公开(公告)号：CN118888167A

公开(公告)日：2024-11-01

申请号：CN202410925335.8

申请日：2024-07-11

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 金佳欢 ,  李杰

IPC: G16H70/40 ,  G16C20/30 ,  G16C20/70 ,  G06F18/22

Abstract: 基于多尺度药物信息生成的强负样本预测药物对相互作用的方法，涉及生物信息技术领域。为解决现有技术中，药物相互作用判断仅依赖经过实验的数据，在随机负采样选择的弱负样本上训练模型时表现出较差的鲁棒性和预测性能；受限于数据的偏态分布，大多数DDI预测方法在冷启动设置下某些相互作用类别的预测精度较差的问题，本发明提供的技术方案为：方法包括：学习药物知识图谱、药物结构和药物物理化学属性信息表示的步骤；根据所述药物多尺度信息表示，得到药物相似性矩阵，构建药物相似性网络的步骤；对所述药物相似性网络进行融合的步骤；对目标药物相互作用数据集生成强负样本的步骤。适合应用于药物与药物相互关系预测的工作中。

公开(公告)号：CN115312182A

公开(公告)日：2022-11-08

申请号：CN202210881157.4

申请日：2022-07-26

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 李杰 ,  金佳欢

IPC: G16H50/20 ,  G16H50/70 ,  G06F40/30 ,  G06F40/247

Abstract: 本发明提出了一种预测疫苗接种后不良反应转为严重不良反应风险的模型，基于疾病本体数据集的语义拓扑结构计算疾病相似度，并通过对疫苗接种后不良反应报告计算疾病的严重不良反应率，构建复杂疾病网络，对复杂疾病网络进行模块细粒度精准划分，使用启发式方法将复杂疾病网络划分为基础模块，再基于疾病的严重不良反应率和疾病之间的相似度得到优化后的模块，最后根据同一模块中种子疾病节点的严重不良反应率以及与其他疾病之间的相似度，计算患者接种某种疫苗后不良反应转为严重不良反应的风险评分；本发明能够对复杂疾病网络模块的细粒度精准划分，并且应用到预测疾病与新冠肺炎疫苗接种后不良反应转为严重不良反应风险上。

公开(公告)号：CN115312182B

公开(公告)日：2023-06-27

申请号：CN202210881157.4

申请日：2022-07-26

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 李杰 ,  金佳欢

IPC: G16H50/20 ,  G16H50/70 ,  G06F40/30 ,  G06F40/247

Abstract: 本发明提出了一种预测疫苗接种后不良反应转为严重不良反应风险的模型，基于疾病本体数据集的语义拓扑结构计算疾病相似度，并通过对疫苗接种后不良反应报告计算疾病的严重不良反应率，构建复杂疾病网络，对复杂疾病网络进行模块细粒度精准划分，使用启发式方法将复杂疾病网络划分为基础模块，再基于疾病的严重不良反应率和疾病之间的相似度得到优化后的模块，最后根据同一模块中种子疾病节点的严重不良反应率以及与其他疾病之间的相似度，计算患者接种某种疫苗后不良反应转为严重不良反应的风险评分；本发明能够对复杂疾病网络模块的细粒度精准划分，并且应用到预测疾病与新冠肺炎疫苗接种后不良反应转为严重不良反应风险上。

公开(公告)号：CN114168708B

公开(公告)日：2022-06-14

申请号：CN202111351440.8

申请日：2021-11-15

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 李杰 ,  李建勋 ,  金佳欢 ,  周理 ,  谢康 ,  熊伟 ,  王亚东

IPC: G06F16/33 ,  G06F16/335 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明提供一种基于多域特征的个性化生物通路检索方法。属于生物通路检索技术领域。为了提供一种快速、准确和个性化的检索生物通路的方法。该方法会依据用户的在线操作不断优化检索系统内置的排序器，向用户提供快速、准确和个性化的生物通路检索服务。该方法的关键操作是构建通路查询请求与相关通路文档构成的二元组的生物通路检索特征。生物通路检索特征主要包括面向生物通路的自然语言特征、生物通路拓扑特征和用户历史行为相似度特征。

公开(公告)号：CN114168708A

公开(公告)日：2022-03-11

申请号：CN202111351440.8

申请日：2021-11-15

Applicant: 哈尔滨工业大学

Inventor： 李杰 ,  李建勋 ,  金佳欢 ,  周理 ,  谢康 ,  熊伟 ,  王亚东

IPC: G06F16/33 ,  G06F16/335 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明提供一种基于多域特征的个性化生物通路检索方法。属于生物通路检索技术领域。为了提供一种快速、准确和个性化的检索生物通路的方法。该方法会依据用户的在线操作不断优化检索系统内置的排序器，向用户提供快速、准确和个性化的生物通路检索服务。该方法的关键操作是构建通路查询请求与相关通路文档构成的二元组的生物通路检索特征。生物通路检索特征主要包括面向生物通路的自然语言特征、生物通路拓扑特征和用户历史行为相似度特征。