一种无创孕中母系亲缘关系鉴定方法

    公开(公告)号:CN117867136A

    公开(公告)日:2024-04-12

    申请号:CN202410078919.6

    申请日:2024-01-19

    Abstract: 本发明涉及基因检测领域,特别是涉及一种无创孕中母系亲缘关系鉴定方法,所述鉴定方法包括如下步骤:1)将待测家系gDNA和cfDNA共有的STR位点称为总有效位点,该位点的数量记为A;2)针对每个STR位点,将cfDNA独有的分型称为小信号,保留包含小信号且小信号reads数占比为0.02‑0.15的STR位点,将保留的STR位点中每个STR位点的小信号的种类记为B;3)将步骤2)中包含B>1的STR位点的数量记为C,将总有效位点数量A和C的比值C/A与线性回归模型的临界值X进行比较,若C/A<X,判定待测家系支持母系亲缘关系,若C/A>X,判定待测家系不支持母系亲缘关系。本发明仅使用孕母的外周血样本进行检测,无需收集额外的家系样本,检测流程简便,准确率高。

    一种克服微量细胞扩增等位基因脱扣的方法

    公开(公告)号:CN116004779A

    公开(公告)日:2023-04-25

    申请号:CN202211415939.5

    申请日:2022-11-12

    Abstract: 本发明公开了一种克服微量细胞扩增等位基因脱扣的方法,包括以下步骤:对微量细胞进行基因组核酸扩增;对所述扩增产物进行全基因组建库;用杂交捕获探针对构建的文库进行杂交和靶向捕获;将杂交捕获的文库进行测序,并分析各SNP位点的等位基因突变频率和测序深度;对突变频率低于20%的SNP位点设计至少一对引物和一条抑制探针,用于进行抑制探针置换扩增反应;将抑制探针置换扩增产物进行测序,得到对脱扣等位基因的富集结果。本发明还公开了一种克服微量细胞扩增等位基因脱扣的检测体系及其在制备植入前胚胎遗传学检测产品中的应用。本发明方法通过特异性富集突变序列,可对脱扣位置进行直接而准确的富集和检测,显著降低PGT‑M检测中的脱扣现象。

    实现基因组拷贝数变异自动化解读的方法

    公开(公告)号:CN119229960A

    公开(公告)日:2024-12-31

    申请号:CN202411226852.2

    申请日:2024-09-03

    Abstract: 本发明公开了一种实现基因组拷贝数变异自动化解读的方法,包括以下步骤:获取ChatGLM‑6B的大语言模型;建立基因组拷贝数变异检测结果解读数据集,并对该数据脱敏,纠偏,规范化,以及转换为训练数据;使用低秩适应算法对所述大语言模型进行调整学习,使该大语言模型获取针对拷贝数变异结果报告解读能力;在调整学习的大语言模型中,设计多个提示词得到相应的输入‑输出对,人工对齐该输入‑输出对,用强化学习算法对所述模型进行二次调整;产生新的拷贝数变异检测结果解读数据集。本发明方法能对基因组拷贝数变异检测结果进行准确可靠的智能化解读,使CNV数据分析的工作效率大幅提升,也使临床遗传病例的诊断更加高效快捷,具有广阔的应用前景。

    一种检测低比例嵌合变异的方法
    7.
    发明公开

    公开(公告)号:CN115927593A

    公开(公告)日:2023-04-07

    申请号:CN202211415947.X

    申请日:2022-11-12

    Abstract: 本发明公开了一种检测低比例嵌合变异的方法,包括以下步骤:针对低比例嵌合变异的SNP位点设计至少一对引物和一条抑制探针,用于进行抑制探针置换扩增反应,所述抑制探针的寡核苷酸链与SNP位点对应的野生型DNA序列碱基互补结合,该抑制探针在野生型DNA序列上的互补结合位置,与所述引物在该野生型DNA序列上的互补结合位置部分重叠;将抑制探针置换扩增产物进行测序,得到低比例嵌合变异的检测结果。本发明还公开了一种检测低比例嵌合变异的反应体系及其在制备植入前胚胎遗传学检测产品中的应用。本发明方法具有富集放大突变序列的作用,能检测低至0.1%的嵌合变异,灵敏度大为提高,在临床诊断嵌合变异的病例中具有很好的应用前景。

    基因标志物在预测孕妇早产风险中的应用

    公开(公告)号:CN118056016A

    公开(公告)日:2024-05-17

    申请号:CN202180102281.X

    申请日:2021-12-08

    Abstract: 本发明提供了基因标志物在预测孕妇早产风险中的应用。本发明提供了一种用于预测孕妇胎膜早破早产及不明原因自发早产风险的方法,包括:获取来源于所述孕妇的生物样品中基因标志物的表达谱;基于基因标志物的表达谱,鉴别孕妇的胎膜早破早产风险及不明原因自发早产风险。本发明还提供了用于预测孕妇胎膜早破早产及不明原因自发早产风险的试剂盒和装置、以及孕妇早产风险预测模型的构建方法,还提供了涉及用于执行早产风险预测方法和模型构建方法的程序的存储介质和处理器。本发明通过基因标志物的表达谱与胎膜早破早产风险及不明原因自发早产的关联性,实现了对胎膜早破早产风险及不明原因自发早产的高特异性和高灵敏性的风险预测。

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