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公开(公告)号：CN106148527A
公开(公告)日：2016-11-23
申请号：CN201610543110.1
申请日：2016-07-11
Applicant: 扬州大学
Abstract: 本发明提供用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记为，硬脂酰辅酶A去饱和酶SCD1基因(NC_007327)在8586bp的一个碱基C→T的SNP突变，导致蛋白质肽链中878位氨基酸‑丙氨酸(alanine)突变为缬氨酸(valine)。其用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记的检测方法包括：1)以从样品提取DNA为样本，使用用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记引物进行PCR扩增；2)检测步骤1)中所获得的PCR产物的序列，根据分子标记，即：SCD1基因(NC_007327)在8586bp的SNP突变，判定其样品的基因型为CC，CT或者TT型，对降低奶牛泰勒虫病进行辅助选择，其中CC型感染率最高，TT型感染率最低。该分子标记及其检测方法具有更高的准确性和可信度，可以有效地针对奶牛泰勒虫病的易感性对种牛进行辅助选择。
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公开(公告)号：CN104561261A
公开(公告)日：2015-04-29
申请号：CN201410629821.1
申请日：2014-11-10
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/68
Abstract: 本发明提供了一种检测奶牛乳腺组织lncRNA基因芯片的设计方法，以1头正常泌乳奶牛和1头患有乳房炎奶牛为样本，取其乳腺组织，提取其总RNA，并混合；去核糖体RNA，再去含polyA的RNA；得到的mRNA随机打断成为短片段，合成cDNA第一链、cDNA第二链，洗脱经末端修复、加碱基A，加测序接头，降解第二条链；进行片段大小选择，PCR扩增，构建文库；建好的测序文库进行测序；然后获取Clean reads、Cufflinks重构转录本、non-coding RNA库注释，进行蛋白库比对，过滤和去除mRNA，经CPC预测，得到Long Chain Non-Coding RNA预测序列结果文件；根据牛编码蛋白质的基因序列和lncRNA序列，开发并设计同时检测奶牛乳腺组织lncRNA和mRNA的芯片。可以满足有关牛乳腺组织lncRNA的研究，对牛其它组织器官lncRNA表达、功能等方面的研究也有借鉴作用。
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公开(公告)号：CN105368941B
公开(公告)日：2018-10-09
申请号：CN201510770238.7
申请日：2015-11-12
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6858 , C12Q1/6888
Abstract: 本发明提供一种对奶牛生产寿命进行辅助选择的检测方法，包括以下步骤：1)从样品中提取DNA；2)以提取的DNA为样本，使用用于奶牛生产寿命辅助选择的分子标记引物进行PCR扩增；3)检测步骤2)中的PCR产物的序列，根据CXCR1基因第816位点的SNP突变，判定其样品的基因型为AA，AC或者CC型。本发明首次披露了CXCR1‑816的SNP突变位点的基因型在对奶牛生产寿命进行辅助选择方面的应用。相比于现有技术，本发明设计分子标记引物时使用的CXCR1基因与奶牛生产性能、免疫和疾病等性状密切相关，其SNP突变标记点与奶牛生产寿命显著相关，具有更高的准确性和可信度，因而可以有效地针对奶牛生产寿命对种牛进行辅助选择，以提高后代奶牛的生产寿命，并间接地提高产值。
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公开(公告)号：CN106148527B
公开(公告)日：2019-09-20
申请号：CN201610543110.1
申请日：2016-07-11
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/6883 , C12N15/11
Abstract: 本发明提供用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记为，硬脂酰辅酶A去饱和酶SCD1基因(NC_007327)在8586bp的一个碱基C→T的SNP突变，导致蛋白质肽链中878位氨基酸‑丙氨酸(alanine)突变为缬氨酸(valine)。其用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记的检测方法包括：1)以从样品提取DNA为样本，使用用于降低奶牛泰勒虫病辅助选择的分子标记引物进行PCR扩增；2)检测步骤1)中所获得的PCR产物的序列，根据分子标记，即：SCD1基因(NC_007327)在8586bp的SNP突变，判定其样品的基因型为CC，CT或者TT型，对降低奶牛泰勒虫病进行辅助选择，其中CC型感染率最高，TT型感染率最低。该分子标记及其检测方法具有更高的准确性和可信度，可以有效地针对奶牛泰勒虫病的易感性对种牛进行辅助选择。
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公开(公告)号：CN105368941A
公开(公告)日：2016-03-02
申请号：CN201510770238.7
申请日：2015-11-12
Applicant: 扬州大学
IPC: C12Q1/68
CPC classification number: C12Q1/6888 , C12Q1/6872 , C12Q2600/124 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明提供一种对奶牛生产寿命进行辅助选择的检测方法，包括以下步骤：1)从样品中提取DNA；2)以提取的DNA为样本，使用用于奶牛生产寿命辅助选择的分子标记引物进行PCR扩增；3)检测步骤2)中的PCR产物的序列，根据CXCR1基因第816位点的SNP突变，判定其样品的基因型为AA，AC或者CC型。本发明首次披露了CXCR1-816的SNP突变位点的基因型在对奶牛生产寿命进行辅助选择方面的应用。相比于现有技术，本发明设计分子标记引物时使用的CXCR1基因与奶牛生产性能、免疫和疾病等性状密切相关，其SNP突变标记点与奶牛生产寿命显著相关，具有更高的准确性和可信度，因而可以有效地针对奶牛生产寿命对种牛进行辅助选择，以提高后代奶牛的生产寿命，并间接地提高产值。
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