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公开(公告)号：CN109988819A
公开(公告)日：2019-07-09
申请号：CN201910315777.X
申请日：2019-04-19
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6806 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种特异性接头分子标签及其在预测可变剪切中的应用，包含：核心序列；随机序列(N)n，N为随机序列，共n个；和反向互补序列；其中核心序列如SEQ ID NO.1/SEQ ID NO.2所示，反向互补序列如SEQ ID NO.3所示。本发明在转座酶包埋复合物上增加特异性接头分子标签，使cDNA片段在不同酶切位点上连接的接头分子标签序列不同，在测序数据拼接时，带相同分子标签的cDNA片段连接在一起，得出转录本序列，检测可变剪接事件。本发明保证了拼接的高度准确性，还原了转录本的真实情况，在拼接的时候即使出现外显子跳跃情况，也能准确进行拼接，从而获得更多的遗传信息，增加可变剪切预测的数量。
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公开(公告)号：CN113638055A
公开(公告)日：2021-11-12
申请号：CN202110906228.7
申请日：2020-05-22
Applicant: 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) , 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开一种制备双链RNA测序文库的方法，以及该方法在生物遗传分析中的应用；该方法包含1)随机打断：将待测双链RNA进行随机打断处理，得到双链RNA片段；2)任选地，末端修复：将步骤1)中得到的双链RNA片段进行末端修复，得到末端修复的双链RNA片段；3)连接接头：将步骤2)中的双链RNA片段与接头连接得到两端包含接头的双链RNA片段，所述接头包含；4)扩增及纯化：以步骤3)中两端包含接头的双链RNA片段为模板，扩增得到双链DNA产物并纯化，即为测序文库。本发明的文库构建方法简便快捷，更节省原料。
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公开(公告)号：CN109957562B
公开(公告)日：2019-12-06
申请号：CN201910166458.7
申请日：2019-03-06
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种快速构建转录组测序文库的方法及试剂盒，将DNA第一链反转录、DNA第二链反转录以及反转录形成的双链cDNA片段进行末端补平通过一个合成体系完成，所述合成体系包括cDNA合成缓冲液(cDNA synthesize buffer)和cDNA合成酶体系(cDNA synthesize Enzyme)。本发明所述方法将传统的3)第一链cDNA反转录；4)第二链cDNA反转录；5)纯化；6)双链cDNA片段末端补平四个步骤整合在一步完成，大大减少了建库步骤，缩短了建库时间。
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公开(公告)号：CN109957562A
公开(公告)日：2019-07-02
申请号：CN201910166458.7
申请日：2019-03-06
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C12N15/10 , C12Q1/6806 , C40B50/06
Abstract: 本发明公开了一种快速构建转录组测序文库的方法及试剂盒，将DNA第一链反转录、DNA第二链反转录以及反转录形成的双链cDNA片段进行末端补平通过一个合成体系完成，所述合成体系包括cDNA合成缓冲液(cDNA synthesize buffer)和cDNA合成酶体系(cDNA synthesize Enzyme)。本发明所述方法将传统的3)第一链cDNA反转录；4)第二链cDNA反转录；5)纯化；6)双链cDNA片段末端补平四个步骤整合在一步完成，大大减少了建库步骤，缩短了建库时间。
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公开(公告)号：CN108588202B
公开(公告)日：2019-06-04
申请号：CN201810455952.0
申请日：2018-05-14
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12N9/12
Abstract: 本发明公开一种单细胞全基因扩增方法，包括如下步骤：1)细胞样品分离为1‑10个细胞；2)单细胞进行裂解，然后加入基因扩增混合物和突变体Phi29 DNA聚合酶进行扩增反应；3)扩增产物进行片段化，纯化后测序；所述基因扩增混合物中包含5‑8mM MnCl2、0.5‑1mM Na2HPO4、50‑100ng牛血清白蛋白(BSA)或体积百分比0.1‑0.5％甘油中的一种或多种；所述突变体Phi29 DNA聚合酶氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明所述方法与传统的MDA扩增体系相比，进一步提高了均一性和覆盖度，可以精确地检测SNP，以及DNA拷贝数变异。可应用于胚胎植入前遗传学诊断和筛查。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN106754904A
