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公开(公告)号:CN112175954A
公开(公告)日:2021-01-05
申请号:CN202011118638.7
申请日:2020-10-19
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12P19/34
Abstract: 本发明提供了一种能够快速水解DNA的脱氧核酶。本发明通过引入特殊末端结构,设计了成环效率较高的DNA文库,进行筛选感应锌离子切割的实验,体外筛选到了另外的IV类脱氧核酶。设计相应的退化库,进行退化再筛选,从而获得快速水解切割DNA的IV脱氧核酶的突变体,从而满足不同DNA水解反应的需求。
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公开(公告)号:CN111500585A
公开(公告)日:2020-08-07
申请号:CN202010380418.5
申请日:2020-05-08
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12N15/115 , G01N33/569 , G01N33/53
Abstract: 本发明公开了一种用于靶向结肠癌的核酸适配体,其特征在于,所述核酸适配体的核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示的DNA片段,所述核酸适配体命名为HCT116-4-RFD。本发明筛选得到的核酸适配体无毒性、分子量小、渗透性好、易于合成与标记,可以精准、快速、牢固人源结肠癌HCT-116细胞裂解液特异蛋白的适配体。在生物医学检测、结肠癌生物标志物发现以及靶向治疗结肠癌方面将有重要的应用价值。
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公开(公告)号:CN110699407B
公开(公告)日:2023-08-01
申请号:CN201910989379.6
申请日:2019-10-17
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种借助I类和II类水解性脱氧核酶高效制备长单链DNA的方法。该方法主要包括设计并构建重组噬菌粒,获得噬菌粒环状单链DNA步骤,同时采用I类脱氧核酶和II类脱氧核酶突变体切割环状单链DNA,纯化回收酶切得到的所述长单链DNA。利用这两类能快速水解DNA的脱氧核酶,可代替限制性内切酶,低成本的实现对辅助噬菌体法制备出的DNA序列的特异性切割,大量、经济、高纯度制备任意长度和序列的单链DNA。
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公开(公告)号:CN110643606B
公开(公告)日:2023-06-13
申请号:CN201910989374.3
申请日:2019-10-17
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12P19/34
Abstract: 本发明公开了多个感应锌离子并能快速水解DNA的II类脱氧核酶突变体,II‑R1a,II‑R1b,II‑R1c,II‑R1d,所述突变体是基于II类脱氧核酶II‑R1的序列,设计“退化”的DNA文库,利用指数富集的配体系统进化技术,体外筛选分离获得的切割位点处碱基分别为G、A、T、C时,水解DNA活性强的II类脱氧核酶突变体。本发明的II类脱氧核酶突变体II‑R1a在50℃下切割反应速率最快,反应1小时切割效率可达80%。
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公开(公告)号:CN112111544A
公开(公告)日:2020-12-22
申请号:CN202011011345.9
申请日:2020-09-23
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12P19/34
Abstract: 本发明提供了一种提高单链DNA连接效率的方法,在单链DNA的5’‑磷酸基末端和单链DNA的3’羟基末端设计二级结构,该二级结构通过末端核苷酸序列的互补配对的方式,将需要连接的单链DNA的5'‑PO4与3'‑OH之间的距离拉近,从而提高长片段DNA的成环效率及两个片段的连接效率。
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公开(公告)号:CN108315332A
公开(公告)日:2018-07-24
申请号:CN201810077122.9
申请日:2018-01-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12N15/115 , C12N15/113 , C12Q1/6844 , C12Q1/34 , G01N33/53
Abstract: 本发明公开一种检测硫胺素焦磷酸的RNA传感器,包括特异感应硫胺素焦磷酸的RNA适配体、连接段RNA和锤头状核酶,其中RNA适配体通过连接段RNA与锤头状核酶连接,当RNA适配体感应到硫胺素焦磷酸时,触发锤头状核酶的自剪切;本发明还公开了一种包含本发明RNA传感器的试剂盒及检测硫胺素焦磷酸的方法;本发明的RNA传感器检测硫胺素焦磷酸灵敏度高、能够对硫胺素焦磷酸进行定性和定量检测。
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公开(公告)号:CN113046353B
公开(公告)日:2024-02-06
申请号:CN202110364792.0
申请日:2021-04-02
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
IPC: C12N15/113 , C12N15/10 , G01N33/569 , G01N33/574
Abstract: 本发明公开了一种特异感应三阴性乳腺癌的脱氧核酶探针及筛选方法。本发明通过“对冲抵消”的差异筛选策略,在目标分子未知的情况下,获得了特异感应TNBC细胞系MDA‑MB‑231胞外代谢物的脱氧核酶探针。该探针具有识别速度快、特异性好的特点,为后续开发三阴性乳腺癌快速诊断提供新思路。
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公开(公告)号:CN108315332B
公开(公告)日:2022-02-18
申请号:CN201810077122.9
申请日:2018-01-26
Applicant: 复旦大学附属中山医院
IPC: C12N15/115 , C12N15/113 , C12Q1/6844 , C12Q1/34 , G01N33/53
Abstract: 本发明公开一种检测硫胺素焦磷酸的RNA传感器,包括特异感应硫胺素焦磷酸的RNA适配体、连接段RNA和锤头状核酶,其中RNA适配体通过连接段RNA与锤头状核酶连接,当RNA适配体感应到硫胺素焦磷酸时,触发锤头状核酶的自剪切;本发明还公开了一种包含本发明RNA传感器的试剂盒及检测硫胺素焦磷酸的方法;本发明的RNA传感器检测硫胺素焦磷酸灵敏度高、能够对硫胺素焦磷酸进行定性和定量检测。
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公开(公告)号:CN113740535A
公开(公告)日:2021-12-03
申请号:CN202010479956.X
申请日:2020-05-29
Applicant: 复旦大学
IPC: G01N33/574 , G01N33/543 , C12N15/10
Abstract: 本发明属生物医药技术领域,涉及检测肝肿瘤组织豪猪音配体的方法,具体涉及基于适配体生物传感技术检测肝肿瘤组织豪猪音配体的方法,本方法包括豪猪音配体的DNA适配体的筛选,建立基于适配体高灵敏特异方法以及微芯片技术检测豪猪音配体。本方法测定肝癌组织中SHh的阳性率与特异性与用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测结果相当,与癌旁组织的差异显著,其检测特异性和阳性率高,与ELISA相比,方法简单、耗时缩短、操作简便、批次重复性好,结合微流控装置可建成实时检测装置。本发明为监测药物敏感性和进展、预测包括HCC在内的恶性肿瘤的预后提供了手段。
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公开(公告)号:CN111870581A
公开(公告)日:2020-11-03
申请号:CN202010773498.0
申请日:2020-08-04
Applicant: 复旦大学附属肿瘤医院
Abstract: 本发明公开了一种利用单链DNA纳米结构辅助分选脂质体的方法,该方法利用胆固醇修饰的单链DNA纳米结构,将其与脂质体连接形成这脂质体复合体,通过碘克沙醇梯度密度离心分出不同的组分,在不同的组分中最终得到大小均一的脂质体库。同时,本发明还提供了一种脂质体复合体,利用该复合体可以有效的进行脂质体不同大小的分选。本发明中ssDNs辅助分选技术容易产生平均直径约为40-140nm的脂质体,从而为系统探索与ssDNs包覆的脂质体被活细胞吸收有关的大小和形状提供了一个有吸引力的平台。
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