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公开(公告)号:CN108893467B
公开(公告)日:2022-02-15
申请号:CN201810644193.2
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种GI.1型札幌病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明针对GI.1型札幌病毒基因群,根据其基因组特征采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和一条5'端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GI.1型札幌病毒基因组全长序列。在优化反应条件下,六组扩增引物的灵敏度均能达到或超过常规检测引物;将该扩增引物应用于实际检出样本,获得了我国GI.1型札幌病毒样本的基因组序列。本发明可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有札幌病毒检测需求的机构以及相应的科研领域。
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公开(公告)号:CN111019908A
公开(公告)日:2020-04-17
申请号:CN201911285834.0
申请日:2019-12-13
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12N7/00 , C12Q1/6806 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种从牡蛎中高效提取诺如病毒的样本高通量前处理方法及试剂盒。a、采集待检测病毒污染的牡蛎样本,以单个牡蛎为检测对象,冲洗外壳后,解剖取其消化腺组织,并称重;b、按每0.15g消化腺组织置于2.0mL离心管中,加入1.2mL的病毒提取液进行匀浆操作,然后补齐提取液体积,混匀;c、将混匀后的匀浆液,置于37℃下300r/min转速振荡孵育25min,60℃下孵育5min;d、孵育后液体12000r/min离心5min,取上清液,在上清液中加入上清液1/2体积的PEG病毒浓缩液,混匀后室温静置5min;e、静置后溶液12000r/min下离心10min,弃上清后,沉淀用140μl病毒复溶液重悬。本发明不但能够针对单个牡蛎样本进行前处理操作,而且充分地提取出了牡蛎中的病毒颗粒,从而显著性提高了病毒回收率。
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公开(公告)号:CN108796129A
公开(公告)日:2018-11-13
申请号:CN201810646126.4
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/93
CPC classification number: C12Q1/701 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2521/107
Abstract: 本发明公开了一种GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明基于GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组所包含的三个开放阅读框,采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六对扩增引物和两条基因组两端的测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GI.Pb/GI.6型诺如病毒基因组序列。利用该引物对GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组进行扩增和测序的方法具有操作简单、周期短、成本低、灵敏度高等特点。本发明可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求的机构以及相应的科学研究领域。
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公开(公告)号:CN111019908B
公开(公告)日:2022-10-14
申请号:CN201911285834.0
申请日:2019-12-13
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12N7/00 , C12Q1/6806 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种从牡蛎中高效提取诺如病毒的样本高通量前处理方法及试剂盒。a、采集待检测病毒污染的牡蛎样本,以单个牡蛎为检测对象,冲洗外壳后,解剖取其消化腺组织,并称重;b、按每0.15g消化腺组织置于2.0mL离心管中,加入1.2mL的病毒提取液进行匀浆操作,然后补齐提取液体积,混匀;c、将混匀后的匀浆液,置于37℃下300r/min转速振荡孵育25min,60℃下孵育5min;d、孵育后液体12000r/min离心5min,取上清液,在上清液中加入上清液1/2体积的PEG病毒浓缩液,混匀后室温静置5min;e、静置后溶液12000r/min下离心10min,弃上清后,沉淀用140μl病毒复溶液重悬。本发明不但能够针对单个牡蛎样本进行前处理操作,而且充分地提取出了牡蛎中的病毒颗粒,从而显著性提高了病毒回收率。
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公开(公告)号:CN108796129B
公开(公告)日:2021-09-03
申请号:CN201810646126.4
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/93
Abstract: 本发明公开了一种GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组扩增引物和扩增方法。本发明基于GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组所包含的三个开放阅读框,采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六对扩增引物和两条基因组两端的测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GI.Pb/GI.6型诺如病毒基因组序列。利用该引物对GI.Pb/GI.6重组型诺如病毒基因组进行扩增和测序的方法具有操作简单、周期短、成本低、灵敏度高等特点。本发明可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求的机构以及相应的科学研究领域。
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公开(公告)号:CN108796130B
公开(公告)日:2021-08-17
申请号:CN201810646146.1
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种GII.2型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明基于GII.2型诺如病毒基因组所包含的三个开放阅读框,采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.2型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.2型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。
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公开(公告)号:CN108823331A
公开(公告)日:2018-11-16
申请号:CN201810646156.5
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种GII.6型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明针对GII.6型诺如病毒基因组特征采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT-PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.6型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.6型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。
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公开(公告)号:CN108796130A
公开(公告)日:2018-11-13
申请号:CN201810646146.1
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12N15/11
CPC classification number: C12Q1/701 , C12Q1/6869 , C12Q2531/113 , C12Q2535/122
Abstract: 本发明公开了一种GII.2型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明基于GII.2型诺如病毒基因组所包含的三个开放阅读框,采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.2型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.2型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。
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公开(公告)号:CN108796128A
公开(公告)日:2018-11-13
申请号:CN201810646112.2
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
IPC: C12Q1/70 , C12Q1/6869 , C12Q1/686 , C12N15/11 , C12R1/93
CPC classification number: C12Q1/701 , C12Q1/686 , C12Q1/6869 , C12Q2521/107
Abstract: 本发明公开了一种GII.8型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明针对GII.8型诺如病毒基因组特征采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.8型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.8型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。
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公开(公告)号:CN108823331B
公开(公告)日:2021-08-13
申请号:CN201810646156.5
申请日:2018-06-21
Applicant: 广东省微生物研究所(广东省微生物分析检测中心) , 广东环凯微生物科技有限公司
Abstract: 本发明公开了一种GII.6型诺如病毒基因组的扩增引物和扩增方法。本发明针对GII.6型诺如病毒基因组特征采用了“4+1+1”的分段扩增策略,在保守区域设计了六组扩增引物和两条基因组末端测序引物,以目标病毒RNA为模板进行RT‑PCR扩增与测序,再通过拼接比对,获得GII.6型诺如病毒基因组序列。将该扩增方法应用于实际检出样本,成功获得我国来源的GII.6型诺如病毒基因组序列。本发明方法具有操作简单、周期短、易推广等优点,可广泛应用于医疗卫生、检验检疫等具有诺如病毒检测需求及相应的科研领域。
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