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公开(公告)号：CN114728871B
公开(公告)日：2024-12-27
申请号：CN202080081623.X
申请日：2020-10-28
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 本公开提供了微生物有机体，其不需要的副产物(例如丙酮酸‑、CO2‑、TCA‑衍生副产物；乙酸；乙醇；和/或丙氨酸)的产生降低，以增强通过乙酰‑CoA的碳通量，这可以增加乙酰‑CoA衍生化合物(例如1,3‑BDO、MMA和(3R)‑羟基丁基(3R)‑羟基丁酸酯或任何其他乙酰‑CoA衍生化合物)以及由这些化合物中的任何化合物制备的产物的产生。还提供了一种或多种编码可以降低不需要的副产物产生的酶(例如醛脱氢酶、乙酰‑CoA合酶、D‑氨基酸脱氢酶、丙氨酸消旋酶和/或柠檬酸合酶)的外源核酸，和/或基因(例如乙酰乳酸合酶)中发生的一种或多种导致不需要的副产物产生降低的基因衰减。本公开还提供了外源核酸和基因缺失的各种组合。还提供了制备和使用上述微生物有机体、外源基因、基因衰减和组合的方法，包括培养细胞的方法和产生各种产物的方法。
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公开(公告)号：CN118064458A
公开(公告)日：2024-05-24
申请号：CN202410289032.1
申请日：2018-03-29
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： 凯文·霍夫 , 卡拉·安·特蕾西韦尔 , 陈奎 , 迈克尔·库钦斯卡斯 , H·纳卡拉占
Abstract: 本申请涉及3‑羟基丁酰基‑CoA脱氢酶变体以及使用方法。本公开内容提供了硫解酶和3‑羟基丁酰基‑CoA脱氢酶的多肽变体，编码它们的核酸、包含所述核酸的载体，以及包含所述多肽变体和/或硫解酶、所述核酸和/或所述载体的细胞。本公开内容还提供了制造和使用它们的方法，包括培养细胞的方法，以及生产各种产物的方法，所述产品包括3‑羟基丁酰基‑CoA(3‑HB‑CoA)、3‑羟基丁醛(3‑HBal)、3‑羟基丁酸(3‑HB)、1,3‑丁二醇(1,3‑BDO)以及其酯和酰胺，以及从任何这些制成的产物。
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公开(公告)号：CN116096869A
公开(公告)日：2023-05-09
申请号：CN202180039402.0
申请日：2021-04-23
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 本发明提供了一种工程化羧酸还原酶(CAR)酶、编码CAR酶的核酸以及包含编码CAR的外源核酸、工程化转氨酶(TA)酶和/或六亚甲基二胺(HMD)转氨酶(TA2)酶的非天然存在的微生物。本发明提供了一种具有1,6‑己二醇(HDO)途径的非天然存在的微生物，所述途径具有以足以产生6‑氨基己酸半醛、HDO或两者的量表达的HDO途径酶。本发明还提供了一种具有HMD途径的非天然存在的微生物，所述途径具有以足以产生6‑氨基己酸半醛、HMD或两者的量表达的HMD途径酶。本发明另外提供了生物衍生的HMD、6‑氨基己酸半醛和/或HDO，和用于产生生物衍生的HMD、6‑氨基己酸半醛和/或HDO的方法。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN110691847A
公开(公告)日：2020-01-14
申请号：CN201880036152.3
申请日：2018-03-29
Applicant: 基因组股份公司
Inventor： 凯文·霍夫 , 卡拉·安·特蕾西韦尔 , 陈奎 , 迈克尔·库钦斯卡斯 , H·纳卡拉占
Abstract: 本公开内容提供了硫解酶和3-羟基丁酰基-CoA脱氢酶的多肽变体，编码它们的核酸、包含所述核酸的载体，以及包含所述多肽变体和/或硫解酶、所述核酸和/或所述载体的细胞。本公开内容还提供了制造和使用它们的方法，包括培养细胞的方法，以及生产各种产物的方法，所述产品包括3-羟基丁酰基-CoA(3-HB-CoA)、3-羟基丁醛(3-HBal)、3-羟基丁酸(3-HB)、1,3-丁二醇(1,3-BDO)以及其酯和酰胺，以及从任何这些制成的产物。
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公开(公告)号：CN114901815A
公开(公告)日：2022-08-12
