碎匀浆后，选用Lysing Matrix E管进行病原体破壁，压缩了组织样本的后续宏基因组快速建库和测序时间，满足了临床对于感染样本检测的需求，适于推广应用。
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公开(公告)号：CN113249440A
公开(公告)日：2021-08-13
申请号：CN202110650442.0
申请日：2021-06-10
申请人： 南京先声医学检验实验室有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声诊断技术有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明提供了一种基于纳米孔测序平台的组织样本宏基因组建库和检测方法。本发明测试不同破碎管对组织以及病原体的破碎效果，发现Lysing Matrix A管可替代常规的组织研磨加Proteinase K消化过程做到组织匀浆，最终选用Lysing Matrix A管进行组织破碎匀浆后，选用Lysing Matrix E管进行病原体破壁，压缩了组织样本的后续宏基因组快速建库和测序时间，满足了临床对于感染样本检测的需求，适于推广应用。
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公开(公告)号：CN112029823A
公开(公告)日：2020-12-04
申请号：CN202010919810.2
申请日：2020-09-03
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明涉及一种纳米孔测序平台的宏基因组建库方法及其试剂盒。通过对建库中的末修连接以及PCR扩增等进行优化调整，本发明的建库方法及其试剂盒有效降低了建库起始量，提高了测序数据读长和质量，压缩了建库和测序时间，节约了测序成本，同时还提高整个流程的灵敏度，满足了临床对于感染检测的要求，适于推广应用。
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公开(公告)号：CN111681711A
公开(公告)日：2020-09-18
申请号：CN202010600299.X
申请日：2020-06-28
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司
IPC分类号： G16B40/10 , G16B30/10 , C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12Q1/686
摘要： 本发明提供一种兼并引物的设计筛选方法。本发明所述方法通过多重比对、k-mer划分、制备兼并k-mer、获得候选引物集以及组合引物对等步骤，实现对多种物种基因设计兼并引物，并筛选出最佳兼并引物对。
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公开(公告)号：CN112029823B
公开(公告)日：2021-07-23
申请号：CN202010919810.2
申请日：2020-09-03
申请人： 江苏先声医疗器械有限公司 , 江苏先声医学诊断有限公司 , 北京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806 , C40B50/06
摘要： 本发明涉及一种纳米孔测序平台的宏基因组建库方法及其试剂盒。通过对建库中的末修连接以及PCR扩增等进行优化调整，本发明的建库方法及其试剂盒有效降低了建库起始量，提高了测序数据读长和质量，压缩了建库和测序时间，节约了测序成本，同时还提高整个流程的灵敏度，满足了临床对于感染检测的要求，适于推广应用。
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公开(公告)号：CN117126920B
公开(公告)日：2024-04-12
申请号：CN202310943705.6
申请日：2023-07-31
申请人： 江苏先声医学诊断有限公司 , 江苏先声医疗器械有限公司 , 南京先声医学检验实验室有限公司
IPC分类号： C12Q1/6806
摘要： 本申请属于微生物检测领域，具体提供一种基于纳米孔测序平台中枢神经感染脑脊液样本病原体的建库和检测方法。本方法结合纳米孔测序平台优势，将快速PCR条码试剂盒和PCR‑cDNA条码试剂盒联合使用一并混库上机，成功搭建基于纳米孔测序平台的中枢神经感染病原体建库和检测方法，既满足低起始量脑脊液样本的宏基因组检测需求，又显著提高脑脊液样本难检病原体检出的灵敏度。
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