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公开(公告)号:CN119323990A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202411257072.4
申请日:2024-09-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 澳门科技大学 , 广州国家实验室
Abstract: 本申请涉及一种抗原预测模型处理方法、装置、设备和可读存储介质。所述方法包括:获取训练样本集合;训练样本集合包括蛋白序列特征矩阵以及与蛋白序列特征矩阵对应的抗原距离标签向量;蛋白序列特征矩阵包含多个蛋白序列特征向量;针对多个蛋白序列特征向量的任一蛋白序列特征向量,根据抗原距离标签向量与任一蛋白序列特征向量对应的归一化特征向量的内积,从多个蛋白序列特征向量中确定出关键蛋白序列特征向量;根据关键蛋白序列特征向量,确定预设的抗原预测模型;预设的抗原预测模型用于输出待检测蛋白序列特征矩阵的抗原预测结果。采用本方法能够提高抗原预测模型的准确性。
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公开(公告)号:CN119323991A
公开(公告)日:2025-01-17
申请号:CN202411257074.3
申请日:2024-09-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州国家实验室 , 澳门科技大学
Abstract: 本申请涉及一种构建抗原变异预测模型及预测流感病毒抗原变异的方法和装置,构建抗原变异预测模型的方法包括:获取已知目标病毒对的抗原相似评分和抗原距离;基于已知目标病毒对的抗原相似评分和抗原距离构建预设函数,利用极大选择原则将预设函数进行自适应傅里叶分解,以获得多次极大选择得到的重要抗原位点集、正交系统和重要抗原位点相似评分集;基于重要抗原位点集、正交系统、重要抗原位点相似评分集以及已知目标病毒对的抗原距离构建抗原变异预测模型。本申请结合了自适应傅里叶分解的优选原理和重新排序思想,实现了用较少的线性组合建立预测模型,具有广泛适用性和数据选取的灵活性,提高了模型精度及收敛性。
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公开(公告)号:CN119314560A
公开(公告)日:2025-01-14
申请号:CN202411257082.8
申请日:2024-09-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 广州国家实验室 , 澳门科技大学
Abstract: 本申请涉及一种流感抗原预测模型处理方法、装置、设备和可读存储介质。所述方法包括:获取训练样本集合;训练样本集合包括多个矩阵组,矩阵组包括蛋白序列特征矩阵以及与蛋白序列特征矩阵对应的抗原距离标签向量;根据各个矩阵组包括的蛋白序列特征矩阵中的局部关键蛋白序列特征向量,确定局部权重;将各个矩阵组包括的蛋白序列特征矩阵进行串联,得到全局蛋白序列特征矩阵,根据全局蛋白序列特征矩阵中的全局关键蛋白序列特征向量,确定全局权重;根据局部权重和全局权重,构建预设的流感抗原预测模型;预设的流感抗原预测模型用于输出待检测蛋白序列特征矩阵的抗原预测结果。采用本方法能够提高流感抗原预测模型的鲁棒性。
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公开(公告)号:CN117187197A
公开(公告)日:2023-12-08
申请号:CN202310994592.2
申请日:2023-08-09
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心) , 澳门科技大学
Abstract: 本发明提供了一种重组乙型流感病毒及其制备方法和应用,涉及分子生物学和基因工程技术领域。本发明提供了一种重组乙型流感病毒,包括乙型流感病毒临床分离株GZ0215改造后的PB2基因PB2/N460S和改造后的NP基因NP/I163T,以及乙型流感病毒临床分离株的其他六个基因;所述PB2/N460S和NP/I163T的核苷酸序列分别如SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.10所示。本发明通过在流感病毒聚合酶PB2与核蛋白NP基因中引入定点突变位点,提高了乙型流感病毒在小鼠体内的感染复制能力和致病力,可用于快速成功地构建乙型流感病毒小鼠感染模型,用于抗病毒药物和疫苗免疫效果的评估。
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公开(公告)号:CN116144612B
公开(公告)日:2023-11-10
申请号:CN202211571588.7
申请日:2022-12-08
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心)
Abstract: 本申请提供了一种重组乙型流感病毒及其制备方法与应用,所述重组乙型流感病毒携带一谱系乙型流感病毒的重组非结构蛋白,所述重组非结构蛋白嵌合有另一谱系乙型流感病毒的重组血凝素蛋白。该重组乙型流感病毒可自主生长复制,能同时表达两种谱系乙型流感病毒株的HA蛋白,且插入的外源HA融合基因具有良好的遗传稳定性。本申请获得的重组乙型流感病毒可作为乙型流感二价疫苗的候选毒株,具有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN116144612A
公开(公告)日:2023-05-23
申请号:CN202211571588.7
申请日:2022-12-08
Applicant: 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心)
Abstract: 本申请提供了一种重组乙型流感病毒及其制备方法与应用,所述重组乙型流感病毒携带一谱系乙型流感病毒的重组非结构蛋白,所述重组非结构蛋白嵌合有另一谱系乙型流感病毒的重组血凝素蛋白。该重组乙型流感病毒可自主生长复制,能同时表达两种谱系乙型流感病毒株的HA蛋白,且插入的外源HA融合基因具有良好的遗传稳定性。本申请获得的重组乙型流感病毒可作为乙型流感二价疫苗的候选毒株,具有重要的应用价值。
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