公开(公告)号：CN117153267A

公开(公告)日：2023-12-01

申请号：CN202311138714.4

申请日：2023-09-05

Applicant: 安徽农业大学

Inventor： 赵俊 ,  岳振宇 ,  高皖陵 ,  蒋颖慧

IPC: G16B40/00 ,  G16B35/20 ,  G06N3/045

Abstract: 本发明涉及猪源抗菌肽预测，具体涉及一种基于BERT模型的猪源抗菌肽预测方法，采集猪的生物样本，确定猪源抗菌肽的氨基酸序列；对BERT模型进行模型训练，并将采集数据输入训练好的BERT模型中进行预测；从代表性基因组中预测sORFs序列；筛选出蛋白质组学数据中潜在的c_AMPs序列；筛选出候选猪源抗菌肽，并进一步进行抗耐多药细菌的功效试验；本发明提供的技术方案能够有效克服现有技术所存在的不能对猪源抗菌肽进行准确、高效预测的缺陷。

公开(公告)号：CN117153293A

公开(公告)日：2023-12-01

申请号：CN202311138715.9

申请日：2023-09-05

Applicant: 安徽农业大学

Inventor： 赵俊 ,  岳振宇 ,  蒋颖慧 ,  胡航 ,  高皖陵

IPC: G16C20/50 ,  G16C20/70 ,  G16B15/30 ,  G06N5/025

Abstract: 本发明涉及药物筛选，具体涉及一种基于知识图谱的抗寄生虫疾病药物筛选方法，构建包含药物、基因、疾病三个节点的知识图谱；使用知识图谱嵌入模型KGE学习知识图谱中实体和关系的低维表示；结合知识图谱嵌入模型KGE提取出的异质信息，以及分子摩尔指纹和蛋白质描述符表示的结构信息，得到相应的药物筛选预测结果；本发明提供的技术方案能够有效克服现有技术所存在的药物筛选结果不够准确，筛选效果较差的缺陷。