3,8’’-联芹菜甙元在制备蛋白质N-乙酰葡萄糖胺修饰抑制剂中的应用

    公开(公告)号:CN109394756A

    公开(公告)日:2019-03-01

    申请号:CN201811010308.9

    申请日:2018-08-31

    Abstract: 本发明公开了3,8”-联芹菜甙元在制备蛋白质N-乙酰葡萄糖胺修饰抑制剂中的应用,3,8”-联芹菜甙元作用受体为N-乙酰葡萄糖胺转移酶;3,8”-联芹菜甙元通过与UDP结合口袋内His920,Thr922、Gln839、Phf837和Ala896形成氢键,进而占据N-乙酰葡萄糖胺转移酶的UDP结合口袋,抑制N-乙酰葡萄糖胺转移酶活性。通过体外及细胞内的OGT抑制活性分析发现,3,8”-联芹菜甙元具有较好的OGT抑制活性,能够有效抑制蛋白质的O-GlcNAc修饰。同时3,8”-联芹菜甙元不会影响细胞内蛋白质的其他糖基化修饰,说明3,8”-联芹菜甙元是特异性OGT抑制剂。

    基于糖代谢标记获得O-GlcNAc修饰转录因子结合染色质DNA序列的方法

    公开(公告)号:CN111521774A

    公开(公告)日:2020-08-11

    申请号:CN202010295576.0

    申请日:2020-04-15

    Abstract: 本发明公开了基于糖代谢标记获得O‑GlcNAc修饰转录因子结合染色质DNA序列的方法,包括利用叠氮标记的糖探针将细胞内所有O‑GlcNAc修饰转录因子标记上叠氮分子。通过甲醛交联,酶解超声获得叠氮标记的O‑GlcNAc修饰转录因子‑染色质片段。然后经过Click反应将生物素连接到叠氮标记的转录因子和染色质上,利用链霉亲和素磁珠与生物素亲和沉淀转录因子染色质复合物。最后解交联获得O‑GlcNAc修饰转录因子结合的染色质DNA。本发明首次开发了获得全基因组范围O‑GlcNAc修饰转录因子结合染色质DNA的方法,该方法特异性高、成本低,且制备得到的O‑GlcNAc糖转录因子结合的DNA样品可直接用于PCR检测或者扩增,构建DNA文库。

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