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发明公开
基于多重邻近性融合的lncRNA与药物抗性关联预测方法审中-实审

公开(公告)号：CN118553312A

公开(公告)日：2024-08-27

申请号：CN202410578811.3

申请日：2024-05-11

Applicant: 广东工业大学

Inventor： 孙宇平 , 谢文显 , 凌捷 , 柳毅

IPC: G16B40/00 , G16B15/30 , G16C20/50 , G16C20/70

Abstract: 本发明提供一种基于多重邻近性融合的lncRNA与药物抗性关联预测方法，包括构建lncRNA‑药物抗性关联数据集；利用k‑mers和RDKit对关联数据集进行处理；将lncRNA和药物的高级特征进行拼接处理；构建lncRNA‑药物抗性异构网络；通过元路径对lncRNA‑药物抗性异构网络进行全局结构邻近性量化，得到重构的异构网络；对lncRNA‑药物抗性异构网络进行局部结构邻近性的量化；预测lncRNA‑药物抗性潜在关联。本发明从挖掘数据的各项特性出发，利用相关方法工具量化提取数据的多重邻近性，最后融合各项特性以有效提高预测效果；本发明预测准确率高，AUC值为0.913，AUPR值为0.921。

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