申请号：CN202080090024.4
申请日：2020-10-22
Applicant: 基因组股份公司
Abstract: 本公开提供具有增加的诸如NADPH的辅因子的可用性的微生物生物体，以用于增加各种产物的产生，所述各种产物包括1，3‑BDO、MMA、(3R)‑羟基丁酸(3R)‑羟基丁基酯、氨基酸、3HB‑CoA、己二酸、己内酰胺、6‑ACA、HMDA或MAA，以及由这些中的任一种制成的产物。还提供一种或多种编码以足以增加NADPH可用性的量表达的酶的外源性核酸，其中所述外源性核酸包括ATP‑NADH激酶、pntAB、nadK和gapN中的一种或多种。还提供一种或多种在诸如NDH‑2的基因中发生的基因衰减，所述基因衰减导致NADPH与NADH的比率增加。本公开中还提供所述外源性核酸和基因缺失的各种组合。本公开还提供其制备和使用的方法，包括用于培养细胞以及用于所述各种产物的所述产生的方法。
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公开(公告)号：CN108026214A
公开(公告)日：2018-05-11
申请号：CN201680042415.2
申请日：2016-05-26
Inventor： S·J·卡勒 , 罗伯特·J·哈瑟尔贝克 , H·纳卡拉占 , 尤里·埃斯特拉达·戈维亚 , D·J·科赫 , 马特乌斯·施莱纳·加尔赛斯·罗佩斯 , 卢卡斯·彭德森·帕里奇
Abstract: 在一些替代实施方案中，提供了非天然或经遗传改造的乙烯基异构酶‑脱水酶，包括烯醇脱水酶、芳樟醇脱水酶和巴豆醇脱水酶。在一些替代实施方案中，提供了非天然或经遗传改造的多肽，其具有包含例如乙烯基异构酶‑脱水酶、烯醇脱水酶、芳樟醇脱水酶和/或巴豆醇脱水酶活性，或者其组合的活性。在一些替代实施方案中，还提供了编码本文所述多肽的非天然或经遗传改造核酸(多核苷酸)、其中包含或已包含本文所述核酸的表达或克隆载体，以及其中包含或已包含本文所述核酸的非天然或经遗传改造细胞。在一些替代实施方案中，还提供了制备不同有机化合物(包括甲基乙烯基甲醇和丁二烯)的方法。
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公开(公告)号：CN114728871A
公开(公告)日：2022-07-08
申请号：CN202080081623.X
申请日：2020-10-28
Applicant: 基因组股份公司
IPC: C07C31/20
Abstract: 本公开提供了微生物有机体，其不需要的副产物(例如丙酮酸‑、CO2‑、TCA‑衍生副产物；乙酸；乙醇；和/或丙氨酸)的产生降低，以增强通过乙酰‑CoA的碳通量，这可以增加乙酰‑CoA衍生化合物(例如1,3‑BDO、MMA和(3R)‑羟基丁基(3R)‑羟基丁酸酯或任何其他乙酰‑CoA衍生化合物)以及由这些化合物中的任何化合物制备的产物的产生。还提供了一种或多种编码可以降低不需要的副产物产生的酶(例如醛脱氢酶、乙酰‑CoA合酶、D‑氨基酸脱氢酶、丙氨酸消旋酶和/或柠檬酸合酶)的外源核酸，和/或基因(例如乙酰乳酸合酶)中发生的一种或多种导致不需要的副产物产生降低的基因衰减。本公开还提供了外源核酸和基因缺失的各种组合。还提供了制备和使用上述微生物有机体、外源基因、基因衰减和组合的方法，包括培养细胞的方法和产生各种产物的方法。
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公开(公告)号：CN108026214B
公开(公告)日：2021-03-02
申请号：CN201680042415.2
申请日：2016-05-26
Inventor： S·J·卡勒 , 罗伯特·J·哈瑟尔贝克 , H·纳卡拉占 , 尤里·埃斯特拉达·戈维亚 , D·J·科赫 , 马特乌斯·施莱纳·加尔赛斯·罗佩斯 , 卢卡斯·彭德森·帕里奇
IPC: C12N15/60
Abstract: 在一些替代实施方案中，提供了非天然或经遗传改造的乙烯基异构酶‑脱水酶，包括烯醇脱水酶、芳樟醇脱水酶和巴豆醇脱水酶。在一些替代实施方案中，提供了非天然或经遗传改造的多肽，其具有包含例如乙烯基异构酶‑脱水酶、烯醇脱水酶、芳樟醇脱水酶和/或巴豆醇脱水酶活性，或者其组合的活性。在一些替代实施方案中，还提供了编码本文所述多肽的非天然或经遗传改造核酸(多核苷酸)、其中包含或已包含本文所述核酸的表达或克隆载体，以及其中包含或已包含本文所述核酸的非天然或经遗传改造细胞。在一些替代实施方案中，还提供了制备不同有机化合物(包括甲基乙烯基甲醇和丁二烯)的方法。
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