公开(公告)日：2017-05-31
申请号：CN201611196752.5
申请日：2016-12-21
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
Abstract: 一种cDNA的特异性分子标签及其应用，该特异性分子标签包括：如SEQ ID NO.1所示的通用引物序列；如SEQ ID NO.2所示的转座酶接头序列P7；随机序列：(N)n，N为随机序列，共n个；和共有30个T碱的poly(T)序列，具体核苷酸序列如SEQ ID NO.3所。将特异性分子标签应用于cDNA建库中，在RNA逆转录成全长cDNA过程中，该特异性分子标签加在每一个cDNA的5`端，使每一个基因都是独一无二的，后续的信息分析可以根据该特异分子标签的序列量化样品中每一个基因。
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公开(公告)号：CN113638055B
公开(公告)日：2023-07-07
申请号：CN202110906228.7
申请日：2020-05-22
Applicant: 江苏省疾病预防控制中心(江苏省公共卫生研究院) , 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C40B50/06 , C12Q1/6869 , C12Q1/6806
Abstract: 本发明公开一种制备双链RNA测序文库的方法，以及该方法在生物遗传分析中的应用；该方法包含1)随机打断：将待测双链RNA进行随机打断处理，得到双链RNA片段；2)任选地，末端修复：将步骤1)中得到的双链RNA片段进行末端修复，得到末端修复的双链RNA片段；3)连接接头：将步骤2)中的双链RNA片段与接头连接得到两端包含接头的双链RNA片段，所述接头包含；4)扩增及纯化：以步骤3)中两端包含接头的双链RNA片段为模板，扩增得到双链DNA产物并纯化，即为测序文库。本发明的文库构建方法简便快捷，更节省原料。
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公开(公告)号：CN106754904B
公开(公告)日：2019-03-15
申请号：CN201611196752.5
申请日：2016-12-21
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
Abstract: 一种cDNA的特异性分子标签及其应用，该特异性分子标签包括：如SEQ ID NO.1所示的通用引物序列；如SEQ ID NO.2所示的转座酶接头序列P7；随机序列：(N)n，N为随机序列，共n个；和共有30个T碱的poly(T)序列，具体核苷酸序列如SEQ ID NO.3所。将特异性分子标签应用于cDNA建库中，在RNA逆转录成全长cDNA过程中，该特异性分子标签加在每一个cDNA的5`端，使每一个基因都是独一无二的，后续的信息分析可以根据该特异分子标签的序列量化样品中每一个基因。
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公开(公告)号：CN108588202A
公开(公告)日：2018-09-28
申请号：CN201810455952.0
申请日：2018-05-14
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
IPC: C12Q1/6869 , C12N15/11 , C12N9/12
Abstract: 本发明公开一种单细胞全基因扩增方法，包括如下步骤：1)细胞样品分离为1-10个细胞；2)单细胞进行裂解，然后加入基因扩增混合物和突变体Phi29 DNA聚合酶进行扩增反应；3)扩增产物进行片段化，纯化后测序；所述基因扩增混合物中包含5-8mM MnCl2、0.5-1mM Na2HPO4、50-100ng牛血清白蛋白(BSA)或体积百分比0.1-0.5％甘油中的一种或多种；所述突变体Phi29 DNA聚合酶氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明所述方法与传统的MDA扩增体系相比，进一步提高了均一性和覆盖度，可以精确地检测SNP，以及DNA拷贝数变异。可应用于胚胎植入前遗传学诊断和筛查。
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公开(公告)号：CN206298578U
公开(公告)日：2017-07-04
申请号：CN201621414480.7
申请日：2016-12-21
Applicant: 南京诺唯赞生物科技有限公司
Abstract: 本实用新型公开的全基因组扩增试剂盒，其包括盒体(2)和能够盖合在所述盒体上的盖体(1)，所述盒体(2)内部形成有用于放置容器的腔体，在所述腔体中设置有衬垫(3)，在所述衬垫(3)上设置有容器放置部，分别放置有装有phi29 DNA聚合酶的容器(4)、装有聚合反应缓冲液的容器(5)、装有缓冲液D的容器(6)、装有缓冲液N的容器(7)、装有DTT的容器(8)、装有PBS的容器(9)、装有ddH2O的容器(10)以及备用空管(11)。本实用新型的全基因组扩增试剂盒结构简单成本低，并且通过本实用新型的全基因组扩增试剂盒可以利用优化的Phi29 DNA聚合酶反应体系实现全基因组DNA的恒温扩增，具有非常高的覆盖度。
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