公开(公告)号：CN118621042A

公开(公告)日：2024-09-10

申请号：CN202410640326.4

申请日：2024-05-22

Applicant: 暨南大学 ,  广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 丁郁 ,  谢纪航 ,  赵一冰 ,  王涓 ,  吴清平 ,  尚玉婷 ,  汪智 ,  王峥峥 ,  余树波 ,  王彦涛 ,  薛亮

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/686 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/085 ,  C12R1/11

Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的分子靶标及其应用。所述分子靶标如SEQ ID NO.1‑5所示。本发明通过对已有的菌株分类信息进行真实性确证分析，对炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出了高度保守且特异的靶标序列SEQ ID NO.1‑5，并利用本组实验菌株进行验证和筛选，包括引物设计和筛选，分别以炭疽芽孢杆菌、蕈状芽孢杆菌、韦氏芽孢杆菌、巨大芽孢杆菌和致呕芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a荧光法实验，实现对5种蜡样芽孢杆菌类群菌种的准确鉴别。

公开(公告)号：CN118360422A

公开(公告)日：2024-07-19

申请号：CN202410640347.6

申请日：2024-05-22

Applicant: 暨南大学 ,  广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 丁郁 ,  谢纪航 ,  赵一冰 ,  王涓 ,  吴清平 ,  尚玉婷 ,  汪智 ,  王峥峥 ,  余树波 ,  王彦涛 ,  薛亮

IPC: C12Q1/689 ,  C12Q1/6858 ,  C12Q1/04 ,  C12N15/11 ,  C12R1/085 ,  C12R1/07

Abstract: 本发明公开了一种快速鉴定蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型SNP分子靶标及其应用。本发明收集蜡样芽孢杆菌族群菌株基因组，对已有菌株分类信息进行真实性确证分析，对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌标准菌株的全基因组序列根据CRISPR/Cas12a识别需求进行切片，通过比对筛选出在非编码区高度保守且存在SNP差异的可区分靶标序列NC‑2和ANN，并利用本组实验菌株进行验证和筛选区分蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的新型分子靶标。包括NC‑2和ANN的引物设计，引物对的筛选，分别以蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌为模板进行PCR‑CRISPR/Cas12a实验，实现对蜡样芽孢杆菌和苏云金芽孢杆菌的准确鉴别。

公开(公告)号：CN112961805A

公开(公告)日：2021-06-15

申请号：CN202110309262.6

申请日：2021-03-23

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 杨小鹃 ,  吴诗 ,  吴清平 ,  张菊梅 ,  蔡淑珍 ,  王涓 ,  曾海燕 ,  杨诗沅 ,  柏建玲 ,  余树波 ,  杨润时

IPC: C12N1/20 ,  C12Q1/02 ,  C12R1/42

Abstract: 本发明涉及耐药菌株技术领域，尤其涉及一种喹诺酮类药物耐药基因gyrA和parE同时发生突变的鼠伤寒沙门菌及其应用。本发明的鼠伤寒沙门菌，同时携带二个喹诺酮类药物耐药突变位点，所述二个喹诺酮类药物耐药突变位点分别为：gyrA基因编码产物的第83位的丝氨酸突变为苯丙氨酸；parE基因编码产物的第333位的苏氨酸突变为异亮氨酸。这些突变位点导致沙门菌对喹诺酮类药物表现为耐药或中介耐药。鉴于此，本发明的沙门菌可做为筛选新型抗菌药物的模型材料，具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN118366543A

公开(公告)日：2024-07-19

申请号：CN202410640312.2

申请日：2024-05-22

Applicant: 暨南大学 ,  广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 丁郁 ,  谢纪航 ,  赵一冰 ,  王涓 ,  吴清平 ,  尚玉婷 ,  汪智 ,  王峥峥 ,  余树波 ,  王彦涛 ,  薛亮

IPC: G16B20/00 ,  G16B50/00 ,  G16B30/10 ,  G16B10/00 ,  C12Q1/6869 ,  C12Q1/04 ,  C12R1/085

Abstract: 本发明公开了一种基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法。包括原始cgcMLST特征基因组集的构建、获取有效cgcMLST特征基因、获取有效cgcMLST特征基因组合、获取细菌样本全基因组信息、评价基于cgcMLST的蜡样芽孢杆菌类群新型分型方法的分辨率。本发明相比现有技术实现具有以下特点：实现对蜡样芽孢杆菌类群cgcMLST分辨率的评估，验证cgcMLST能对蜡样芽孢杆菌类群有效分型，解决现有MLST对亲缘关系近的蜡样芽孢杆菌类群菌株分型较差的问题。在分析198个实际样品时，较rMLST效率提升约99.17％，能够更有效的鉴定蜡样芽孢杆菌类群菌株，对食品安全和公共卫生工作至关重要。

公开(公告)号：CN112961805B

公开(公告)日：2022-05-20

申请号：CN202110309262.6

申请日：2021-03-23

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 杨小鹃 ,  吴诗 ,  吴清平 ,  张菊梅 ,  蔡淑珍 ,  王涓 ,  曾海燕 ,  杨诗沅 ,  柏建玲 ,  余树波 ,  杨润时

IPC: C12N1/20 ,  C12Q1/02 ,  C12R1/42

Abstract: 本发明涉及耐药菌株技术领域，尤其涉及一种喹诺酮类药物耐药基因gyrA和parE同时发生突变的鼠伤寒沙门菌及其应用。本发明的鼠伤寒沙门菌，同时携带二个喹诺酮类药物耐药突变位点，所述二个喹诺酮类药物耐药突变位点分别为：gyrA基因编码产物的第83位的丝氨酸突变为苯丙氨酸；parE基因编码产物的第333位的苏氨酸突变为异亮氨酸。这些突变位点导致沙门菌对喹诺酮类药物表现为耐药或中介耐药。鉴于此，本发明的沙门菌可做为筛选新型抗菌药物的模型材料，具有良好的应用前景。

公开(公告)号：CN113219115A

公开(公告)日：2021-08-06

申请号：CN202110541420.0

申请日：2021-05-18

Applicant: 广东省科学院微生物研究所(广东省微生物分析检测中心)

Inventor： 吴清平 ,  陈敏玲 ,  丁郁 ,  王涓 ,  张菊梅 ,  张俊卉 ,  周桓 ,  余树波 ,  陈谋通 ,  薛亮 ,  叶青华 ,  韦献虎 ,  张友雄

IPC: G01N30/06 ,  G01N30/72

Abstract: 本发明公开了一种基于MALDI‑TOFMS的蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌快速鉴定方法。它是以50S核糖体蛋白L30、50S核糖体蛋白L31typeB和30S核糖体蛋白S20作为特征蛋白。本发明利用蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的全基因组测序信息指导MALDI‑TOFMS特征峰的筛选和鉴定，获得能准确区分蜡样芽胞杆菌和苏云金芽胞杆菌的MALDI‑TOFMS特征峰，结果准确可靠，为MALDI‑TOFMS区分近缘物种提供思路。